More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0786 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0786  elongation factor Ts  100 
 
 		 196 aa  390  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0199  elongation factor Ts  75.9 
 
 		 197 aa  292  3e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000300429  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1268  elongation factor Ts  66.15 
 
 		 199 aa  269  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.890354  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1187  elongation factor Ts  65.13 
 
 		 199 aa  265  4e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000118419  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1202  elongation factor Ts  64.62 
 
 		 198 aa  260  6.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1420  translation elongation factor Ts  60.51 
 
 		 218 aa  254  5e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0106114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0579  translation elongation factor Ts  61.03 
 
 		 202 aa  248  5e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1815  elongation factor Ts  60.2 
 
 		 204 aa  247  7e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299653  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0743  translation elongation factor Ts  57.89 
 
 		 197 aa  245  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000548814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1033  elongation factor Ts  60.2 
 
 		 203 aa  244  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048083  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0294  elongation factor Ts  58.97 
 
 		 219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0283  elongation factor Ts  58.46 
 
 		 219 aa  242  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.975706  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0272  elongation factor Ts  58.46 
 
 		 219 aa  241  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0565  elongation factor Ts  60.51 
 
 		 219 aa  241  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1920  elongation factor Ts  56.92 
 
 		 216 aa  241  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0576  elongation factor Ts  63.59 
 
 		 197 aa  237  6.999999999999999e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000429292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1251  elongation factor Ts  56.41 
 
 		 216 aa  237  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345397  hitchhiker  0.0000644664 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1720  translation elongation factor Ts  58.97 
 
 		 197 aa  236  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2755  elongation factor Ts  56.41 
 
 		 216 aa  235  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1486  elongation factor Ts  56.41 
 
 		 216 aa  235  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00196181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0475  translation elongation factor Ts  51.79 
 
 		 198 aa  234  5.0000000000000005e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000567359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1660  elongation factor Ts  57.65 
 
 		 204 aa  234  6e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000188674  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0607  translation elongation factor Ts  54.36 
 
 		 201 aa  234  7e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1428  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  54.08 
 
 		 216 aa  233  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000020519  normal  0.0754659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3732  elongation factor Ts  55.9 
 
 		 216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0443  elongation factor Ts  54.59 
 
 		 215 aa  229  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000208997  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3212  translation elongation factor Ts  54.36 
 
 		 216 aa  225  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000140585  hitchhiker  0.0000000047581 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0883  elongation factor Ts  58.67 
 
 		 214 aa  223  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2923  translation elongation factor Ts  51.55 
 
 		 200 aa  221  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1132  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  52.58 
 
 		 198 aa  221  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1965  translation elongation factor Ts  55.9 
 
 		 196 aa  221  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1781  translation elongation factor Ts  58.46 
 
 		 196 aa  221  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000010649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4960  translation elongation factor Ts  52.06 
 
 		 198 aa  217  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0294  elongation factor Ts  56.92 
 
 		 219 aa  215  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0828484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1779  translation elongation factor Ts  47.94 
 
 		 210 aa  214  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5314  translation elongation factor Ts  49.23 
 
 		 218 aa  214  8e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1005  elongation factor Ts  57.14 
 
 		 215 aa  214  9e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000692768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3708  elongation factor Ts  49.74 
 
 		 217 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0003434  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1152  translation elongation factor Ts  54.08 
 
 		 286 aa  210  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4235  elongation factor Ts  52.55 
 
 		 263 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1977  elongation factor Ts  57.44 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032588  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0762  elongation factor Ts  53.06 
 
 		 218 aa  208  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.670282  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08141  elongation factor Ts  53.57 
 
 		 218 aa  207  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119849  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08151  elongation factor Ts  53.06 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08301  elongation factor Ts  53.54 
 
 		 218 aa  206  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3527  elongation factor Ts  51.53 
 
 		 250 aa  204  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2579  elongation factor Ts  51.53 
 
 		 249 aa  204  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1399  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  51.08 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253635  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16651  elongation factor Ts  52.04 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.521218 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2531  elongation factor Ts  51.53 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.339571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1246  elongation factor Ts  51.01 
 
 		 219 aa  198  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.794499  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1223  elongation factor Ts  51.52 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10091  elongation factor Ts  50.51 
 
 		 218 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1160  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  49.75 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237926 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0158  elongation factor Ts  50 
 
 		 218 aa  191  5e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.496244  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07901  elongation factor Ts  50 
 
 		 218 aa  191  5e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.987366 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0526  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerisation  48.97 
 
 		 177 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00005849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0956  translation elongation factor Ts  46.53 
 
 		 221 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3516  translation elongation factor Ts  48.48 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49408  predicted protein  46.43 
 
 		 440 aa  181  8.000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4502  translation elongation factor Ts  47.89 
 
 		 189 aa  178  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3580  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  41.92 
 
 		 204 aa  171  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2018  translation elongation factor Ts  47.42 
 
 		 176 aa  171  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666479  hitchhiker  0.00383006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3926  translation elongation factor Ts  47.94 
 
 		 176 aa  170  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0719169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1162  translation elongation factor Ts  39.9 
 
 		 259 aa  167  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0358  elongation factor Ts  44.62 
 
 		 167 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023974  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0376  elongation factor Ts  44.1 
 
 		 167 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0834304  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_320  translation elongation factor Ts  43.59 
 
 		 167 aa  164  9e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00206685  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  44.6 
 
 		 286 aa  140  9e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  39.88 
 
 		 311 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1519  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerization  38.97 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  43.97 
 
 		 312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  39.58 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  38.34 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_7588  predicted protein  43.23 
 
 		 202 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.673567  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  42.55 
 
 		 287 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  38.46 
 
 		 303 aa  124  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  43.09 
 
 		 273 aa  124  9e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  43.8 
 
 		 288 aa  122  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  41.96 
 
 		 303 aa  122  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  61.46 
 
 		 288 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  60.95 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  58.18 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  36.26 
 
 		 299 aa  118  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  39.01 
 
 		 288 aa  117  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  56.25 
 
 		 288 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  39.9 
 
 		 310 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  57.89 
 
 		 294 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  63.54 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  63.16 
 
 		 285 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  39.72 
 
 		 267 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  42.78 
 
 		 303 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  42.78 
 
 		 303 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  63.16 
 
 		 285 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  63.16 
 
 		 285 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  48.76 
 
 		 286 aa  115  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0706  translation elongation factor Ts  51.92 
 
 		 290 aa  114  6e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000134038  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  62.38 
 
 		 283 aa  115  6e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  39.79 
 
 		 292 aa  114  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0528  translation elongation factor Ts  57.89 
 
 		 280 aa  114  8.999999999999998e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.101205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>