More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4585 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5439  catalase  55.84 
 
 
744 aa  663    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.441674  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08637  Catalase A (EC 1.11.1.6)(Spore-specific catalase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55305]  47.85 
 
 
744 aa  637    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139422  normal  0.87889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0501  Catalase  58.26 
 
 
728 aa  777    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01701  hydroperoxidase HPII(III) (catalase)  53.6 
 
 
753 aa  716    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1910  Catalase  53.6 
 
 
753 aa  720    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0115  hydroperoxidase II  57.26 
 
 
711 aa  775    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368429  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6342  hydroperoxidase II  56.96 
 
 
702 aa  765    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1459  hydroperoxidase II  53.31 
 
 
753 aa  716    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.401999  normal  0.332659 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0344  catalase-2  51.16 
 
 
676 aa  702    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3446  catalase  53.71 
 
 
715 aa  683    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0935756  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3115  hydroperoxidase II  58.66 
 
 
708 aa  755    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283199  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0875  catalase  59.94 
 
 
707 aa  836    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0403513  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2202  catalase  52.18 
 
 
748 aa  641    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.366789 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3563  catalase domain-containing protein  53.41 
 
 
724 aa  642    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000309586  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5263  catalase  56.98 
 
 
716 aa  775    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0803  catalase  54.27 
 
 
665 aa  736    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1029  Catalase  48.55 
 
 
682 aa  654    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1447  hydroperoxidase II  52.93 
 
 
750 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  54.66 
 
 
661 aa  739    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1733  Catalase  54.32 
 
 
738 aa  677    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.027105 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6071  hydroperoxidase II  57.93 
 
 
704 aa  754    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176367 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0747  catalase  54.59 
 
 
661 aa  745    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5326  catalase C  52.07 
 
 
718 aa  668    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1432  hydroperoxidase II  53.08 
 
 
750 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2070  hydroperoxidase II  51.01 
 
 
751 aa  697    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.192326 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05600  catalase A, putative  49.5 
 
 
692 aa  648    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06340  Catalase A, putative  51.21 
 
 
714 aa  695    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.778234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0280  hydroperoxidase II  56.55 
 
 
716 aa  768    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1712  hydroperoxidase II  53.22 
 
 
752 aa  710    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.806465  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1465  Catalase  51.71 
 
 
704 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12821  normal  0.432634 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0570  putative catalase  51.42 
 
 
695 aa  650    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0605334  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3140  catalase  54.3 
 
 
713 aa  763    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3597  Catalase  50.29 
 
 
694 aa  650    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2311  catalase  50.37 
 
 
737 aa  647    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1340  hydroperoxidase II  58.66 
 
 
708 aa  763    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2450  hydroperoxidase II  53.75 
 
 
753 aa  721    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1165  catalase  51.21 
 
 
693 aa  664    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0064  hydroperoxidase II  57.12 
 
 
713 aa  781    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1900  hydroperoxidase II  53.75 
 
 
753 aa  719    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.321432 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  52.48 
 
 
695 aa  669    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0130  hydroperoxidase II  54.78 
 
 
711 aa  754    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.333336 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2380  catalase  52.58 
 
 
710 aa  646    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00903929  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  54.35 
 
 
665 aa  739    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2003  catalase  55.2 
 
 
728 aa  655    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0843  catalase  55.06 
 
 
661 aa  735    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2662  Catalase  53.85 
 
 
702 aa  642    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1415  hydroperoxidase II  53.08 
 
 
750 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3160  hydroperoxidase II  55.87 
 
 
709 aa  768    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1515  catalase  58.05 
 
 
799 aa  742    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1356  catalase  53.09 
 
 
704 aa  654    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2026  hydroperoxidase II  52.93 
 
 
750 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2949  catalase  65.38 
 
 
709 aa  898    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962169  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0721  catalase  51.4 
 
 
705 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5248  catalase  53 
 
 
735 aa  659    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.405546  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3625  catalase  50.57 
 
 
705 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0284483 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2377  hydroperoxidase II  54.12 
 
 
712 aa  740    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  56.07 
 
 
724 aa  779    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02109  catalase  53.61 
 
 
701 aa  655    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.75009  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1215  hydroperoxidase II  58.24 
 
 
707 aa  798    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25778  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1853  hydroperoxidase II  53.08 
 
 
750 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0617  catalase  50.74 
 
 
710 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2010  Catalase  56.04 
 
 
808 aa  733    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1100  catalase  54.9 
 
 
716 aa  758    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2273  hydroperoxidase II  57.39 
 
 
713 aa  778    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878038  hitchhiker  0.00653218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3310  catalase  53.85 
 
 
702 aa  642    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253337 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0560  catalase  51.89 
 
 
695 aa  657    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5392  hydroperoxidase II  58.38 
 
 
710 aa  798    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0123509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1896  catalase  54.55 
 
 
710 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0604  Catalase  55.18 
 
 
718 aa  653    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.0291393 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1348  hydroperoxidase II  58.43 
 
 
704 aa  758    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.811061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  54.7 
 
 
665 aa  742    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5060  catalase  55.93 
 
 
744 aa  667    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0766  catalase  48.85 
 
 
688 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2991  hydroperoxidase II  58.66 
 
 
708 aa  755    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112637  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2836  catalase  53.22 
 
 
711 aa  769    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339115  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4605  catalase  51.81 
 
 
675 aa  699    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  60.28 
 
 
684 aa  787    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  48.82 
 
 
675 aa  637    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5612  hydroperoxidase II  57.41 
 
 
702 aa  765    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.249149 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1040  catalase  52.58 
 
 
710 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0689912  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36810  hydroperoxidase II  56.44 
 
 
709 aa  774    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1953  hydroperoxidase II  53.6 
 
 
753 aa  716    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1094  catalase  53.82 
 
 
741 aa  681    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4790  catalase  50.58 
 
 
704 aa  652    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3732  Catalase  50.97 
 
 
705 aa  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6481  hydroperoxidase II  58.43 
 
 
704 aa  758    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75585  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1813  hydroperoxidase II  53.75 
 
 
753 aa  719    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01967  Catalase  50.07 
 
 
689 aa  664    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.650017  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3162  catalase  57.47 
 
 
801 aa  750    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271055  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0211  catalase  51.25 
 
 
701 aa  644    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.247073 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4123  catalase  51.99 
 
 
705 aa  660    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283917  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11433  catalase HPII  52.19 
 
 
713 aa  755    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5113  hydroperoxidase II  55.21 
 
 
714 aa  769    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.417353 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5148  catalase  55.93 
 
 
744 aa  667    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.821029  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3201  catalase  54.86 
 
 
715 aa  696    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0590  catalase  57.12 
 
 
794 aa  745    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0132  hydroperoxidase II  57.26 
 
 
711 aa  776    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  54.34 
 
 
665 aa  738    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3991  catalase  54.55 
 
 
713 aa  649    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.805138  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1830  catalase  52.54 
 
 
848 aa  709    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.262631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>