More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1539 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  100 
 
 
368 aa  719    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  52.8 
 
 
370 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  52.51 
 
 
357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  53.69 
 
 
366 aa  325  9e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  51.66 
 
 
372 aa  324  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  46.76 
 
 
362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  51.62 
 
 
370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  46.22 
 
 
363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  47.45 
 
 
363 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  47 
 
 
361 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  47.45 
 
 
363 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  47 
 
 
361 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  46.69 
 
 
361 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  44.57 
 
 
361 aa  289  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  46.81 
 
 
348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  45.43 
 
 
361 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  46.86 
 
 
364 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  47.76 
 
 
363 aa  281  9e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  45.13 
 
 
361 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  45.13 
 
 
361 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  45.81 
 
 
350 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  45.59 
 
 
350 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  41.82 
 
 
367 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  44.21 
 
 
364 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  44.78 
 
 
350 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  40.34 
 
 
361 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  43.99 
 
 
353 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  40.84 
 
 
363 aa  242  9e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  41.6 
 
 
353 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  43.63 
 
 
353 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  38.63 
 
 
365 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  38.63 
 
 
351 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  38.46 
 
 
332 aa  210  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  39.35 
 
 
335 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  33.84 
 
 
329 aa  195  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  33.82 
 
 
353 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  34.11 
 
 
365 aa  189  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  36.81 
 
 
338 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  34.57 
 
 
326 aa  179  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  34.45 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  37.21 
 
 
329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  36.36 
 
 
330 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  36.36 
 
 
330 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  37.93 
 
 
330 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  34.34 
 
 
330 aa  153  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  32.24 
 
 
329 aa  150  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  33.93 
 
 
328 aa  149  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  27.99 
 
 
331 aa  146  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  32.44 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  30.12 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  28.98 
 
 
330 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  28.67 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  31.19 
 
 
332 aa  117  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  28.32 
 
 
332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  26.46 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  29.41 
 
 
335 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  29.41 
 
 
335 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  29.07 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  33.66 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  29.07 
 
 
335 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  28.08 
 
 
335 aa  106  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  27.89 
 
 
332 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00480  catalase  27.57 
 
 
689 aa  89  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.954008  normal  0.80551 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1165  catalase  28.52 
 
 
693 aa  88.6  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1662  Catalase  27.63 
 
 
705 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.768308 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1465  Catalase  27.85 
 
 
704 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12821  normal  0.432634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3597  Catalase  27.45 
 
 
694 aa  86.3  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4123  catalase  27.87 
 
 
705 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283917  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  27.89 
 
 
507 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2125  Catalase  26.42 
 
 
555 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0020  Catalase  25.08 
 
 
552 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0935072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  27.16 
 
 
513 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  25.66 
 
 
684 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5497  Catalase  25.17 
 
 
552 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  26.56 
 
 
675 aa  83.2  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0570  putative catalase  24.67 
 
 
695 aa  83.2  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0605334  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3162  catalase  27.63 
 
 
801 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271055  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  29.06 
 
 
516 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  29.06 
 
 
511 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0211  catalase  26.47 
 
 
701 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.247073 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  29.06 
 
 
505 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0466  catalase precursor  27.9 
 
 
562 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2924  Catalase  28.57 
 
 
733 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0605396  normal  0.825908 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  29.06 
 
 
511 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2003  catalase  26.64 
 
 
728 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  28.04 
 
 
517 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1356  catalase  27.42 
 
 
704 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  29.06 
 
 
511 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  29.37 
 
 
303 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  25.79 
 
 
527 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  27.67 
 
 
513 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  26.67 
 
 
506 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  26.67 
 
 
506 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  28 
 
 
513 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4342  catalase  26.47 
 
 
695 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.631099  normal  0.0151111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  26.09 
 
 
554 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0560  catalase  24.34 
 
 
695 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5326  catalase C  26.85 
 
 
718 aa  79.7  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  27.18 
 
 
509 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3625  catalase  26.91 
 
 
705 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0284483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>