79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0525 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0525  Methyltransferase type 11  100 
 
 
237 aa  470  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6034  hypothetical protein  43.93 
 
 
211 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335724  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2718  hypothetical protein  43.09 
 
 
217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0525784  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1270  hypothetical protein  42.86 
 
 
217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1120  hypothetical protein  43.5 
 
 
217 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  37.14 
 
 
350 aa  129  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1009  Methyltransferase type 11  38.04 
 
 
215 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00599159  normal  0.0418085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1330  hypothetical protein  36.36 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1540  methyltransferase type 11  36.53 
 
 
402 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000274527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1977  hypothetical protein  35.06 
 
 
217 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.183577  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2938  Methyltransferase type 11  38.56 
 
 
216 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16673  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3179  hypothetical protein  38.56 
 
 
216 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1828  Methyltransferase type 12  38.41 
 
 
412 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  hitchhiker  0.0000267475 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37443  predicted protein  38.55 
 
 
279 aa  113  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0385962  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1926  Methyltransferase type 11  38.19 
 
 
213 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14201  hypothetical protein  35.63 
 
 
217 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432496 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1822  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00574627  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1476  hypothetical protein  38.65 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.470823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3170  methyltransferase type 11  35.94 
 
 
219 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0295556  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1320  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
315 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.065684 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0445  Methyltransferase type 11  37.2 
 
 
399 aa  105  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.832039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2330  hypothetical protein  36.31 
 
 
403 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0440768  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1031  hypothetical protein  37.5 
 
 
217 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0256527  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2053  methyltransferase type 11  30.23 
 
 
221 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27591  predicted protein  31.67 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.861459  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13391  hypothetical protein  29.8 
 
 
214 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.417782  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13313  predicted protein  35.21 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10751  hypothetical protein  33.13 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13601  hypothetical protein  28.48 
 
 
212 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0224  hypothetical protein  32.73 
 
 
214 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0587288  normal  0.156271 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10541  hypothetical protein  29.66 
 
 
216 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.864146  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4604  predicted protein  34.64 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0142714  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14191  predicted protein  28.18 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13691  hypothetical protein  29.09 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0487979  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1268  hypothetical protein  28.48 
 
 
212 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.391733  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0372  SAM-dependent methyltransferase  29.66 
 
 
216 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118814  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13458  predicted protein  37.61 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51541  methionine-dependent methyltransferase  27.34 
 
 
214 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  42.59 
 
 
279 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 
246 aa  48.9  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 
1106 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  38.4 
 
 
307 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  46.15 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
634 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 
265 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  47.06 
 
 
281 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  44.68 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  23.89 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1843  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  53.49 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0401  Methyltransferase type 11  46.67 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  30.1 
 
 
259 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 
283 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
275 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.46 
 
 
229 aa  43.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  36.7 
 
 
305 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  31.97 
 
 
221 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  36.08 
 
 
197 aa  42.7  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2168  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.61 
 
 
237 aa  42.7  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0691  Methyltransferase type 11  38.95 
 
 
205 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484413  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 
272 aa  42.4  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  33.65 
 
 
255 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  29.59 
 
 
248 aa  42.4  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
267 aa  42.4  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.37 
 
 
206 aa  42.4  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  30.77 
 
 
347 aa  42.4  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  24.12 
 
 
243 aa  42.4  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  30.2 
 
 
216 aa  42.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0442  hypothetical protein  50 
 
 
219 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 
235 aa  42.4  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  47.83 
 
 
269 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  33.94 
 
 
658 aa  42.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  30.95 
 
 
210 aa  42.4  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  42.31 
 
 
264 aa  42  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  34.62 
 
 
255 aa  42  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.07 
 
 
213 aa  41.6  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>