72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0224 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0224  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  433  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0587288  normal  0.156271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1540  methyltransferase type 11  46.67 
 
 
402 aa  186  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000274527  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1822  Methyltransferase type 11  45.02 
 
 
213 aa  171  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00574627  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0445  Methyltransferase type 11  42.57 
 
 
399 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.832039  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1009  Methyltransferase type 11  43.13 
 
 
215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00599159  normal  0.0418085 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  42.03 
 
 
350 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1926  Methyltransferase type 11  43.33 
 
 
213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3179  hypothetical protein  42.65 
 
 
216 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1977  hypothetical protein  41.63 
 
 
217 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.183577  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1828  Methyltransferase type 12  43.06 
 
 
412 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  hitchhiker  0.0000267475 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2938  Methyltransferase type 11  42.18 
 
 
216 aa  158  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16673  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1320  Methyltransferase type 11  41.15 
 
 
315 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.065684 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13313  predicted protein  38.32 
 
 
229 aa  152  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1330  hypothetical protein  39.13 
 
 
218 aa  148  8e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27591  predicted protein  38.21 
 
 
241 aa  147  9e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.861459  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3170  methyltransferase type 11  43.09 
 
 
219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0295556  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2053  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
221 aa  142  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37443  predicted protein  42.94 
 
 
279 aa  142  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0385962  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13458  predicted protein  35.78 
 
 
207 aa  138  7.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2330  hypothetical protein  36.06 
 
 
403 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0440768  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6034  hypothetical protein  35.81 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335724  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4604  predicted protein  39.23 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0142714  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1120  hypothetical protein  35.78 
 
 
217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1270  hypothetical protein  39.26 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13691  hypothetical protein  34.57 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0487979  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2718  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0525784  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1476  hypothetical protein  34.42 
 
 
218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.470823 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14201  hypothetical protein  31.46 
 
 
217 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432496 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13601  hypothetical protein  32.1 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1268  hypothetical protein  32.72 
 
 
212 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.391733  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1031  hypothetical protein  34.13 
 
 
217 aa  108  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0256527  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0372  SAM-dependent methyltransferase  29.49 
 
 
216 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118814  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14191  predicted protein  34.26 
 
 
225 aa  106  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13391  hypothetical protein  33.95 
 
 
214 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.417782  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10751  hypothetical protein  32.62 
 
 
215 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10541  hypothetical protein  29.03 
 
 
216 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.864146  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0525  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51541  methionine-dependent methyltransferase  31.65 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  44.9 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  37.66 
 
 
226 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4641  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.26 
 
 
296 aa  45.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
269 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 
236 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 
269 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.46 
 
 
238 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  38.46 
 
 
235 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  38.46 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  25.41 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  24.68 
 
 
226 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  36.73 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  24.34 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.33 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  28.07 
 
 
275 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.93 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  27.08 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0746  Methyltransferase type 11  41.3 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0193664  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0474  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00410704  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  32 
 
 
242 aa  43.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0288  Methyltransferase type 11  25.45 
 
 
215 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.03 
 
 
250 aa  42.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
199 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  44.19 
 
 
200 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2171  hypothetical protein  39.13 
 
 
254 aa  42.4  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  44.19 
 
 
200 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  26.87 
 
 
237 aa  42  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  44.19 
 
 
206 aa  42  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  27.14 
 
 
210 aa  41.6  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 
264 aa  41.6  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  46.51 
 
 
207 aa  41.6  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
228 aa  41.6  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  24.81 
 
 
287 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  34.04 
 
 
347 aa  41.6  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>