More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1029 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3261  Catalase  49.29 
 
 
718 aa  652    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal  0.0386597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0501  Catalase  50.38 
 
 
728 aa  650    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01701  hydroperoxidase HPII(III) (catalase)  49.2 
 
 
753 aa  649    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1910  Catalase  49.35 
 
 
753 aa  651    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0115  hydroperoxidase II  48.68 
 
 
711 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368429  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1415  hydroperoxidase II  48.7 
 
 
750 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582031 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2026  hydroperoxidase II  48.7 
 
 
750 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0132  hydroperoxidase II  48.68 
 
 
711 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1813  hydroperoxidase II  49.35 
 
 
753 aa  651    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5263  catalase  50.73 
 
 
716 aa  661    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0803  catalase  52.38 
 
 
665 aa  708    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1029  Catalase  100 
 
 
682 aa  1417    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2273  hydroperoxidase II  49.19 
 
 
713 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878038  hitchhiker  0.00653218 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  52.17 
 
 
661 aa  708    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  51.54 
 
 
684 aa  685    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0747  catalase  52.62 
 
 
661 aa  717    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4605  catalase  66.02 
 
 
675 aa  949    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0344  catalase-2  66.32 
 
 
676 aa  950    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11433  catalase HPII  46.34 
 
 
713 aa  639    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01689  hypothetical protein  49.2 
 
 
753 aa  649    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.437438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0280  hydroperoxidase II  50.66 
 
 
716 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0875  catalase  49.28 
 
 
707 aa  674    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0403513  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1900  hydroperoxidase II  49.35 
 
 
753 aa  650    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.321432 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1459  hydroperoxidase II  49.28 
 
 
753 aa  650    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.401999  normal  0.332659 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1340  hydroperoxidase II  49.56 
 
 
708 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0064  hydroperoxidase II  50.58 
 
 
713 aa  672    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5113  hydroperoxidase II  48.91 
 
 
714 aa  657    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.417353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2389  Catalase  48.1 
 
 
728 aa  649    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106495  normal  0.225734 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0843  catalase  52.25 
 
 
661 aa  704    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5573  Catalase  48.8 
 
 
730 aa  678    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.504668  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1853  hydroperoxidase II  48.7 
 
 
750 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1447  hydroperoxidase II  48.55 
 
 
750 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  48.02 
 
 
724 aa  642    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  52.46 
 
 
665 aa  713    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1215  hydroperoxidase II  50.29 
 
 
707 aa  656    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25778  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2070  hydroperoxidase II  49.28 
 
 
751 aa  640    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.192326 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1712  hydroperoxidase II  48.99 
 
 
752 aa  648    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.806465  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1100  catalase  49.86 
 
 
716 aa  657    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236267  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2991  hydroperoxidase II  49.71 
 
 
708 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112637  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3115  hydroperoxidase II  49.56 
 
 
708 aa  651    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0130  hydroperoxidase II  49.12 
 
 
711 aa  652    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.333336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4585  Catalase  48.55 
 
 
702 aa  654    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2836  catalase  49.51 
 
 
711 aa  660    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339115  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3140  catalase  48.33 
 
 
713 aa  644    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1953  hydroperoxidase II  49.2 
 
 
753 aa  648    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  52.01 
 
 
665 aa  708    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1432  hydroperoxidase II  48.7 
 
 
750 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  52.01 
 
 
665 aa  709    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5392  hydroperoxidase II  50.66 
 
 
710 aa  656    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0123509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4346  Catalase  48.36 
 
 
716 aa  661    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.202786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2450  hydroperoxidase II  49.35 
 
 
753 aa  651    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36810  hydroperoxidase II  47.71 
 
 
709 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3160  hydroperoxidase II  47.94 
 
 
709 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6071  hydroperoxidase II  48.24 
 
 
704 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176367 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1348  hydroperoxidase II  48.24 
 
 
704 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.811061  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6481  hydroperoxidase II  48.24 
 
 
704 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75585  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5310  Catalase  48.01 
 
 
702 aa  624  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3391  Catalase  45.77 
 
 
763 aa  621  1e-176  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135276  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6342  hydroperoxidase II  47.58 
 
 
702 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2949  catalase  47.13 
 
 
709 aa  621  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962169  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5612  hydroperoxidase II  47.58 
 
 
702 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.249149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3481  Catalase  48.74 
 
 
720 aa  615  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2377  hydroperoxidase II  46.45 
 
 
712 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1719  Catalase  45.01 
 
 
753 aa  610  1e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5492  Catalase  47.6 
 
 
690 aa  610  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217923  normal  0.0437244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1993  catalase  46.78 
 
 
729 aa  604  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.219349 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1515  catalase  46.21 
 
 
799 aa  596  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3162  catalase  46.88 
 
 
801 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271055  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0721  catalase  46.82 
 
 
705 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0617  catalase  46.33 
 
 
710 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0211  catalase  46.97 
 
 
701 aa  574  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.247073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2010  Catalase  44.65 
 
 
808 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0590  catalase  45.1 
 
 
794 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3597  Catalase  45.75 
 
 
694 aa  569  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1830  catalase  44.43 
 
 
848 aa  566  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.262631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1465  Catalase  45.78 
 
 
704 aa  568  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12821  normal  0.432634 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4123  catalase  45.68 
 
 
705 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283917  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1356  catalase  45.47 
 
 
704 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3446  catalase  44.87 
 
 
715 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0935756  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1662  Catalase  45.65 
 
 
705 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.768308 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06340  Catalase A, putative  43.14 
 
 
714 aa  559  1e-158  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.778234  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5326  catalase C  45.18 
 
 
718 aa  559  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0604  Catalase  45.67 
 
 
718 aa  561  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.0291393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4216  Catalase  43.56 
 
 
700 aa  560  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3201  catalase  44.71 
 
 
715 aa  561  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1165  catalase  45.35 
 
 
693 aa  558  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  44.17 
 
 
695 aa  556  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1180  Catalase  45.9 
 
 
704 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.467187  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01967  Catalase  44.74 
 
 
689 aa  555  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.650017  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4342  catalase  45.8 
 
 
695 aa  555  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.631099  normal  0.0151111 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4611  catalase  43.91 
 
 
710 aa  552  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2003  catalase  45.54 
 
 
728 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0560  catalase  44.56 
 
 
695 aa  548  1e-155  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3732  Catalase  45.66 
 
 
705 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  44.77 
 
 
675 aa  545  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3310  catalase  46.61 
 
 
702 aa  547  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253337 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2662  Catalase  46.61 
 
 
702 aa  548  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2311  catalase  45.71 
 
 
737 aa  546  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3625  catalase  45.1 
 
 
705 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0284483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0766  catalase  44.13 
 
 
688 aa  543  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>