More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5314 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5314  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3708  elongation factor Ts  62.15 
 
 		 217 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0003434  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1420  translation elongation factor Ts  60.09 
 
 		 218 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0106114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3212  translation elongation factor Ts  59.72 
 
 		 216 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000140585  hitchhiker  0.0000000047581 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0443  elongation factor Ts  59.24 
 
 		 215 aa  259  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000208997  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0579  translation elongation factor Ts  60 
 
 		 202 aa  257  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1920  elongation factor Ts  57.67 
 
 		 216 aa  256  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1428  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  57.21 
 
 		 216 aa  256  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000020519  normal  0.0754659 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1977  elongation factor Ts  63.08 
 
 		 217 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1815  elongation factor Ts  61.31 
 
 		 204 aa  256  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299653  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08151  elongation factor Ts  58.69 
 
 		 218 aa  255  3e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0283  elongation factor Ts  58.06 
 
 		 219 aa  255  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.975706  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1486  elongation factor Ts  56.54 
 
 		 216 aa  255  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00196181 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0762  elongation factor Ts  58.69 
 
 		 218 aa  255  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.670282  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0272  elongation factor Ts  58.06 
 
 		 219 aa  255  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0294  elongation factor Ts  57.6 
 
 		 219 aa  255  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2755  elongation factor Ts  56.54 
 
 		 216 aa  255  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08141  elongation factor Ts  58.22 
 
 		 218 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119849  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08301  elongation factor Ts  57.75 
 
 		 218 aa  252  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2579  elongation factor Ts  57.6 
 
 		 249 aa  252  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1251  elongation factor Ts  57.21 
 
 		 216 aa  252  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345397  hitchhiker  0.0000644664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3527  elongation factor Ts  57.6 
 
 		 250 aa  252  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3732  elongation factor Ts  56.28 
 
 		 216 aa  250  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16651  elongation factor Ts  58.22 
 
 		 218 aa  248  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.521218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0883  elongation factor Ts  60.19 
 
 		 214 aa  247  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0607  translation elongation factor Ts  59.18 
 
 		 201 aa  246  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1152  translation elongation factor Ts  55.76 
 
 		 286 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1246  elongation factor Ts  56.34 
 
 		 219 aa  244  9e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.794499  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1223  elongation factor Ts  56.13 
 
 		 220 aa  241  5e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1033  elongation factor Ts  57.87 
 
 		 203 aa  239  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048083  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1005  elongation factor Ts  59.72 
 
 		 215 aa  237  8e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000692768  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07901  elongation factor Ts  54.46 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.987366 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0158  elongation factor Ts  54.46 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.496244  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4235  elongation factor Ts  54.88 
 
 		 263 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1660  elongation factor Ts  57.64 
 
 		 204 aa  236  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000188674  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1160  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  54.13 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237926 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1132  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  56.35 
 
 		 198 aa  235  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2531  elongation factor Ts  55.77 
 
 		 221 aa  234  7e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.339571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0294  elongation factor Ts  58.53 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0828484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2923  translation elongation factor Ts  56.41 
 
 		 200 aa  232  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0743  translation elongation factor Ts  55.1 
 
 		 197 aa  231  5e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000548814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1779  translation elongation factor Ts  56.19 
 
 		 210 aa  231  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10091  elongation factor Ts  51.17 
 
 		 218 aa  231  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0475  translation elongation factor Ts  53.54 
 
 		 198 aa  229  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000567359  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1202  elongation factor Ts  51.79 
 
 		 198 aa  223  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1187  elongation factor Ts  54.04 
 
 		 199 aa  222  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000118419  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1268  elongation factor Ts  54.04 
 
 		 199 aa  221  8e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.890354  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0565  elongation factor Ts  51.28 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0576  elongation factor Ts  58.67 
 
 		 197 aa  217  8.999999999999998e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000429292  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0786  elongation factor Ts  49.23 
 
 		 196 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49408  predicted protein  50 
 
 		 440 aa  209  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0956  translation elongation factor Ts  47.49 
 
 		 221 aa  208  4e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4960  translation elongation factor Ts  51.28 
 
 		 198 aa  208  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0199  elongation factor Ts  54.87 
 
 		 197 aa  205  5e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000300429  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1965  translation elongation factor Ts  52.38 
 
 		 196 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1781  translation elongation factor Ts  50.26 
 
 		 196 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000010649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4502  translation elongation factor Ts  52.63 
 
 		 189 aa  196  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1399  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  51.6 
 
 		 207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253635  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3516  translation elongation factor Ts  48.74 
 
 		 200 aa  195  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1162  translation elongation factor Ts  48.26 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2018  translation elongation factor Ts  47.98 
 
 		 176 aa  185  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666479  hitchhiker  0.00383006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3926  translation elongation factor Ts  47.21 
 
 		 176 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0719169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3580  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  47.76 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1720  translation elongation factor Ts  47.18 
 
 		 197 aa  182  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_320  translation elongation factor Ts  46.15 
 
 		 167 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00206685  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0358  elongation factor Ts  45.13 
 
 		 167 aa  165  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023974  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0376  elongation factor Ts  44.62 
 
 		 167 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0834304  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0526  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerisation  43.08 
 
 		 177 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00005849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  41.84 
 
 		 313 aa  151  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  39.13 
 
 		 314 aa  150  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  42.56 
 
 		 292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  43.75 
 
 		 292 aa  141  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  42.13 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  39.59 
 
 		 311 aa  138  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  45.51 
 
 		 303 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  41.34 
 
 		 303 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  41.34 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  41.5 
 
 		 286 aa  135  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  40.12 
 
 		 310 aa  134  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  44.44 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1519  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerization  40 
 
 		 152 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  43.83 
 
 		 312 aa  131  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  41.67 
 
 		 291 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  63 
 
 		 310 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  37.82 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  38.78 
 
 		 293 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  38.22 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  44.52 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  42.48 
 
 		 292 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  42.19 
 
 		 285 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2224  elongation factor Ts  61.62 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  38.5 
 
 		 293 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  57.94 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  45.21 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  38.27 
 
 		 302 aa  122  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  42.19 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  57.94 
 
 		 307 aa  121  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  35.71 
 
 		 308 aa  121  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  44.52 
 
 		 293 aa  121  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  38 
 
 		 293 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>