More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0627 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0627  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 263 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.897775  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  46.55 
 
 		 276 aa  194  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1005  translation elongation factor Ts  44.11 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  43.68 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  43.43 
 
 		 275 aa  189  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10130  elongation factor Ts  42.49 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  43.01 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  43.22 
 
 		 277 aa  185  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  44.44 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  41.16 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  42.7 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1485  translation elongation factor Ts  43.01 
 
 		 281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.485707  normal  0.476754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3242  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  43.88 
 
 		 270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  40.79 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  40.22 
 
 		 288 aa  178  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  41.99 
 
 		 293 aa  178  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  42.29 
 
 		 277 aa  178  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  40.86 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1048  elongation factor Ts  40.45 
 
 		 269 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0760308  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  42.55 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  44.01 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  40.3 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  44.37 
 
 		 275 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  39.25 
 
 		 286 aa  175  6e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 292 aa  175  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  40.22 
 
 		 288 aa  175  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  41.22 
 
 		 288 aa  175  8e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  37.15 
 
 		 288 aa  175  9e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  41.94 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  40.22 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  41.52 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  41.22 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  40.86 
 
 		 278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1975  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 274 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  41.09 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  37.29 
 
 		 311 aa  169  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1994  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 274 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2040  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 274 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  40.71 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2352  elongation factor Ts  40.3 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000872397  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 292 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 292 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  40.15 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2506  elongation factor Ts  41.13 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.346339 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  38.85 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4132  elongation factor Ts  42.09 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.367953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  41.03 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  41.03 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  41.03 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  38.32 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  40.66 
 
 		 293 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  40.66 
 
 		 293 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  40.66 
 
 		 293 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  40.66 
 
 		 293 aa  165  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  43.32 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  42.38 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  42.03 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  40.15 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  43.32 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  37.91 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  38.73 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  39.78 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  40.29 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  42.96 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  42.96 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  42.96 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  42.96 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  42.96 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  42.96 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  41.51 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  40 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3112  translation elongation factor Ts  41.58 
 
 		 274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959082  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  41.51 
 
 		 303 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  38.77 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  40.29 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  40.29 
 
 		 293 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  40.29 
 
 		 293 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  40.29 
 
 		 293 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  40.29 
 
 		 293 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  40.29 
 
 		 293 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  40.29 
 
 		 293 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  38.01 
 
 		 288 aa  162  7e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  41.67 
 
 		 291 aa  162  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  38.18 
 
 		 292 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  38.55 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  37.1 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  41.16 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  42.24 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  39.19 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  43.53 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  39.05 
 
 		 293 aa  158  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  37.19 
 
 		 288 aa  158  7e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  40.29 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  36.59 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  41.88 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  39.46 
 
 		 302 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  38.21 
 
 		 276 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0531  elongation factor Ts  36.2 
 
 		 286 aa  155  6e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>