More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1399 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1399  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  100 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1428  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  52.91 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000020519  normal  0.0754659 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0579  translation elongation factor Ts  59.04 
 
 		 202 aa  217  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1420  translation elongation factor Ts  56.45 
 
 		 218 aa  215  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0106114  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1815  elongation factor Ts  53.97 
 
 		 204 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299653  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3212  translation elongation factor Ts  54.79 
 
 		 216 aa  211  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000140585  hitchhiker  0.0000000047581 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0743  translation elongation factor Ts  49.74 
 
 		 197 aa  210  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000548814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0607  translation elongation factor Ts  54.26 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928696  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0475  translation elongation factor Ts  49.47 
 
 		 198 aa  207  8e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000567359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3708  elongation factor Ts  53.97 
 
 		 217 aa  206  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0003434  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1202  elongation factor Ts  52.33 
 
 		 198 aa  206  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0786  elongation factor Ts  51.08 
 
 		 196 aa  203  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1965  translation elongation factor Ts  51.81 
 
 		 196 aa  202  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1033  elongation factor Ts  51.06 
 
 		 203 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048083  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1660  elongation factor Ts  54.01 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000188674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0443  elongation factor Ts  52.38 
 
 		 215 aa  202  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000208997  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4960  translation elongation factor Ts  47.69 
 
 		 198 aa  201  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1779  translation elongation factor Ts  45.74 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1781  translation elongation factor Ts  50.78 
 
 		 196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000010649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1187  elongation factor Ts  49.74 
 
 		 199 aa  196  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000118419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5314  translation elongation factor Ts  51.6 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1920  elongation factor Ts  49.21 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1268  elongation factor Ts  51.06 
 
 		 199 aa  193  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.890354  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0565  elongation factor Ts  48.68 
 
 		 219 aa  191  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0956  translation elongation factor Ts  48.02 
 
 		 221 aa  191  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0576  elongation factor Ts  52.82 
 
 		 197 aa  190  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000429292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1005  elongation factor Ts  53.44 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000692768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1251  elongation factor Ts  47.62 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345397  hitchhiker  0.0000644664 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3732  elongation factor Ts  47.09 
 
 		 216 aa  188  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4502  translation elongation factor Ts  51.6 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2755  elongation factor Ts  45.5 
 
 		 216 aa  184  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0741161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0283  elongation factor Ts  47.87 
 
 		 219 aa  184  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.975706  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0294  elongation factor Ts  47.34 
 
 		 219 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1486  elongation factor Ts  45.5 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00196181 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0272  elongation factor Ts  47.87 
 
 		 219 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2923  translation elongation factor Ts  47.18 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0883  elongation factor Ts  50.53 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1977  elongation factor Ts  51.6 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00032588  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1152  translation elongation factor Ts  48.68 
 
 		 286 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0199  elongation factor Ts  47.87 
 
 		 197 aa  180  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000300429  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2579  elongation factor Ts  46.32 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3527  elongation factor Ts  46.32 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.84693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1132  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  45.21 
 
 		 198 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4235  elongation factor Ts  46.52 
 
 		 263 aa  174  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023006 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0294  elongation factor Ts  48.4 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0828484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1720  translation elongation factor Ts  44.56 
 
 		 197 aa  171  7.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3516  translation elongation factor Ts  45.18 
 
 		 200 aa  171  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08141  elongation factor Ts  44.97 
 
 		 218 aa  171  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119849  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08151  elongation factor Ts  44.44 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2531  elongation factor Ts  47.09 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.339571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0762  elongation factor Ts  43.92 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.670282  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1246  elongation factor Ts  46.03 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.794499  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1223  elongation factor Ts  45.18 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1160  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  43.39 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237926 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08301  elongation factor Ts  43.39 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16651  elongation factor Ts  45.5 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.521218 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0158  elongation factor Ts  44.97 
 
 		 218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.496244  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07901  elongation factor Ts  44.97 
 
 		 218 aa  164  8e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.987366 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3580  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42.86 
 
 		 204 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10091  elongation factor Ts  44.97 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49408  predicted protein  40.74 
 
 		 440 aa  158  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0526  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerisation  41.54 
 
 		 177 aa  158  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00005849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1162  translation elongation factor Ts  43.01 
 
 		 259 aa  157  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_320  translation elongation factor Ts  40.51 
 
 		 167 aa  155  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00206685  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0358  elongation factor Ts  41.03 
 
 		 167 aa  155  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023974  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0376  elongation factor Ts  41.03 
 
 		 167 aa  153  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0834304  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2018  translation elongation factor Ts  40.96 
 
 		 176 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.666479  hitchhiker  0.00383006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3926  translation elongation factor Ts  43.09 
 
 		 176 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0719169 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1519  Translation elongation factor EFTs/EF1B dimerization  39.47 
 
 		 152 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  43.07 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  40.13 
 
 		 291 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  39.44 
 
 		 303 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  39.44 
 
 		 303 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  34.72 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  42.03 
 
 		 287 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  38.95 
 
 		 292 aa  114  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  32.45 
 
 		 313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  40.83 
 
 		 293 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0673  translation elongation factor Ts  32.67 
 
 		 292 aa  111  9e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  44.53 
 
 		 293 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  36.84 
 
 		 299 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  49.06 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  35.23 
 
 		 292 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  34.1 
 
 		 292 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  33.85 
 
 		 312 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  34.66 
 
 		 292 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  41.43 
 
 		 267 aa  104  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  31.72 
 
 		 314 aa  104  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  36.22 
 
 		 288 aa  102  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  38.64 
 
 		 288 aa  102  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  38.85 
 
 		 292 aa  101  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  34.81 
 
 		 293 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  32.35 
 
 		 292 aa  99.4  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  34.18 
 
 		 289 aa  99  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  34 
 
 		 293 aa  98.6  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  34.71 
 
 		 293 aa  99  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  34 
 
 		 293 aa  98.6  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  35.44 
 
 		 293 aa  98.2  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  42.55 
 
 		 294 aa  97.8  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  34.72 
 
 		 277 aa  97.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>