58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_4604 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_4604  predicted protein  100 
 
 
209 aa  434  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0142714  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27591  predicted protein  47.55 
 
 
241 aa  201  8e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.861459  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13313  predicted protein  45.59 
 
 
229 aa  185  3e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14191  predicted protein  44.78 
 
 
225 aa  169  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1977  hypothetical protein  44.74 
 
 
217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.183577  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1009  Methyltransferase type 11  44.5 
 
 
215 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00599159  normal  0.0418085 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37443  predicted protein  43.08 
 
 
279 aa  159  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0385962  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1330  hypothetical protein  42.29 
 
 
218 aa  158  6e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13458  predicted protein  48.33 
 
 
207 aa  157  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1926  Methyltransferase type 11  43.68 
 
 
213 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2938  Methyltransferase type 11  43.46 
 
 
216 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16673  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3179  hypothetical protein  42.93 
 
 
216 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2053  methyltransferase type 11  40.72 
 
 
221 aa  149  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1822  Methyltransferase type 11  40.21 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00574627  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1120  hypothetical protein  44.44 
 
 
217 aa  141  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6034  hypothetical protein  42.33 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335724  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1270  hypothetical protein  43.89 
 
 
217 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2718  hypothetical protein  42.25 
 
 
217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0525784  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1320  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 
315 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.065684 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0224  hypothetical protein  39.23 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0587288  normal  0.156271 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1476  hypothetical protein  41.05 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.470823 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1540  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
402 aa  125  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000274527  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1031  hypothetical protein  39.47 
 
 
217 aa  122  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0256527  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14201  hypothetical protein  38.33 
 
 
217 aa  121  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432496 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1828  Methyltransferase type 12  38.8 
 
 
412 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  hitchhiker  0.0000267475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3170  methyltransferase type 11  40.91 
 
 
219 aa  116  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0295556  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0372  SAM-dependent methyltransferase  39.66 
 
 
216 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118814  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10751  hypothetical protein  36.65 
 
 
215 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10541  hypothetical protein  39.66 
 
 
216 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.864146  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  36.07 
 
 
350 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0445  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 
399 aa  112  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.832039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2330  hypothetical protein  31.25 
 
 
403 aa  101  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0440768  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13391  hypothetical protein  37.21 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.417782  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13691  hypothetical protein  31.61 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0487979  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13601  hypothetical protein  32.18 
 
 
212 aa  92.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1268  hypothetical protein  31.61 
 
 
212 aa  91.7  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.391733  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0525  Methyltransferase type 11  34.64 
 
 
237 aa  90.1  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51541  methionine-dependent methyltransferase  30.1 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  26.96 
 
 
310 aa  45.1  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  25.23 
 
 
243 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  32.91 
 
 
275 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.62 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
285 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.25 
 
 
258 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.93 
 
 
236 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  27.63 
 
 
238 aa  43.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 
350 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  30 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29830  putative methyltransferase  46.81 
 
 
269 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00181323  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2556  methyltransferase  46.81 
 
 
269 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 
240 aa  42.4  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
317 aa  42  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
283 aa  42.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  38.33 
 
 
266 aa  42  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2168  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  23.33 
 
 
237 aa  42  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
281 aa  41.6  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.18 
 
 
238 aa  41.6  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3609  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 
283 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>