More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1005 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1005  elongation factor Ts  100 
 
 		 215 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000692768  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0443  elongation factor Ts  77.21 
 
 		 215 aa  347  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000208997  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1420  translation elongation factor Ts  76.89 
 
 		 218 aa  336  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0106114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3212  translation elongation factor Ts  73.33 
 
 		 216 aa  319  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000140585  hitchhiker  0.0000000047581 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1815  elongation factor Ts  73.5 
 
 		 204 aa  309  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299653  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1977  elongation factor Ts  76.89 
 
 		 217 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3708  elongation factor Ts  69.01 
 
 		 217 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0003434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1033  elongation factor Ts  71.43 
 
 		 203 aa  301  5.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048083  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1428  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  65.07 
 
 		 216 aa  293  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000020519  normal  0.0754659 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0579  translation elongation factor Ts  70.2 
 
 		 202 aa  290  9e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0883  elongation factor Ts  70.42 
 
 		 214 aa  288  4e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1660  elongation factor Ts  72.36 
 
 		 204 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000188674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1920  elongation factor Ts  64.71 
 
 		 216 aa  288  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0607  translation elongation factor Ts  67.35 
 
 		 201 aa  286  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928696  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1251  elongation factor Ts  65.69 
 
 		 216 aa  285  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345397  hitchhiker  0.0000644664 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1486  elongation factor Ts  61.5 
 
 		 216 aa  279  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00196181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2755  elongation factor Ts  61.5 
 
 		 216 aa  279  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3732  elongation factor Ts  63.24 
 
 		 216 aa  276  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5314  translation elongation factor Ts  59.72 
 
 		 218 aa  263  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0283  elongation factor Ts  60 
 
 		 219 aa  262  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.975706  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0294  elongation factor Ts  59.52 
 
 		 219 aa  261  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0272  elongation factor Ts  60 
 
 		 219 aa  261  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1202  elongation factor Ts  61.54 
 
 		 198 aa  257  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4235  elongation factor Ts  58.22 
 
 		 263 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0956  translation elongation factor Ts  55.71 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0743  translation elongation factor Ts  60.21 
 
 		 197 aa  246  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000548814  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4960  translation elongation factor Ts  56.19 
 
 		 198 aa  237  9e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0475  translation elongation factor Ts  53.85 
 
 		 198 aa  236  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000567359  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0565  elongation factor Ts  56.41 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0294  elongation factor Ts  60 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0828484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1152  translation elongation factor Ts  56.6 
 
 		 286 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1779  translation elongation factor Ts  57.73 
 
 		 210 aa  236  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0786  elongation factor Ts  57.14 
 
 		 196 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2923  translation elongation factor Ts  56.7 
 
 		 200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1160  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  52.36 
 
 		 219 aa  232  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2579  elongation factor Ts  55.19 
 
 		 249 aa  231  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1132  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  55.15 
 
 		 198 aa  230  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3527  elongation factor Ts  55.19 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0762  elongation factor Ts  53.11 
 
 		 218 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.670282  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08141  elongation factor Ts  53.11 
 
 		 218 aa  228  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1268  elongation factor Ts  56.06 
 
 		 199 aa  228  6e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.890354  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08151  elongation factor Ts  52.63 
 
 		 218 aa  228  6e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0576  elongation factor Ts  62.05 
 
 		 197 aa  228  6e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000429292  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1187  elongation factor Ts  55.05 
 
 		 199 aa  226  3e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000118419  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08301  elongation factor Ts  52.63 
 
 		 218 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1965  translation elongation factor Ts  57.44 
 
 		 196 aa  224  8e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1246  elongation factor Ts  51.4 
 
 		 219 aa  223  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.794499  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10091  elongation factor Ts  51.2 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2531  elongation factor Ts  54.15 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.339571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1781  translation elongation factor Ts  57.95 
 
 		 196 aa  223  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000010649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0199  elongation factor Ts  57.95 
 
 		 197 aa  221  4.9999999999999996e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000300429  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1223  elongation factor Ts  50.93 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16651  elongation factor Ts  51.67 
 
 		 218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.521218 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0158  elongation factor Ts  50.7 
 
 		 218 aa  218  6e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.496244  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4502  translation elongation factor Ts  55.79 
 
 		 189 aa  218  7e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07901  elongation factor Ts  50.7 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.987366 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1399  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  53.44 
 
 		 207 aa  205  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253635  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49408  predicted protein  49.3 
 
 		 440 aa  196  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3516  translation elongation factor Ts  47.47 
 
 		 200 aa  184  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1720  translation elongation factor Ts  48.72 
 
 		 197 aa  181  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1162  translation elongation factor Ts  44.9 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3580  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  46.6 
 
 		 204 aa  176  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  56.49 
 
 		 303 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  56.49 
 
 		 303 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0358  elongation factor Ts  46.39 
 
 		 167 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023974  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_320  translation elongation factor Ts  45.88 
 
 		 167 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00206685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  53.25 
 
 		 294 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0376  elongation factor Ts  45.36 
 
 		 167 aa  166  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0834304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  55.84 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2018  translation elongation factor Ts  47.94 
 
 		 176 aa  165  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666479  hitchhiker  0.00383006 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  55.84 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  55.19 
 
 		 295 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3926  translation elongation factor Ts  46.91 
 
 		 176 aa  164  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0719169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  55.19 
 
 		 295 aa  164  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  55.19 
 
 		 295 aa  164  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  55.19 
 
 		 295 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  55.19 
 
 		 295 aa  164  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  55.19 
 
 		 295 aa  164  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  55.19 
 
 		 295 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  55.19 
 
 		 295 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0526  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerisation  45.36 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00005849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  50.97 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  53.25 
 
 		 295 aa  159  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  50 
 
 		 303 aa  159  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  44.39 
 
 		 311 aa  159  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  47.37 
 
 		 312 aa  158  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  49.07 
 
 		 292 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  49.68 
 
 		 299 aa  155  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  48.45 
 
 		 292 aa  154  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  52.23 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42.5 
 
 		 303 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  51.32 
 
 		 292 aa  149  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  53.8 
 
 		 293 aa  149  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  49.07 
 
 		 310 aa  149  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  46.49 
 
 		 291 aa  148  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  47.77 
 
 		 314 aa  148  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  50.62 
 
 		 293 aa  147  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  40.31 
 
 		 313 aa  147  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  46.41 
 
 		 291 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  50.31 
 
 		 294 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>