More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3173 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  97.71 
 
 
351 aa  699    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  100 
 
 
365 aa  754    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  51.03 
 
 
363 aa  338  5.9999999999999996e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  48.02 
 
 
367 aa  324  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  45.87 
 
 
348 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  44.34 
 
 
362 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  45.43 
 
 
363 aa  281  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  47.74 
 
 
350 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  47.74 
 
 
350 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  47.04 
 
 
350 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  43.43 
 
 
361 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  43.67 
 
 
361 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  46.9 
 
 
364 aa  256  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  42.38 
 
 
363 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  43.67 
 
 
361 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  43.67 
 
 
361 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  42.38 
 
 
363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  43.57 
 
 
361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  43.71 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  43.57 
 
 
361 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  43.57 
 
 
361 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  45.64 
 
 
364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  39.63 
 
 
361 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  42.55 
 
 
366 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  44.1 
 
 
357 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  42.36 
 
 
363 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  43.38 
 
 
370 aa  239  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  41.72 
 
 
372 aa  230  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  39.44 
 
 
353 aa  230  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  38.63 
 
 
368 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  38.54 
 
 
353 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  36.94 
 
 
353 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  37.63 
 
 
353 aa  209  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  36.59 
 
 
365 aa  203  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  37.19 
 
 
335 aa  199  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  35.66 
 
 
338 aa  194  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  34.8 
 
 
329 aa  193  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  35.54 
 
 
332 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  30.28 
 
 
331 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  35.54 
 
 
330 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  34.27 
 
 
326 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  35.05 
 
 
329 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  33.92 
 
 
330 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  34.26 
 
 
330 aa  149  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  31.8 
 
 
330 aa  149  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  33.68 
 
 
330 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  32.64 
 
 
328 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  32.64 
 
 
329 aa  139  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  32.75 
 
 
332 aa  136  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  32.43 
 
 
334 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  33.22 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  29.51 
 
 
335 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  29.17 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  29.51 
 
 
335 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  29.76 
 
 
335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  29.17 
 
 
335 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  30.66 
 
 
332 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  27.92 
 
 
332 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  27.11 
 
 
332 aa  122  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  26.86 
 
 
332 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  29.55 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  30 
 
 
345 aa  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  29.45 
 
 
303 aa  86.7  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08637  Catalase A (EC 1.11.1.6)(Spore-specific catalase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55305]  27.3 
 
 
744 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139422  normal  0.87889 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0128  Catalase  23.55 
 
 
517 aa  70.1  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3024  catalase  24.08 
 
 
459 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2816  catalase  23.75 
 
 
459 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0110804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  26.03 
 
 
512 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3057  catalase  24.24 
 
 
458 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3030  catalase  23.75 
 
 
459 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3059  catalase  24.08 
 
 
458 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.064434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2764  catalase  23.75 
 
 
459 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2747  catalase  24.08 
 
 
458 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0967809  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4001  catalase  23.63 
 
 
487 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  23.97 
 
 
675 aa  67.8  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00480  catalase  25.85 
 
 
689 aa  67.4  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.954008  normal  0.80551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1029  Catalase  24.49 
 
 
682 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4585  Catalase  25.51 
 
 
702 aa  66.6  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  25.09 
 
 
513 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  25.09 
 
 
513 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1574  hypothetical protein  23.53 
 
 
501 aa  66.2  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0310454 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2820  catalase  24.08 
 
 
459 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3991  catalase  25.08 
 
 
713 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.805138  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  25.09 
 
 
513 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  23.26 
 
 
529 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  24.2 
 
 
485 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  23.39 
 
 
695 aa  63.5  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2855  catalase  22.76 
 
 
479 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2003  catalase  25 
 
 
728 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001311  catalase  21.92 
 
 
479 aa  63.2  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  24.22 
 
 
517 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2776  catalase  22.76 
 
 
479 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0518  Catalase  23.65 
 
 
483 aa  62.4  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.309279  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2441  catalase  21.5 
 
 
481 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431026  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0333  Catalase  24.75 
 
 
490 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2220  catalase  21.96 
 
 
459 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000397232 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05192  catalase  22.26 
 
 
478 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1395  catalase  22.41 
 
 
505 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000176487  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0289  catalase  24.41 
 
 
490 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.745578 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3563  catalase domain-containing protein  24.32 
 
 
724 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000309586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>