More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5248 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1040  catalase  66.96 
 
 		 710 aa  939    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0689912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2010  Catalase  52.05 
 
 		 808 aa  709    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0501  Catalase  54.32 
 
 		 728 aa  680    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01701  hydroperoxidase HPII(III) (catalase)  49.93 
 
 		 753 aa  671    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1910  Catalase  50.07 
 
 		 753 aa  674    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0115  hydroperoxidase II  53.8 
 
 		 711 aa  681    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1432  hydroperoxidase II  49.86 
 
 		 750 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3160  hydroperoxidase II  53.58 
 
 		 709 aa  660    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5310  Catalase  51.32 
 
 		 702 aa  651    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4585  Catalase  53 
 
 		 702 aa  671    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  50 
 
 		 665 aa  636    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4216  Catalase  71.43 
 
 		 700 aa  1013    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2991  hydroperoxidase II  51.13 
 
 		 708 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112637  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0604  Catalase  69.76 
 
 		 718 aa  1003    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.0291393 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1459  hydroperoxidase II  49.8 
 
 		 753 aa  670    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.401999  normal  0.332659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5263  catalase  50.97 
 
 		 716 aa  662    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02109  catalase  59.5 
 
 		 701 aa  813    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.75009  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6342  hydroperoxidase II  51.94 
 
 		 702 aa  665    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0747  catalase  49.85 
 
 		 661 aa  639    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5326  catalase C  71.53 
 
 		 718 aa  1009    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5392  hydroperoxidase II  52.28 
 
 		 710 aa  680    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0123509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1180  Catalase  60 
 
 		 704 aa  813    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.467187  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3261  Catalase  53.89 
 
 		 718 aa  682    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal  0.0386597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4346  Catalase  52.47 
 
 		 716 aa  699    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.202786 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0280  hydroperoxidase II  51.27 
 
 		 716 aa  657    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0130  hydroperoxidase II  53.43 
 
 		 711 aa  690    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1853  hydroperoxidase II  49.86 
 
 		 750 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0570  putative catalase  59.42 
 
 		 695 aa  806    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0605334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0132  hydroperoxidase II  53.95 
 
 		 711 aa  684    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1465  Catalase  70.21 
 
 		 704 aa  1029    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12821  normal  0.432634 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2311  catalase  59.63 
 
 		 737 aa  811    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1340  hydroperoxidase II  51.27 
 
 		 708 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1900  hydroperoxidase II  49.93 
 
 		 753 aa  671    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.321432 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1165  catalase  72.46 
 
 		 693 aa  1036    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0064  hydroperoxidase II  52.22 
 
 		 713 aa  670    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  69.43 
 
 		 675 aa  957    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3115  hydroperoxidase II  51.13 
 
 		 708 aa  663    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283199  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6071  hydroperoxidase II  52.12 
 
 		 704 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.176367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2380  catalase  67.1 
 
 		 710 aa  941    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00903929  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4790  catalase  71.2 
 
 		 704 aa  999    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5573  Catalase  51.73 
 
 		 730 aa  672    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.504668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3732  Catalase  72.89 
 
 		 705 aa  1032    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1953  hydroperoxidase II  49.8 
 
 		 753 aa  669    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1515  catalase  52.11 
 
 		 799 aa  703    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1356  catalase  69.55 
 
 		 704 aa  981    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0590  catalase  54.71 
 
 		 794 aa  710    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2949  catalase  54.55 
 
 		 709 aa  651    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962169  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0721  catalase  69.65 
 
 		 705 aa  990    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2003  catalase  62.5 
 
 		 728 aa  815    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3625  catalase  71.63 
 
 		 705 aa  1040    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0284483 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2377  hydroperoxidase II  51.08 
 
 		 712 aa  663    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  53.57 
 
 		 724 aa  657    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1896  catalase  66.96 
 
 		 710 aa  920    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1215  hydroperoxidase II  51.5 
 
 		 707 aa  681    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25778  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01967  Catalase  68.66 
 
 		 689 aa  1000    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.650017  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0617  catalase  70 
 
 		 710 aa  1001    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5113  hydroperoxidase II  53.65 
 
 		 714 aa  695    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.417353 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1100  catalase  51.63 
 
 		 716 aa  665    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236267  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3597  Catalase  63.46 
 
 		 694 aa  857    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3563  catalase domain-containing protein  58.96 
 
 		 724 aa  762    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000309586  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0560  catalase  58.98 
 
 		 695 aa  806    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1415  hydroperoxidase II  49.86 
 
 		 750 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582031 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2026  hydroperoxidase II  49.73 
 
 		 750 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2450  hydroperoxidase II  50.07 
 
 		 753 aa  674    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1348  hydroperoxidase II  51.88 
 
 		 704 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.811061  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  58.92 
 
 		 695 aa  813    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1662  Catalase  69.73 
 
 		 705 aa  1031    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.768308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0766  catalase  69.39 
 
 		 688 aa  1006    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3140  catalase  53.33 
 
 		 713 aa  704    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2836  catalase  53.07 
 
 		 711 aa  698    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5248  catalase  100 
 
 		 735 aa  1492    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.405546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2273  hydroperoxidase II  51.79 
 
 		 713 aa  666    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878038  hitchhiker  0.00653218 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1813  hydroperoxidase II  49.93 
 
 		 753 aa  673    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5612  hydroperoxidase II  50.85 
 
 		 702 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.249149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1447  hydroperoxidase II  49.73 
 
 		 750 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36810  hydroperoxidase II  52.84 
 
 		 709 aa  654    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3481  Catalase  54.63 
 
 		 720 aa  655    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2389  Catalase  51.24 
 
 		 728 aa  705    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106495  normal  0.225734 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3310  catalase  60.28 
 
 		 702 aa  806    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253337 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4123  catalase  72.26 
 
 		 705 aa  1018    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6481  hydroperoxidase II  51.88 
 
 		 704 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2070  hydroperoxidase II  51.47 
 
 		 751 aa  691    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.192326 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2662  Catalase  60.28 
 
 		 702 aa  806    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1712  hydroperoxidase II  50.79 
 
 		 752 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.806465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0875  catalase  50.07 
 
 		 707 aa  640    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0403513  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4342  catalase  59.6 
 
 		 695 aa  794    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.631099  normal  0.0151111 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4611  catalase  60.06 
 
 		 710 aa  801    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3162  catalase  56 
 
 		 801 aa  715    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01689  hypothetical protein  49.93 
 
 		 753 aa  671    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.437438  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11433  catalase HPII  50.15 
 
 		 713 aa  662    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0211  catalase  62.94 
 
 		 701 aa  856    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.247073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5492  Catalase  57.86 
 
 		 690 aa  670    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217923  normal  0.0437244 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3991  catalase  62.61 
 
 		 713 aa  828    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.805138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1830  catalase  52.18 
 
 		 848 aa  711    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.262631 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  50 
 
 		 665 aa  634  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  49.41 
 
 		 661 aa  634  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  49.12 
 
 		 665 aa  634  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0803  catalase  49.7 
 
 		 665 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0843  catalase  49.7 
 
 		 661 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  51.92 
 
 		 684 aa  628  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>