More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1246 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1246  elongation factor Ts  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.794499  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1223  elongation factor Ts  93.12 
 
 		 220 aa  417  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16651  elongation factor Ts  80.28 
 
 		 218 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.521218 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08141  elongation factor Ts  80.09 
 
 		 218 aa  363  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119849  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0762  elongation factor Ts  79.26 
 
 		 218 aa  362  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.670282  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08151  elongation factor Ts  79.63 
 
 		 218 aa  362  4e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08301  elongation factor Ts  78.34 
 
 		 218 aa  359  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10091  elongation factor Ts  76.04 
 
 		 218 aa  357  5e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0158  elongation factor Ts  77.06 
 
 		 218 aa  354  5e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.496244  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07901  elongation factor Ts  78.14 
 
 		 218 aa  354  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.987366 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2531  elongation factor Ts  73.08 
 
 		 221 aa  328  4e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.339571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1152  translation elongation factor Ts  69.63 
 
 		 286 aa  321  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4235  elongation factor Ts  65.42 
 
 		 263 aa  303  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2579  elongation factor Ts  64.79 
 
 		 249 aa  300  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3527  elongation factor Ts  64.79 
 
 		 250 aa  300  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1160  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  63.08 
 
 		 219 aa  299  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237926 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49408  predicted protein  58.29 
 
 		 440 aa  261  6.999999999999999e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3212  translation elongation factor Ts  57.28 
 
 		 216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000140585  hitchhiker  0.0000000047581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5314  translation elongation factor Ts  56.34 
 
 		 218 aa  244  9e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0579  translation elongation factor Ts  56.72 
 
 		 202 aa  236  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1420  translation elongation factor Ts  51.87 
 
 		 218 aa  231  8.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0106114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1920  elongation factor Ts  52.43 
 
 		 216 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3708  elongation factor Ts  53.46 
 
 		 217 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0003434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1428  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  51.87 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000020519  normal  0.0754659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3732  elongation factor Ts  50 
 
 		 216 aa  226  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1251  elongation factor Ts  49.03 
 
 		 216 aa  222  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345397  hitchhiker  0.0000644664 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0883  elongation factor Ts  54.98 
 
 		 214 aa  222  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1486  elongation factor Ts  48.58 
 
 		 216 aa  221  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00196181 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0443  elongation factor Ts  50 
 
 		 215 aa  221  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000208997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2755  elongation factor Ts  48.58 
 
 		 216 aa  221  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0607  translation elongation factor Ts  52.79 
 
 		 201 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1977  elongation factor Ts  56.42 
 
 		 217 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1815  elongation factor Ts  52.76 
 
 		 204 aa  218  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299653  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1033  elongation factor Ts  52.02 
 
 		 203 aa  211  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048083  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1202  elongation factor Ts  50.51 
 
 		 198 aa  211  7e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0294  elongation factor Ts  48.36 
 
 		 219 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0475  translation elongation factor Ts  49.25 
 
 		 198 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000567359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0283  elongation factor Ts  47.89 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.975706  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0272  elongation factor Ts  47.89 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2923  translation elongation factor Ts  51.53 
 
 		 200 aa  208  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1132  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  51.52 
 
 		 198 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0565  elongation factor Ts  48.98 
 
 		 219 aa  204  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0743  translation elongation factor Ts  50.76 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000548814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1660  elongation factor Ts  48.53 
 
 		 204 aa  203  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000188674  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1005  elongation factor Ts  51.4 
 
 		 215 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000692768  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  58.49 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0786  elongation factor Ts  51.01 
 
 		 196 aa  198  5e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0294  elongation factor Ts  50.7 
 
 		 219 aa  197  7e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0828484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1187  elongation factor Ts  49.75 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000118419  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1268  elongation factor Ts  49.75 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.890354  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0956  translation elongation factor Ts  45.66 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4960  translation elongation factor Ts  48.47 
 
 		 198 aa  194  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1965  translation elongation factor Ts  50.53 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1779  translation elongation factor Ts  46.67 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0576  elongation factor Ts  53.3 
 
 		 197 aa  191  5e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000429292  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1781  translation elongation factor Ts  50 
 
 		 196 aa  190  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000010649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  55.48 
 
 		 313 aa  187  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0199  elongation factor Ts  48.48 
 
 		 197 aa  178  5.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000300429  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1162  translation elongation factor Ts  44.06 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1399  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  46.03 
 
 		 207 aa  168  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253635  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4502  translation elongation factor Ts  46.6 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3580  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42.08 
 
 		 204 aa  165  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3516  translation elongation factor Ts  43.5 
 
 		 200 aa  164  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3926  translation elongation factor Ts  45.45 
 
 		 176 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0719169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2018  translation elongation factor Ts  44.95 
 
 		 176 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666479  hitchhiker  0.00383006 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1720  translation elongation factor Ts  41.84 
 
 		 197 aa  155  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0376  elongation factor Ts  40.4 
 
 		 167 aa  149  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0834304  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0358  elongation factor Ts  40.4 
 
 		 167 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023974  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0526  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerisation  39.29 
 
 		 177 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00005849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_320  translation elongation factor Ts  40.1 
 
 		 167 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00206685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  37.63 
 
 		 311 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  67.71 
 
 		 307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  60.75 
 
 		 308 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  59.81 
 
 		 308 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  38.69 
 
 		 305 aa  124  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  38.69 
 
 		 305 aa  124  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  43.42 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  59.6 
 
 		 308 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  38.69 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  56.41 
 
 		 307 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1519  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerization  35.71 
 
 		 152 aa  123  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_7588  predicted protein  39.71 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.673567  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  54.21 
 
 		 294 aa  119  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  58.25 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  37.31 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  39.39 
 
 		 307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  59.14 
 
 		 310 aa  118  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  50.42 
 
 		 286 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  58.59 
 
 		 307 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  39.38 
 
 		 292 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  54.9 
 
 		 286 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  57.28 
 
 		 308 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  57.28 
 
 		 308 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  52.73 
 
 		 296 aa  114  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  39.38 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  58.42 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  55.34 
 
 		 307 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  55.56 
 
 		 312 aa  113  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2224  elongation factor Ts  57.58 
 
 		 310 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  48.72 
 
 		 307 aa  113  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>