49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6034 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6034  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  425  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335724  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1270  hypothetical protein  70.44 
 
 
217 aa  302  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1120  hypothetical protein  69.95 
 
 
217 aa  301  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2718  hypothetical protein  64.39 
 
 
217 aa  277  7e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0525784  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1822  Methyltransferase type 11  45.77 
 
 
213 aa  191  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00574627  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3179  hypothetical protein  51.96 
 
 
216 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2938  Methyltransferase type 11  51.4 
 
 
216 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16673  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1926  Methyltransferase type 11  49.28 
 
 
213 aa  187  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1009  Methyltransferase type 11  49.53 
 
 
215 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00599159  normal  0.0418085 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37443  predicted protein  55.23 
 
 
279 aa  186  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0385962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1977  hypothetical protein  50 
 
 
217 aa  185  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.183577  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1330  hypothetical protein  53.01 
 
 
218 aa  182  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1476  hypothetical protein  48 
 
 
218 aa  180  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.470823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3170  methyltransferase type 11  48.8 
 
 
219 aa  176  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0295556  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27591  predicted protein  45.37 
 
 
241 aa  176  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.861459  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1031  hypothetical protein  46.73 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0256527  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2053  methyltransferase type 11  42.79 
 
 
221 aa  171  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13313  predicted protein  42.72 
 
 
229 aa  169  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10751  hypothetical protein  47.46 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14201  hypothetical protein  41.79 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432496 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10541  hypothetical protein  39.32 
 
 
216 aa  158  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.864146  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0372  SAM-dependent methyltransferase  39.32 
 
 
216 aa  158  6e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1540  methyltransferase type 11  47.37 
 
 
402 aa  158  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000274527  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14191  predicted protein  42.31 
 
 
225 aa  156  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0525  Methyltransferase type 11  43.93 
 
 
237 aa  154  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  42.78 
 
 
350 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1320  Methyltransferase type 11  49.11 
 
 
315 aa  152  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.065684 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1828  Methyltransferase type 12  43.78 
 
 
412 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  hitchhiker  0.0000267475 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0445  Methyltransferase type 11  43.35 
 
 
399 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.832039  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13391  hypothetical protein  39.56 
 
 
214 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.417782  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2330  hypothetical protein  47.13 
 
 
403 aa  141  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0440768  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13601  hypothetical protein  37.11 
 
 
212 aa  141  7e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4604  predicted protein  42.33 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0142714  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13458  predicted protein  42.08 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13691  hypothetical protein  36.08 
 
 
212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0487979  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1268  hypothetical protein  37.16 
 
 
212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.391733  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0224  hypothetical protein  35.81 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0587288  normal  0.156271 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51541  methionine-dependent methyltransferase  24.69 
 
 
214 aa  52.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  42.65 
 
 
272 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  41.18 
 
 
272 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  41.18 
 
 
276 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0883  Methyltransferase type 11  48.94 
 
 
282 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.049134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  48.94 
 
 
283 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
1106 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  46.94 
 
 
248 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  46.81 
 
 
281 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  32.65 
 
 
210 aa  41.6  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  39.71 
 
 
272 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.672386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>