More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1132 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1132  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2923  translation elongation factor Ts  77.55 
 
 		 200 aa  314  6e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0475  translation elongation factor Ts  60.91 
 
 		 198 aa  254  7e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000567359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3732  elongation factor Ts  56.92 
 
 		 216 aa  246  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2755  elongation factor Ts  58.46 
 
 		 216 aa  244  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1486  elongation factor Ts  58.46 
 
 		 216 aa  244  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00196181 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1815  elongation factor Ts  58.76 
 
 		 204 aa  243  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1920  elongation factor Ts  57.95 
 
 		 216 aa  242  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1251  elongation factor Ts  56.41 
 
 		 216 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345397  hitchhiker  0.0000644664 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1779  translation elongation factor Ts  54.87 
 
 		 210 aa  238  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3212  translation elongation factor Ts  56.41 
 
 		 216 aa  236  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000140585  hitchhiker  0.0000000047581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5314  translation elongation factor Ts  56.35 
 
 		 218 aa  235  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1420  translation elongation factor Ts  56.35 
 
 		 218 aa  235  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0106114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0607  translation elongation factor Ts  58.25 
 
 		 201 aa  234  5.0000000000000005e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928696  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0579  translation elongation factor Ts  54.82 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0743  translation elongation factor Ts  57.45 
 
 		 197 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000548814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1428  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  54.12 
 
 		 216 aa  232  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000020519  normal  0.0754659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1033  elongation factor Ts  54.64 
 
 		 203 aa  226  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048083  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1202  elongation factor Ts  54.12 
 
 		 198 aa  225  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1660  elongation factor Ts  57.22 
 
 		 204 aa  224  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000188674  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0565  elongation factor Ts  55.67 
 
 		 219 aa  224  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0283  elongation factor Ts  56.35 
 
 		 219 aa  222  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.975706  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0786  elongation factor Ts  52.58 
 
 		 196 aa  221  4e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1977  elongation factor Ts  58.88 
 
 		 217 aa  221  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032588  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4235  elongation factor Ts  55.5 
 
 		 263 aa  221  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0294  elongation factor Ts  55.84 
 
 		 219 aa  221  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0272  elongation factor Ts  55.84 
 
 		 219 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1965  translation elongation factor Ts  55.79 
 
 		 196 aa  220  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3708  elongation factor Ts  53.81 
 
 		 217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0003434  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1187  elongation factor Ts  54.64 
 
 		 199 aa  218  6e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000118419  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2531  elongation factor Ts  56.57 
 
 		 221 aa  217  8.999999999999998e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.339571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2579  elongation factor Ts  55.05 
 
 		 249 aa  216  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3527  elongation factor Ts  55.05 
 
 		 250 aa  216  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1268  elongation factor Ts  53.61 
 
 		 199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.890354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0443  elongation factor Ts  53.09 
 
 		 215 aa  215  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000208997  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1160  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  55.05 
 
 		 219 aa  215  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237926 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1781  translation elongation factor Ts  55.26 
 
 		 196 aa  215  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000010649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0883  elongation factor Ts  56.7 
 
 		 214 aa  214  7e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0576  elongation factor Ts  57.95 
 
 		 197 aa  213  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000429292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1005  elongation factor Ts  55.15 
 
 		 215 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000692768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1152  translation elongation factor Ts  54.55 
 
 		 286 aa  210  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1246  elongation factor Ts  51.52 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.794499  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1223  elongation factor Ts  51.27 
 
 		 220 aa  203  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0199  elongation factor Ts  55.15 
 
 		 197 aa  202  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000300429  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4960  translation elongation factor Ts  50.51 
 
 		 198 aa  202  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08301  elongation factor Ts  49.5 
 
 		 218 aa  198  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10091  elongation factor Ts  51 
 
 		 218 aa  197  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3516  translation elongation factor Ts  53.03 
 
 		 200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0762  elongation factor Ts  49 
 
 		 218 aa  194  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.670282  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08141  elongation factor Ts  49 
 
 		 218 aa  194  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119849  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16651  elongation factor Ts  48.48 
 
 		 218 aa  194  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.521218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0294  elongation factor Ts  54.31 
 
 		 219 aa  194  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0828484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08151  elongation factor Ts  48.5 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1162  translation elongation factor Ts  47.76 
 
 		 259 aa  189  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07901  elongation factor Ts  48.48 
 
 		 218 aa  187  9e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.987366 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0158  elongation factor Ts  48.48 
 
 		 218 aa  187  9e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.496244  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3580  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  47.26 
 
 		 204 aa  184  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  62.59 
 
 		 287 aa  184  9e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1720  translation elongation factor Ts  50 
 
 		 197 aa  182  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4502  translation elongation factor Ts  49.74 
 
 		 189 aa  178  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1399  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  45.21 
 
 		 207 aa  178  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253635  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49408  predicted protein  46.15 
 
 		 440 aa  174  8e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0956  translation elongation factor Ts  44.55 
 
 		 221 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  56.52 
 
 		 286 aa  169  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  56.52 
 
 		 286 aa  162  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0376  elongation factor Ts  46.15 
 
 		 167 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0834304  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0358  elongation factor Ts  46.15 
 
 		 167 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023974  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_320  translation elongation factor Ts  45.64 
 
 		 167 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00206685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  41.33 
 
 		 313 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0526  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerisation  41.84 
 
 		 177 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00005849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3926  translation elongation factor Ts  41.92 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0719169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2018  translation elongation factor Ts  40.5 
 
 		 176 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666479  hitchhiker  0.00383006 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  40.72 
 
 		 314 aa  149  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  69.07 
 
 		 267 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1519  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerization  40.72 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  38.54 
 
 		 311 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  45.77 
 
 		 288 aa  137  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  46.75 
 
 		 303 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  46.75 
 
 		 303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  65.05 
 
 		 307 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  42.75 
 
 		 288 aa  125  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  65.05 
 
 		 308 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  65.05 
 
 		 307 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  42.45 
 
 		 288 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  65.05 
 
 		 308 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  64.08 
 
 		 308 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1441  elongation factor Ts  53.72 
 
 		 354 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  43.36 
 
 		 308 aa  124  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  61 
 
 		 310 aa  124  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  60 
 
 		 312 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  43.57 
 
 		 303 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  64.08 
 
 		 308 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0407  translation elongation factor Ts  38.89 
 
 		 355 aa  123  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  43.45 
 
 		 306 aa  122  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2224  elongation factor Ts  64.65 
 
 		 310 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  42.07 
 
 		 306 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  42.07 
 
 		 306 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  58.56 
 
 		 308 aa  121  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  43.88 
 
 		 312 aa  121  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0706  translation elongation factor Ts  52.68 
 
 		 290 aa  121  8e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000134038  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>