43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_13601 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_13601  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13691  hypothetical protein  89.62 
 
 
212 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0487979  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1268  hypothetical protein  83.49 
 
 
212 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.391733  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13391  hypothetical protein  75.47 
 
 
214 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.417782  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14201  hypothetical protein  51.4 
 
 
217 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432496 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10751  hypothetical protein  48.11 
 
 
215 aa  214  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0372  SAM-dependent methyltransferase  49.04 
 
 
216 aa  209  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118814  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10541  hypothetical protein  48.56 
 
 
216 aa  205  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.864146  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1476  hypothetical protein  44.6 
 
 
218 aa  203  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.470823 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1031  hypothetical protein  46.23 
 
 
217 aa  198  5e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0256527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1009  Methyltransferase type 11  43.13 
 
 
215 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00599159  normal  0.0418085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1926  Methyltransferase type 11  42.45 
 
 
213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3179  hypothetical protein  39.62 
 
 
216 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2938  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 
216 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16673  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1977  hypothetical protein  43.27 
 
 
217 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.183577  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1330  hypothetical protein  40.38 
 
 
218 aa  166  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37443  predicted protein  38.25 
 
 
279 aa  155  4e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0385962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2053  methyltransferase type 11  38.81 
 
 
221 aa  155  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6034  hypothetical protein  37.11 
 
 
211 aa  141  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335724  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2718  hypothetical protein  37.28 
 
 
217 aa  137  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0525784  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1120  hypothetical protein  37.65 
 
 
217 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1270  hypothetical protein  37.28 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1822  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 
213 aa  118  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00574627  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13313  predicted protein  38.71 
 
 
229 aa  115  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27591  predicted protein  32.69 
 
 
241 aa  114  8.999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.861459  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1540  methyltransferase type 11  35 
 
 
402 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000274527  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1828  Methyltransferase type 12  31.36 
 
 
412 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  hitchhiker  0.0000267475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0224  hypothetical protein  32.1 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0587288  normal  0.156271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0445  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
399 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.832039  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  31.25 
 
 
350 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13458  predicted protein  29.61 
 
 
207 aa  102  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1320  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
315 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.065684 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2330  hypothetical protein  30.17 
 
 
403 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0440768  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4604  predicted protein  32.18 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0142714  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3170  methyltransferase type 11  28.5 
 
 
219 aa  92.4  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0295556  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0525  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14191  predicted protein  28.98 
 
 
225 aa  88.2  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  27.33 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  25.7 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
242 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
240 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  32.73 
 
 
259 aa  41.6  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  34.69 
 
 
250 aa  41.6  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>