More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3446 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1459  hydroperoxidase II  50 
 
 
753 aa  652    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.401999  normal  0.332659 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0501  Catalase  52.1 
 
 
728 aa  664    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5573  Catalase  48.69 
 
 
730 aa  661    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.504668  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01701  hydroperoxidase HPII(III) (catalase)  50 
 
 
753 aa  652    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1910  Catalase  50.29 
 
 
753 aa  655    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0115  hydroperoxidase II  53.26 
 
 
711 aa  677    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368429  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1415  hydroperoxidase II  51.19 
 
 
750 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2202  catalase  62.34 
 
 
748 aa  856    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.366789 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2026  hydroperoxidase II  51.34 
 
 
750 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6071  hydroperoxidase II  52.79 
 
 
704 aa  654    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5263  catalase  52.35 
 
 
716 aa  668    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0803  catalase  49.85 
 
 
665 aa  649    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  50 
 
 
665 aa  648    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3261  Catalase  48.99 
 
 
718 aa  644    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal  0.0386597 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  49.55 
 
 
661 aa  644    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  49.7 
 
 
665 aa  646    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0747  catalase  49.7 
 
 
661 aa  654    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01689  hypothetical protein  50 
 
 
753 aa  652    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.437438  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3160  hydroperoxidase II  53.23 
 
 
709 aa  682    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5113  hydroperoxidase II  52.79 
 
 
714 aa  674    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.417353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5310  Catalase  50.94 
 
 
702 aa  653    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0280  hydroperoxidase II  52.3 
 
 
716 aa  661    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3115  hydroperoxidase II  52.82 
 
 
708 aa  677    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283199  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0132  hydroperoxidase II  53.4 
 
 
711 aa  680    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4585  Catalase  53.71 
 
 
702 aa  683    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2450  hydroperoxidase II  50.14 
 
 
753 aa  656    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  49.55 
 
 
665 aa  643    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02220  catalase  59.15 
 
 
739 aa  800    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1340  hydroperoxidase II  52.82 
 
 
708 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0064  hydroperoxidase II  51.47 
 
 
713 aa  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1853  hydroperoxidase II  51.19 
 
 
750 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3481  Catalase  49.79 
 
 
720 aa  640    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0130  hydroperoxidase II  52.95 
 
 
711 aa  672    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.333336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2273  hydroperoxidase II  53.14 
 
 
713 aa  684    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878038  hitchhiker  0.00653218 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0843  catalase  49.85 
 
 
661 aa  648    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  52.61 
 
 
684 aa  665    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1813  hydroperoxidase II  50.14 
 
 
753 aa  654    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1515  catalase  50.29 
 
 
799 aa  637    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4346  Catalase  52.17 
 
 
716 aa  691    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.202786 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2949  catalase  52.71 
 
 
709 aa  684    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962169  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5392  hydroperoxidase II  52.52 
 
 
710 aa  692    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0123509 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2377  hydroperoxidase II  51.08 
 
 
712 aa  682    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  49.72 
 
 
724 aa  658    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6342  hydroperoxidase II  52.27 
 
 
702 aa  668    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1215  hydroperoxidase II  52.91 
 
 
707 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25778  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1733  Catalase  65.09 
 
 
738 aa  894    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.027105 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2924  Catalase  64.38 
 
 
733 aa  851    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0605396  normal  0.825908 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1100  catalase  50.82 
 
 
716 aa  656    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236267  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1953  hydroperoxidase II  50.14 
 
 
753 aa  654    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2991  hydroperoxidase II  52.82 
 
 
708 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112637  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3446  catalase  100 
 
 
715 aa  1464    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0935756  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5492  Catalase  57.34 
 
 
690 aa  681    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217923  normal  0.0437244 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00480  catalase  57.5 
 
 
689 aa  728    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.954008  normal  0.80551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1348  hydroperoxidase II  52.92 
 
 
704 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.811061  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5439  catalase  65.61 
 
 
744 aa  898    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.441674  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5060  catalase  65.9 
 
 
744 aa  902    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1447  hydroperoxidase II  51.19 
 
 
750 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2836  catalase  48.64 
 
 
711 aa  654    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339115  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2517  Catalase  64.88 
 
 
755 aa  895    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.015736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1900  hydroperoxidase II  50.14 
 
 
753 aa  654    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.321432 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5612  hydroperoxidase II  52.42 
 
 
702 aa  668    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.249149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3140  catalase  50.65 
 
 
713 aa  669    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36810  hydroperoxidase II  52.97 
 
 
709 aa  680    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1094  catalase  65.02 
 
 
741 aa  898    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1432  hydroperoxidase II  51.19 
 
 
750 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6481  hydroperoxidase II  52.92 
 
 
704 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75585  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2070  hydroperoxidase II  47.63 
 
 
751 aa  652    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.192326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2389  Catalase  51.37 
 
 
728 aa  687    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106495  normal  0.225734 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0875  catalase  49.28 
 
 
707 aa  666    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0403513  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11433  catalase HPII  47.62 
 
 
713 aa  668    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14080  catalase  62.54 
 
 
762 aa  861    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651811  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5148  catalase  65.9 
 
 
744 aa  902    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.821029  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3201  catalase  87.39 
 
 
715 aa  1300    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1712  hydroperoxidase II  49.15 
 
 
752 aa  665    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.806465  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31810  catalase  61.04 
 
 
738 aa  835    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3162  catalase  52.82 
 
 
801 aa  657    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271055  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0344  catalase-2  46.13 
 
 
676 aa  622  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0590  catalase  49.38 
 
 
794 aa  624  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4605  catalase  46.58 
 
 
675 aa  623  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1993  catalase  47.61 
 
 
729 aa  622  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.219349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2010  Catalase  50.3 
 
 
808 aa  619  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1830  catalase  49.2 
 
 
848 aa  620  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.262631 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3597  Catalase  49.93 
 
 
694 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  47.45 
 
 
695 aa  614  9.999999999999999e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4611  catalase  50.38 
 
 
710 aa  609  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0211  catalase  48.19 
 
 
701 aa  602  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.247073 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3391  Catalase  47.31 
 
 
763 aa  601  1e-170  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135276  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4123  catalase  48.88 
 
 
705 aa  593  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283917  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1465  Catalase  47.92 
 
 
704 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12821  normal  0.432634 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1165  catalase  48.43 
 
 
693 aa  588  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1662  Catalase  47.53 
 
 
705 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.768308 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1719  Catalase  45.79 
 
 
753 aa  590  1e-167  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1040  catalase  47.94 
 
 
710 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0689912  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5248  catalase  48.73 
 
 
735 aa  585  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.405546  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2380  catalase  48.08 
 
 
710 aa  588  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00903929  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0721  catalase  48.29 
 
 
705 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0560  catalase  46.25 
 
 
695 aa  585  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0766  catalase  46.82 
 
 
688 aa  585  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4216  Catalase  48.19 
 
 
700 aa  588  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3625  catalase  48.43 
 
 
705 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0284483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>