More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0607 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0607  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 201 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928696  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0579  translation elongation factor Ts  73.6 
 
 		 202 aa  314  7e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3212  translation elongation factor Ts  69.19 
 
 		 216 aa  302  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000140585  hitchhiker  0.0000000047581 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1420  translation elongation factor Ts  69.54 
 
 		 218 aa  297  8e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0106114  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1815  elongation factor Ts  67.35 
 
 		 204 aa  293  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299653  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1033  elongation factor Ts  67.86 
 
 		 203 aa  291  4e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048083  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3708  elongation factor Ts  65.99 
 
 		 217 aa  285  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0003434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0443  elongation factor Ts  66.33 
 
 		 215 aa  284  7e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000208997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1660  elongation factor Ts  68.37 
 
 		 204 aa  283  9e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000188674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0475  translation elongation factor Ts  65.64 
 
 		 198 aa  278  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000567359  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0883  elongation factor Ts  68.37 
 
 		 214 aa  274  6e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1977  elongation factor Ts  69.54 
 
 		 217 aa  272  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1920  elongation factor Ts  62.12 
 
 		 216 aa  268  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0743  translation elongation factor Ts  60.41 
 
 		 197 aa  266  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000548814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1202  elongation factor Ts  58.88 
 
 		 198 aa  265  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1428  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  57.65 
 
 		 216 aa  264  8.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000020519  normal  0.0754659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3732  elongation factor Ts  61.62 
 
 		 216 aa  262  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1486  elongation factor Ts  60.61 
 
 		 216 aa  261  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00196181 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1005  elongation factor Ts  67.35 
 
 		 215 aa  261  4.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000692768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2755  elongation factor Ts  60.1 
 
 		 216 aa  260  8e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1251  elongation factor Ts  60.1 
 
 		 216 aa  259  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345397  hitchhiker  0.0000644664 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1779  translation elongation factor Ts  58.67 
 
 		 210 aa  250  8.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0283  elongation factor Ts  58.38 
 
 		 219 aa  247  8e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.975706  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0272  elongation factor Ts  58.38 
 
 		 219 aa  246  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0294  elongation factor Ts  57.87 
 
 		 219 aa  246  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5314  translation elongation factor Ts  59.18 
 
 		 218 aa  246  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4960  translation elongation factor Ts  56.06 
 
 		 198 aa  244  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2923  translation elongation factor Ts  58.67 
 
 		 200 aa  244  8e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0565  elongation factor Ts  54 
 
 		 219 aa  238  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4235  elongation factor Ts  54.04 
 
 		 263 aa  237  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2531  elongation factor Ts  58.08 
 
 		 221 aa  236  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.339571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1132  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  58.25 
 
 		 198 aa  234  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0786  elongation factor Ts  54.36 
 
 		 196 aa  234  8e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1187  elongation factor Ts  56.06 
 
 		 199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000118419  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1268  elongation factor Ts  56.06 
 
 		 199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.890354  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1152  translation elongation factor Ts  55.05 
 
 		 286 aa  228  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2579  elongation factor Ts  54.55 
 
 		 249 aa  227  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3527  elongation factor Ts  54.55 
 
 		 250 aa  227  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0199  elongation factor Ts  54.82 
 
 		 197 aa  226  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000300429  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1223  elongation factor Ts  54.82 
 
 		 220 aa  224  8e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0294  elongation factor Ts  57.87 
 
 		 219 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0828484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1246  elongation factor Ts  52.79 
 
 		 219 aa  220  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.794499  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1160  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  52.53 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237926 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1965  translation elongation factor Ts  54.5 
 
 		 196 aa  218  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0956  translation elongation factor Ts  51.71 
 
 		 221 aa  218  3.9999999999999997e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0576  elongation factor Ts  55.84 
 
 		 197 aa  216  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000429292  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10091  elongation factor Ts  50.51 
 
 		 218 aa  215  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08141  elongation factor Ts  50.76 
 
 		 218 aa  214  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119849  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08151  elongation factor Ts  50.25 
 
 		 218 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0762  elongation factor Ts  49.75 
 
 		 218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.670282  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1781  translation elongation factor Ts  54.5 
 
 		 196 aa  211  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000010649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08301  elongation factor Ts  50.25 
 
 		 218 aa  211  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1399  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  54.26 
 
 		 207 aa  209  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253635  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07901  elongation factor Ts  48.48 
 
 		 218 aa  208  5e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.987366 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0158  elongation factor Ts  48.48 
 
 		 218 aa  208  5e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.496244  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16651  elongation factor Ts  48.99 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.521218 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4502  translation elongation factor Ts  51.05 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49408  predicted protein  50.25 
 
 		 440 aa  199  3e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3580  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  48.74 
 
 		 204 aa  194  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1720  translation elongation factor Ts  47.21 
 
 		 197 aa  192  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3516  translation elongation factor Ts  50 
 
 		 200 aa  191  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1162  translation elongation factor Ts  47.74 
 
 		 259 aa  191  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0358  elongation factor Ts  45.92 
 
 		 167 aa  174  7e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023974  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_320  translation elongation factor Ts  45.41 
 
 		 167 aa  174  9e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00206685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3926  translation elongation factor Ts  44.62 
 
 		 176 aa  171  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0719169 
 
 
-
 
NC_002936  DET0376  elongation factor Ts  44.9 
 
 		 167 aa  170  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0834304  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2018  translation elongation factor Ts  43.59 
 
 		 176 aa  168  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666479  hitchhiker  0.00383006 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0526  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerisation  43.81 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00005849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 313 aa  157  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1519  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerization  43.15 
 
 		 152 aa  155  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  48.61 
 
 		 303 aa  145  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  48.61 
 
 		 303 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  38.58 
 
 		 314 aa  142  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  40.8 
 
 		 311 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  48.34 
 
 		 287 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  43.15 
 
 		 286 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  43.06 
 
 		 303 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  50 
 
 		 294 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  47.86 
 
 		 288 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  51.47 
 
 		 294 aa  131  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  48.53 
 
 		 294 aa  131  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42.25 
 
 		 303 aa  129  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  50.74 
 
 		 295 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  50.74 
 
 		 295 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  50 
 
 		 295 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  50 
 
 		 295 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  50 
 
 		 295 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  50 
 
 		 295 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  50 
 
 		 295 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  50 
 
 		 295 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  50 
 
 		 295 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  43.97 
 
 		 312 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  43.24 
 
 		 288 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  50 
 
 		 295 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  40.7 
 
 		 293 aa  125  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  40.7 
 
 		 293 aa  125  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  43.01 
 
 		 292 aa  126  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  48.51 
 
 		 288 aa  125  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  42.76 
 
 		 310 aa  125  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  50.38 
 
 		 294 aa  124  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>