More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3483 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3483  response regulator receiver protein  100 
 
 		 115 aa  231  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000485228  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2598  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1861  two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000248634  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.14 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 1936 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01211  response regulator of RpoS  34.62 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480052  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 1937 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1943  response regulator of RpoS  35.58 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.941531 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1384  response regulator of RpoS  34.62 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.421294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01221  hypothetical protein  34.62 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2392  response regulator of RpoS  34.62 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000237009 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  35.4 
 
 		 1937 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1343  response regulator of RpoS  34.62 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00109338  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1575  response regulator of RpoS  35.58 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.307447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1400  response regulator of RpoS  34.62 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1906  response regulator of RpoS  34.62 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174648  normal  0.215745 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1880  response regulator of RpoS  35.58 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.239117  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1886  response regulator of RpoS  35.58 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0489347  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1392  response regulator of RpoS  35.58 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1720  response regulator of RpoS  34.62 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.43 
 
 		 318 aa  68.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0095  two component transcriptional regulator  35.78 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 1937 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.19 
 
 		 231 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0337  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 139 aa  67  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2635  response regulator receiver domain-containing protein  39.02 
 
 		 131 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0563539  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 121 aa  67  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  28.83 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  33.63 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2707  response regulator receiver protein  33.65 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.93 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.94 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4236  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.64 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3225  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.58 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0846  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282438 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0435  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.92 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.48 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  35.51 
 
 		 1124 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 		 801 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.78 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  30.48 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2179  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 234 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 		 1122 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  28.7 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 		 936 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0749319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0614  response regulator receiver protein  30.91 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3500  response regulator receiver  29.81 
 
 		 356 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  31.19 
 
 		 248 aa  63.5  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2721  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2816  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.815193  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  31.58 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  31.48 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2092  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04836  two-component system regulatory protein  35.85 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  30.19 
 
 		 764 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  31.48 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1370  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 119 aa  62  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  30.48 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1693  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.56 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003077  autoinducer 1 sensor kinase/phosphatase luxN  31.82 
 
 		 846 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3767  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0858272 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  32.5 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0497  putative PAS/PAC sensor protein  31.53 
 
 		 574 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.710767  normal  0.476938 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  28.95 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  31.19 
 
 		 259 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 392 aa  61.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 255 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  30.84 
 
 		 934 aa  61.6  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  32.2 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1814  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 566 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267062 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 756 aa  62  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01450  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.41 
 
 		 320 aa  61.6  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.610434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5611  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.64 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.736991 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  28.18 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 1130 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  31.19 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2944  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.88 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  0.70587 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0736  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 1074 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  29.73 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 1609 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02766  histidine kinase  30.36 
 
 		 849 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0549  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>