46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1268 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1268  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.391733  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13691  hypothetical protein  84.91 
 
 
212 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0487979  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13601  hypothetical protein  83.49 
 
 
212 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13391  hypothetical protein  77.36 
 
 
214 aa  347  8e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.417782  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14201  hypothetical protein  50.47 
 
 
217 aa  224  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432496 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10751  hypothetical protein  46.7 
 
 
215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1476  hypothetical protein  44.13 
 
 
218 aa  204  9e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.470823 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0372  SAM-dependent methyltransferase  46.63 
 
 
216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118814  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1031  hypothetical protein  45.54 
 
 
217 aa  199  3e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0256527  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10541  hypothetical protein  46.15 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.864146  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1009  Methyltransferase type 11  43.54 
 
 
215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00599159  normal  0.0418085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1926  Methyltransferase type 11  44.02 
 
 
213 aa  174  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2938  Methyltransferase type 11  41.71 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16673  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3179  hypothetical protein  41.71 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1330  hypothetical protein  40.19 
 
 
218 aa  166  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1977  hypothetical protein  41.35 
 
 
217 aa  161  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.183577  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2053  methyltransferase type 11  39.73 
 
 
221 aa  156  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37443  predicted protein  37.79 
 
 
279 aa  150  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0385962  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2718  hypothetical protein  35.82 
 
 
217 aa  141  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0525784  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6034  hypothetical protein  37.16 
 
 
211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335724  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1120  hypothetical protein  37.87 
 
 
217 aa  132  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1270  hypothetical protein  36.69 
 
 
217 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1822  Methyltransferase type 11  29.21 
 
 
213 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00574627  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1828  Methyltransferase type 12  31.95 
 
 
412 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  hitchhiker  0.0000267475 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13313  predicted protein  34.31 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0224  hypothetical protein  32.72 
 
 
214 aa  108  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0587288  normal  0.156271 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13458  predicted protein  38.71 
 
 
207 aa  104  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27591  predicted protein  31.88 
 
 
241 aa  104  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.861459  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  31.46 
 
 
350 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1540  methyltransferase type 11  33.12 
 
 
402 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000274527  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1320  Methyltransferase type 11  33.74 
 
 
315 aa  99.8  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.065684 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0445  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 
399 aa  97.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.832039  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4604  predicted protein  31.61 
 
 
209 aa  91.7  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0142714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2330  hypothetical protein  29.24 
 
 
403 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0440768  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0525  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 
237 aa  90.1  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14191  predicted protein  30.11 
 
 
225 aa  89  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3170  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
219 aa  85.1  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0295556  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  25.57 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  26.82 
 
 
206 aa  45.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  34 
 
 
250 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  24.38 
 
 
240 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  21.54 
 
 
246 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
259 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  30.88 
 
 
242 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  23.29 
 
 
253 aa  42  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  20.77 
 
 
258 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.155439 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>