More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04070 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04070  elongation factor Ts  100 
 
 		 321 aa  645    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1609  translation elongation factor Ts  71.03 
 
 		 320 aa  459  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00132099  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0724  translation elongation factor Ts  67.6 
 
 		 320 aa  437  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  42.86 
 
 		 355 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  41.92 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1261  elongation factor Ts  44.61 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00427037  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1801  elongation factor Ts  44.01 
 
 		 350 aa  245  6e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.450992  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  44.75 
 
 		 279 aa  235  7e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1093  elongation factor Ts  39.77 
 
 		 358 aa  233  5e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0550  elongation factor Ts  43.5 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00242368  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 357 aa  225  8e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0548  elongation factor Ts  42.72 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1315  elongation factor Ts  42.5 
 
 		 357 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  42.9 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1831  elongation factor Ts  45.73 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0135802  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0839  elongation factor Ts  43.23 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0656173  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0106  elongation factor Ts  43.9 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2454  elongation factor Ts  41.85 
 
 		 342 aa  209  4e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000114512  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0802  elongation factor Ts  41.82 
 
 		 341 aa  204  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000434061  hitchhiker  0.00000000000000232724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  39.69 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  39.08 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  36.53 
 
 		 277 aa  186  5e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  37.04 
 
 		 276 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  37.61 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0378  elongation factor Ts  32.3 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  36.2 
 
 		 278 aa  170  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  36.47 
 
 		 275 aa  163  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  33.04 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  33.83 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  33.87 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  35.89 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  34.05 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  34.55 
 
 		 286 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  35.63 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  35.87 
 
 		 278 aa  155  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  32.72 
 
 		 278 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  34.95 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  31.89 
 
 		 293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  36.67 
 
 		 275 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  35.49 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  36.36 
 
 		 275 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  34.15 
 
 		 283 aa  153  4e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  34.95 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  35.47 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  32.34 
 
 		 288 aa  151  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  35.56 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  34.18 
 
 		 270 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  34.14 
 
 		 289 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  34.78 
 
 		 285 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  33.63 
 
 		 288 aa  149  8e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  33.44 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  32.44 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  31.85 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  33.93 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2352  elongation factor Ts  33.23 
 
 		 288 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000872397  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  34.65 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  35.28 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  31.46 
 
 		 286 aa  146  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  32.22 
 
 		 278 aa  146  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  33.23 
 
 		 292 aa  146  6e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  34.95 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  33.96 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  33.96 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  33.96 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  34.21 
 
 		 314 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  31.7 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  30.84 
 
 		 292 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  30.84 
 
 		 292 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  31.37 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  33.33 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  33.54 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  34.78 
 
 		 288 aa  142  7e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  31.29 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  34.66 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  34.04 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  34.13 
 
 		 291 aa  142  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  33.13 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  31.68 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  32.82 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1669  translation elongation factor Ts  34.65 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  32.53 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  30.98 
 
 		 292 aa  139  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  31.9 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  34.59 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  34.06 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  33.54 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  31.17 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  34.07 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  32.26 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  30.75 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0528  translation elongation factor Ts  30.03 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.101205  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  30.75 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2547  elongation factor Ts  31.79 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  31.46 
 
 		 290 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  32.51 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  32.51 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  32.51 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  32.51 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  31.48 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  32.51 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>