37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51541 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_51541  methionine-dependent methyltransferase  100 
 
 
214 aa  442  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27591  predicted protein  31.02 
 
 
241 aa  87.4  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.861459  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1822  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 
213 aa  82  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00574627  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13313  predicted protein  31.64 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4604  predicted protein  30.1 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0142714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0224  hypothetical protein  33.09 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0587288  normal  0.156271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3179  hypothetical protein  30.86 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2938  Methyltransferase type 11  35.38 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16673  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0445  Methyltransferase type 11  26.99 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.832039  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1828  Methyltransferase type 12  24.32 
 
 
412 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  hitchhiker  0.0000267475 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14191  predicted protein  29.12 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  25.75 
 
 
350 aa  65.9  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1320  Methyltransferase type 11  27.04 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.065684 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1009  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00599159  normal  0.0418085 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37443  predicted protein  26.11 
 
 
279 aa  63.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0385962  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1926  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
213 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1330  hypothetical protein  23.74 
 
 
218 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1977  hypothetical protein  26.71 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.183577  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2330  hypothetical protein  26.44 
 
 
403 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0440768  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13458  predicted protein  26.45 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1540  methyltransferase type 11  24.53 
 
 
402 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000274527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3170  methyltransferase type 11  28.1 
 
 
219 aa  55.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0295556  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0525  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 
237 aa  55.5  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2718  hypothetical protein  22.81 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0525784  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6034  hypothetical protein  25.93 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335724  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2053  methyltransferase type 11  23.46 
 
 
221 aa  51.6  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1120  hypothetical protein  24.69 
 
 
217 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0317  Methyltransferase type 12  30.95 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1476  hypothetical protein  22.5 
 
 
218 aa  47  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.470823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1270  hypothetical protein  24.07 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1031  hypothetical protein  23.35 
 
 
217 aa  46.2  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0256527  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
710 aa  45.1  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2928  SAM-dependent methyltransferase  20.78 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000530736  hitchhiker  0.00484041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  23.71 
 
 
269 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 
711 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  25.61 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
333 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>