More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0294 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0294  elongation factor Ts  100 
 
 		 219 aa  431  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0283  elongation factor Ts  99.54 
 
 		 219 aa  431  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.975706  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0272  elongation factor Ts  99.09 
 
 		 219 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0294  elongation factor Ts  85.39 
 
 		 219 aa  354  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0828484  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1920  elongation factor Ts  66.36 
 
 		 216 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2755  elongation factor Ts  63.38 
 
 		 216 aa  280  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1251  elongation factor Ts  65.89 
 
 		 216 aa  279  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345397  hitchhiker  0.0000644664 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1486  elongation factor Ts  62.91 
 
 		 216 aa  278  7e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00196181 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1420  translation elongation factor Ts  60.66 
 
 		 218 aa  274  9e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0106114  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3732  elongation factor Ts  63.08 
 
 		 216 aa  268  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0443  elongation factor Ts  60 
 
 		 215 aa  261  6.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000208997  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1815  elongation factor Ts  62.31 
 
 		 204 aa  259  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299653  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1977  elongation factor Ts  64.15 
 
 		 217 aa  258  7e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032588  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0579  translation elongation factor Ts  59 
 
 		 202 aa  255  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5314  translation elongation factor Ts  57.6 
 
 		 218 aa  255  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3212  translation elongation factor Ts  58.1 
 
 		 216 aa  254  9e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000140585  hitchhiker  0.0000000047581 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1428  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  56.73 
 
 		 216 aa  250  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000020519  normal  0.0754659 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1660  elongation factor Ts  60.61 
 
 		 204 aa  249  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000188674  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1033  elongation factor Ts  58.42 
 
 		 203 aa  248  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048083  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3708  elongation factor Ts  55.4 
 
 		 217 aa  248  7e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0003434  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0607  translation elongation factor Ts  57.87 
 
 		 201 aa  246  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928696  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0883  elongation factor Ts  59.13 
 
 		 214 aa  244  9e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1152  translation elongation factor Ts  56.22 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0786  elongation factor Ts  58.97 
 
 		 196 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1202  elongation factor Ts  56.12 
 
 		 198 aa  241  7e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3527  elongation factor Ts  54.84 
 
 		 250 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1005  elongation factor Ts  59.52 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000692768  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2579  elongation factor Ts  54.84 
 
 		 249 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0475  translation elongation factor Ts  56.57 
 
 		 198 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000567359  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1187  elongation factor Ts  54.77 
 
 		 199 aa  234  6e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000118419  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1160  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  53.92 
 
 		 219 aa  234  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4235  elongation factor Ts  53.52 
 
 		 263 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1268  elongation factor Ts  54.77 
 
 		 199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.890354  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08151  elongation factor Ts  53.52 
 
 		 218 aa  232  3e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0743  translation elongation factor Ts  55.9 
 
 		 197 aa  231  6e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000548814  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0762  elongation factor Ts  53.05 
 
 		 218 aa  231  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.670282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2923  translation elongation factor Ts  57.73 
 
 		 200 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2531  elongation factor Ts  54.81 
 
 		 221 aa  231  9e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.339571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08141  elongation factor Ts  53.05 
 
 		 218 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119849  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08301  elongation factor Ts  52.58 
 
 		 218 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0199  elongation factor Ts  60.2 
 
 		 197 aa  228  6e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000300429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1779  translation elongation factor Ts  57.44 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16651  elongation factor Ts  51.64 
 
 		 218 aa  225  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.521218 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0565  elongation factor Ts  54.36 
 
 		 219 aa  225  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0576  elongation factor Ts  59.49 
 
 		 197 aa  221  4.9999999999999996e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000429292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1132  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  55.84 
 
 		 198 aa  221  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4960  translation elongation factor Ts  52.55 
 
 		 198 aa  218  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0158  elongation factor Ts  50.7 
 
 		 218 aa  218  7e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.496244  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07901  elongation factor Ts  50.7 
 
 		 218 aa  217  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.987366 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10091  elongation factor Ts  49.77 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1223  elongation factor Ts  50 
 
 		 220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1246  elongation factor Ts  48.36 
 
 		 219 aa  211  7.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.794499  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4502  translation elongation factor Ts  54.74 
 
 		 189 aa  206  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1965  translation elongation factor Ts  54.5 
 
 		 196 aa  201  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0956  translation elongation factor Ts  48.37 
 
 		 221 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1720  translation elongation factor Ts  51.02 
 
 		 197 aa  199  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1781  translation elongation factor Ts  52.91 
 
 		 196 aa  195  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000010649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49408  predicted protein  46.73 
 
 		 440 aa  193  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3516  translation elongation factor Ts  50.51 
 
 		 200 aa  185  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1399  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  47.34 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2018  translation elongation factor Ts  46.46 
 
 		 176 aa  174  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666479  hitchhiker  0.00383006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3926  translation elongation factor Ts  46.46 
 
 		 176 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0719169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3580  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  45.73 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_320  translation elongation factor Ts  45.88 
 
 		 167 aa  171  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00206685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1162  translation elongation factor Ts  43.72 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0358  elongation factor Ts  44.85 
 
 		 167 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023974  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  52.15 
 
 		 311 aa  165  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0376  elongation factor Ts  44.33 
 
 		 167 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0834304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  53.12 
 
 		 312 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1519  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerization  43.08 
 
 		 152 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0526  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerisation  38.66 
 
 		 177 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00005849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  41.92 
 
 		 313 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  41.9 
 
 		 303 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  39 
 
 		 314 aa  139  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  41.9 
 
 		 303 aa  138  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42.95 
 
 		 303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  44.81 
 
 		 303 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  46.76 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  39.64 
 
 		 299 aa  129  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  42.28 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  42.96 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  41.38 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  42 
 
 		 307 aa  122  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 293 aa  121  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  41.15 
 
 		 291 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  41.72 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  42.27 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  41.03 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  41.75 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2224  elongation factor Ts  64.65 
 
 		 310 aa  119  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  63 
 
 		 310 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  43.01 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  40.72 
 
 		 293 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>