More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1187 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1187  elongation factor Ts  100 
 
 		 199 aa  396  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000118419  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1268  elongation factor Ts  98.49 
 
 		 199 aa  391  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.890354  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0786  elongation factor Ts  65.13 
 
 		 196 aa  265  4e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0579  translation elongation factor Ts  61.93 
 
 		 202 aa  253  9e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1202  elongation factor Ts  62.94 
 
 		 198 aa  252  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1815  elongation factor Ts  59.6 
 
 		 204 aa  244  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299653  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0199  elongation factor Ts  63.96 
 
 		 197 aa  244  6e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000300429  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1033  elongation factor Ts  62.83 
 
 		 203 aa  243  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048083  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0743  translation elongation factor Ts  59.39 
 
 		 197 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000548814  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0576  elongation factor Ts  66.5 
 
 		 197 aa  237  6.999999999999999e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000429292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3212  translation elongation factor Ts  58.5 
 
 		 216 aa  237  9e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000140585  hitchhiker  0.0000000047581 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0294  elongation factor Ts  54.77 
 
 		 219 aa  234  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0283  elongation factor Ts  54.27 
 
 		 219 aa  234  7e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.975706  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0607  translation elongation factor Ts  56.06 
 
 		 201 aa  233  9e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0272  elongation factor Ts  54.27 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1420  translation elongation factor Ts  56.28 
 
 		 218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0106114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1920  elongation factor Ts  53 
 
 		 216 aa  231  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1660  elongation factor Ts  59.6 
 
 		 204 aa  230  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000188674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1251  elongation factor Ts  54.04 
 
 		 216 aa  230  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345397  hitchhiker  0.0000644664 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0443  elongation factor Ts  55.05 
 
 		 215 aa  227  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000208997  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0475  translation elongation factor Ts  52.82 
 
 		 198 aa  226  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000567359  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4960  translation elongation factor Ts  56.12 
 
 		 198 aa  224  9e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1977  elongation factor Ts  60.3 
 
 		 217 aa  223  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1486  elongation factor Ts  51.52 
 
 		 216 aa  223  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00196181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2755  elongation factor Ts  51.52 
 
 		 216 aa  222  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5314  translation elongation factor Ts  54.04 
 
 		 218 aa  222  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3708  elongation factor Ts  55.28 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0003434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1428  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  54.92 
 
 		 216 aa  222  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000020519  normal  0.0754659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0565  elongation factor Ts  55.33 
 
 		 219 aa  221  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3732  elongation factor Ts  51.52 
 
 		 216 aa  220  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0883  elongation factor Ts  57.07 
 
 		 214 aa  220  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1152  translation elongation factor Ts  56.5 
 
 		 286 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2579  elongation factor Ts  55 
 
 		 249 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2923  translation elongation factor Ts  52.55 
 
 		 200 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3527  elongation factor Ts  55 
 
 		 250 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1720  translation elongation factor Ts  57.87 
 
 		 197 aa  218  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1132  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  54.64 
 
 		 198 aa  218  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2531  elongation factor Ts  54 
 
 		 221 aa  216  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.339571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0294  elongation factor Ts  54.77 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0828484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1779  translation elongation factor Ts  50.51 
 
 		 210 aa  214  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4235  elongation factor Ts  51 
 
 		 263 aa  214  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1005  elongation factor Ts  55.05 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000692768  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1965  translation elongation factor Ts  53.44 
 
 		 196 aa  204  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08301  elongation factor Ts  52.76 
 
 		 218 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08141  elongation factor Ts  52.76 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119849  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1781  translation elongation factor Ts  53.89 
 
 		 196 aa  202  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000010649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08151  elongation factor Ts  52.26 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0762  elongation factor Ts  52.26 
 
 		 218 aa  201  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.670282  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16651  elongation factor Ts  51 
 
 		 218 aa  198  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.521218 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1160  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  49.5 
 
 		 219 aa  197  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237926 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1246  elongation factor Ts  49.75 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.794499  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1223  elongation factor Ts  50.25 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1399  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  49.74 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253635  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10091  elongation factor Ts  48.5 
 
 		 218 aa  194  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0158  elongation factor Ts  50 
 
 		 218 aa  194  9e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.496244  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07901  elongation factor Ts  50 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.987366 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4502  translation elongation factor Ts  53.19 
 
 		 189 aa  192  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3516  translation elongation factor Ts  48.47 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0956  translation elongation factor Ts  43 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0358  elongation factor Ts  49.48 
 
 		 167 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023974  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49408  predicted protein  45.77 
 
 		 440 aa  177  8e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0376  elongation factor Ts  48.97 
 
 		 167 aa  177  9e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0834304  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_320  translation elongation factor Ts  48.45 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00206685  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3580  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  44.22 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1162  translation elongation factor Ts  43.72 
 
 		 259 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3926  translation elongation factor Ts  44.56 
 
 		 176 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0719169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2018  translation elongation factor Ts  43.52 
 
 		 176 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666479  hitchhiker  0.00383006 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0526  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerisation  41.67 
 
 		 177 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00005849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1519  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerization  43.59 
 
 		 152 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  43.36 
 
 		 286 aa  134  8e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  39.29 
 
 		 311 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  38.54 
 
 		 313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  36.41 
 
 		 314 aa  125  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  43.05 
 
 		 287 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  55.66 
 
 		 276 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  43.97 
 
 		 288 aa  120  9e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  40.56 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_7588  predicted protein  42.21 
 
 		 202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.673567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  40.41 
 
 		 303 aa  118  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  40.41 
 
 		 303 aa  118  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  38.54 
 
 		 277 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  39.27 
 
 		 292 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  38.33 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  41.61 
 
 		 310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  40.56 
 
 		 303 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  37.57 
 
 		 294 aa  112  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  53.06 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  36.65 
 
 		 291 aa  111  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  33.84 
 
 		 302 aa  111  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  34.72 
 
 		 303 aa  111  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  41.15 
 
 		 273 aa  110  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  50.46 
 
 		 294 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  42.96 
 
 		 288 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  56.86 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  45.07 
 
 		 292 aa  109  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  35.2 
 
 		 294 aa  109  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  51.52 
 
 		 286 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  38.73 
 
 		 299 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  43.8 
 
 		 286 aa  108  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  54.9 
 
 		 308 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>