46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1031 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1031  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  450  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0256527  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1476  hypothetical protein  81.86 
 
 
218 aa  372  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.470823 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10751  hypothetical protein  75 
 
 
215 aa  314  7e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14201  hypothetical protein  58.85 
 
 
217 aa  262  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432496 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0372  SAM-dependent methyltransferase  49.76 
 
 
216 aa  231  5e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118814  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10541  hypothetical protein  49.29 
 
 
216 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.864146  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1330  hypothetical protein  51.92 
 
 
218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13391  hypothetical protein  46.98 
 
 
214 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.417782  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13691  hypothetical protein  47.42 
 
 
212 aa  205  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0487979  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1268  hypothetical protein  45.54 
 
 
212 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.391733  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13601  hypothetical protein  46.23 
 
 
212 aa  198  5e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3179  hypothetical protein  47.64 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1926  Methyltransferase type 11  47.17 
 
 
213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2938  Methyltransferase type 11  47.64 
 
 
216 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16673  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1009  Methyltransferase type 11  47.64 
 
 
215 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00599159  normal  0.0418085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1977  hypothetical protein  47.17 
 
 
217 aa  193  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.183577  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2053  methyltransferase type 11  45.41 
 
 
221 aa  185  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37443  predicted protein  42.47 
 
 
279 aa  178  7e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0385962  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1120  hypothetical protein  46.73 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1270  hypothetical protein  47.24 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6034  hypothetical protein  46.73 
 
 
211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335724  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2718  hypothetical protein  43.78 
 
 
217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0525784  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1822  Methyltransferase type 11  36.14 
 
 
213 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00574627  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27591  predicted protein  35.24 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.861459  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  40.57 
 
 
350 aa  129  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1828  Methyltransferase type 12  46.58 
 
 
412 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  hitchhiker  0.0000267475 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13313  predicted protein  35.15 
 
 
229 aa  124  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4604  predicted protein  39.47 
 
 
209 aa  122  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0142714  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13458  predicted protein  36.36 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1320  Methyltransferase type 11  36.15 
 
 
315 aa  115  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.065684 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1540  methyltransferase type 11  41.33 
 
 
402 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000274527  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14191  predicted protein  35.23 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0445  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 
399 aa  108  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.832039  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0224  hypothetical protein  34.13 
 
 
214 aa  108  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0587288  normal  0.156271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3170  methyltransferase type 11  33.49 
 
 
219 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0295556  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2330  hypothetical protein  32.74 
 
 
403 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0440768  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0525  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
237 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
312 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1485  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000041456 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51541  methionine-dependent methyltransferase  23.35 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 
1476 aa  42.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  40 
 
 
259 aa  42.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  39.53 
 
 
258 aa  42  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  40 
 
 
246 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  40 
 
 
258 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  40 
 
 
250 aa  41.6  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>