102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3170 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3170  methyltransferase type 11  100 
 
 
219 aa  437  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0295556  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1822  Methyltransferase type 11  45.79 
 
 
213 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00574627  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6034  hypothetical protein  48.8 
 
 
211 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335724  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1120  hypothetical protein  48.04 
 
 
217 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1270  hypothetical protein  48.04 
 
 
217 aa  168  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13313  predicted protein  44.55 
 
 
229 aa  166  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27591  predicted protein  45.32 
 
 
241 aa  162  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.861459  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2718  hypothetical protein  45.85 
 
 
217 aa  162  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0525784  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1828  Methyltransferase type 12  45.1 
 
 
412 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  hitchhiker  0.0000267475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0224  hypothetical protein  43.09 
 
 
214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0587288  normal  0.156271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0445  Methyltransferase type 11  43.27 
 
 
399 aa  143  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.832039  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1540  methyltransferase type 11  47.49 
 
 
402 aa  141  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000274527  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1330  hypothetical protein  41.63 
 
 
218 aa  138  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1977  hypothetical protein  39.81 
 
 
217 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.183577  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13458  predicted protein  40 
 
 
207 aa  137  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1009  Methyltransferase type 11  38.79 
 
 
215 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00599159  normal  0.0418085 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1320  Methyltransferase type 11  46.82 
 
 
315 aa  136  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.065684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1926  Methyltransferase type 11  36.62 
 
 
213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3179  hypothetical protein  37.62 
 
 
216 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2938  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
216 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16673  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2053  methyltransferase type 11  37.44 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14191  predicted protein  41.27 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  39.08 
 
 
350 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2330  hypothetical protein  33.76 
 
 
403 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0440768  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37443  predicted protein  38.53 
 
 
279 aa  123  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0385962  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4604  predicted protein  40.91 
 
 
209 aa  116  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0142714  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1476  hypothetical protein  36.19 
 
 
218 aa  115  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.470823 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14201  hypothetical protein  32.37 
 
 
217 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432496 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0525  Methyltransferase type 11  35.94 
 
 
237 aa  108  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1031  hypothetical protein  33.49 
 
 
217 aa  105  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0256527  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10541  hypothetical protein  32.18 
 
 
216 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.864146  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10751  hypothetical protein  32.7 
 
 
215 aa  98.6  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0372  SAM-dependent methyltransferase  31.61 
 
 
216 aa  95.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118814  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13391  hypothetical protein  27.49 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.417782  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13601  hypothetical protein  28.5 
 
 
212 aa  92.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13691  hypothetical protein  27.4 
 
 
212 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0487979  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1268  hypothetical protein  26.09 
 
 
212 aa  85.1  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.391733  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51541  methionine-dependent methyltransferase  28.1 
 
 
214 aa  55.1  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  51.06 
 
 
283 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  39.76 
 
 
1106 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  48.94 
 
 
281 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3382  Methyltransferase type 11  30 
 
 
312 aa  48.9  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  51.06 
 
 
256 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  31.16 
 
 
272 aa  48.5  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  44.68 
 
 
259 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  36.71 
 
 
279 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  41.86 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6455  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.98 
 
 
244 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  34.72 
 
 
259 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  36.11 
 
 
253 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  23.88 
 
 
246 aa  45.8  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  41.51 
 
 
247 aa  45.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 
258 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 
246 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  41.3 
 
 
225 aa  45.4  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  28.99 
 
 
241 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
248 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
246 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0442  hypothetical protein  42.65 
 
 
219 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  44.68 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2907  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.29 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  36.99 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  44.83 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  38.67 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  32.94 
 
 
244 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1619  methyltransferase type 11  30.66 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  35.62 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2732  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  30.3 
 
 
242 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  26.17 
 
 
270 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.65 
 
 
249 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  27.69 
 
 
240 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
225 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  38.1 
 
 
331 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  47.73 
 
 
291 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  36.21 
 
 
246 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  34.91 
 
 
246 aa  42.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  39.71 
 
 
272 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3076  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
221 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.851189  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  37.14 
 
 
255 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.15 
 
 
258 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.57 
 
 
282 aa  42  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.67 
 
 
287 aa  42  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.92 
 
 
261 aa  42  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0289  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  27.92 
 
 
261 aa  42  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 
269 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3927  methyltransferase type 11  28.97 
 
 
228 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
238 aa  42  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
269 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  41.6  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  29.79 
 
 
239 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  33.68 
 
 
221 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  27.12 
 
 
244 aa  41.6  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1512  methyltransferase type 11  22.83 
 
 
217 aa  41.6  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
244 aa  41.6  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0632  hypothetical protein  38.78 
 
 
267 aa  41.6  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>