More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14080 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2389  Catalase  49.86 
 
 		 728 aa  663    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106495  normal  0.225734 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2924  Catalase  67.58 
 
 		 733 aa  947    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0605396  normal  0.825908 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3115  hydroperoxidase II  49.86 
 
 		 708 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283199  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00480  catalase  54.68 
 
 		 689 aa  714    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.954008  normal  0.80551 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02220  catalase  60.88 
 
 		 739 aa  867    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1733  Catalase  67.71 
 
 		 738 aa  989    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.027105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4346  Catalase  49.24 
 
 		 716 aa  651    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.202786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14080  catalase  100 
 
 		 762 aa  1548    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1340  hydroperoxidase II  49.86 
 
 		 708 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2517  Catalase  68.9 
 
 		 755 aa  989    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.015736  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31810  catalase  63.03 
 
 		 738 aa  917    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3140  catalase  48.58 
 
 		 713 aa  652    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2949  catalase  52.17 
 
 		 709 aa  650    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962169  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11433  catalase HPII  46.07 
 
 		 713 aa  635    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5492  Catalase  52.08 
 
 		 690 aa  639    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217923  normal  0.0437244 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1215  hydroperoxidase II  49.72 
 
 		 707 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25778  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2202  catalase  64.5 
 
 		 748 aa  951    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.366789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5573  Catalase  48.59 
 
 		 730 aa  635    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.504668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5060  catalase  61.49 
 
 		 744 aa  916    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3446  catalase  62.54 
 
 		 715 aa  861    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0935756  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1094  catalase  66.58 
 
 		 741 aa  1002    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5392  hydroperoxidase II  47.81 
 
 		 710 aa  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0123509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4585  Catalase  50.63 
 
 		 702 aa  642    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5148  catalase  61.49 
 
 		 744 aa  916    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.821029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3201  catalase  62.61 
 
 		 715 aa  864    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2991  hydroperoxidase II  49.86 
 
 		 708 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112637  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5439  catalase  61.62 
 
 		 744 aa  917    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.441674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6342  hydroperoxidase II  48.46 
 
 		 702 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5113  hydroperoxidase II  49.56 
 
 		 714 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.417353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0132  hydroperoxidase II  49.79 
 
 		 711 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0115  hydroperoxidase II  49.64 
 
 		 711 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5612  hydroperoxidase II  48.26 
 
 		 702 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.249149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2273  hydroperoxidase II  49.71 
 
 		 713 aa  627  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878038  hitchhiker  0.00653218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0064  hydroperoxidase II  49.64 
 
 		 713 aa  628  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3160  hydroperoxidase II  50.66 
 
 		 709 aa  628  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1853  hydroperoxidase II  48.94 
 
 		 750 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36810  hydroperoxidase II  50.52 
 
 		 709 aa  628  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1415  hydroperoxidase II  48.94 
 
 		 750 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582031 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1432  hydroperoxidase II  49.08 
 
 		 750 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1813  hydroperoxidase II  48.85 
 
 		 753 aa  623  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01701  hydroperoxidase HPII(III) (catalase)  48.85 
 
 		 753 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1910  Catalase  48.99 
 
 		 753 aa  624  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2026  hydroperoxidase II  48.51 
 
 		 750 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01689  hypothetical protein  48.85 
 
 		 753 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.437438  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1447  hydroperoxidase II  48.8 
 
 		 750 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2450  hydroperoxidase II  48.92 
 
 		 753 aa  624  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2377  hydroperoxidase II  48.37 
 
 		 712 aa  622  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1900  hydroperoxidase II  48.85 
 
 		 753 aa  624  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.321432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2836  catalase  47.18 
 
 		 711 aa  625  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1953  hydroperoxidase II  48.85 
 
 		 753 aa  623  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0130  hydroperoxidase II  49.71 
 
 		 711 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333336 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1459  hydroperoxidase II  48.78 
 
 		 753 aa  620  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.401999  normal  0.332659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5310  Catalase  48.85 
 
 		 702 aa  619  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6071  hydroperoxidase II  49.71 
 
 		 704 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.176367 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1348  hydroperoxidase II  49.36 
 
 		 704 aa  622  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.811061  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6481  hydroperoxidase II  49.36 
 
 		 704 aa  622  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75585  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5263  catalase  49.19 
 
 		 716 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0875  catalase  49.32 
 
 		 707 aa  616  1e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0403513  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0280  hydroperoxidase II  49.41 
 
 		 716 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2070  hydroperoxidase II  46.49 
 
 		 751 aa  613  9.999999999999999e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.192326 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1515  catalase  45.88 
 
 		 799 aa  611  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1712  hydroperoxidase II  47.73 
 
 		 752 aa  612  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.806465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3162  catalase  47.78 
 
 		 801 aa  611  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0501  Catalase  50.46 
 
 		 728 aa  606  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3481  Catalase  51.02 
 
 		 720 aa  606  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2010  Catalase  49.27 
 
 		 808 aa  608  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1100  catalase  48.47 
 
 		 716 aa  607  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236267  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0590  catalase  47.56 
 
 		 794 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1830  catalase  46.5 
 
 		 848 aa  606  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.262631 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  46.46 
 
 		 665 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3261  Catalase  46 
 
 		 718 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal  0.0386597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  46.92 
 
 		 724 aa  604  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  48.7 
 
 		 695 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  46.14 
 
 		 665 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0803  catalase  46.14 
 
 		 665 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  45.99 
 
 		 661 aa  600  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0747  catalase  46.1 
 
 		 661 aa  602  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0843  catalase  46.14 
 
 		 661 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  46.14 
 
 		 665 aa  600  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  47.36 
 
 		 684 aa  595  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0344  catalase-2  44.62 
 
 		 676 aa  588  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4605  catalase  44.77 
 
 		 675 aa  590  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0211  catalase  49.35 
 
 		 701 aa  586  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.247073 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0560  catalase  46.36 
 
 		 695 aa  584  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3597  Catalase  47.61 
 
 		 694 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3391  Catalase  45.8 
 
 		 763 aa  580  1e-164  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135276  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0570  putative catalase  45.8 
 
 		 695 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0605334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4216  Catalase  47.86 
 
 		 700 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0721  catalase  47.08 
 
 		 705 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1465  Catalase  46.42 
 
 		 704 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12821  normal  0.432634 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2003  catalase  48.46 
 
 		 728 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3732  Catalase  47.64 
 
 		 705 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1719  Catalase  44.99 
 
 		 753 aa  570  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1165  catalase  46.33 
 
 		 693 aa  569  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1662  Catalase  45.56 
 
 		 705 aa  571  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.768308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0617  catalase  46.12 
 
 		 710 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5248  catalase  45.92 
 
 		 735 aa  569  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.405546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1356  catalase  47.66 
 
 		 704 aa  565  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01967  Catalase  47.55 
 
 		 689 aa  566  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.650017  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1040  catalase  54.11 
 
 		 710 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0689912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>