More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2836 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_2273  hydroperoxidase II  53.34 
 
 
713 aa  743    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878038  hitchhiker  0.00653218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1662  Catalase  51.64 
 
 
705 aa  695    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.768308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2010  Catalase  56.64 
 
 
808 aa  785    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01701  hydroperoxidase HPII(III) (catalase)  51.26 
 
 
753 aa  728    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1910  Catalase  51.26 
 
 
753 aa  728    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0115  hydroperoxidase II  58.77 
 
 
711 aa  829    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368429  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3446  catalase  48.64 
 
 
715 aa  654    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0935756  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4605  catalase  50.43 
 
 
675 aa  724    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  54.43 
 
 
665 aa  741    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  54.43 
 
 
665 aa  741    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6071  hydroperoxidase II  54.21 
 
 
704 aa  743    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176367 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5248  catalase  53.07 
 
 
735 aa  692    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.405546  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0132  hydroperoxidase II  58.77 
 
 
711 aa  830    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  53.82 
 
 
695 aa  713    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5439  catalase  48.33 
 
 
744 aa  640    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.441674  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5263  catalase  57.51 
 
 
716 aa  820    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0803  catalase  53.85 
 
 
665 aa  734    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1029  Catalase  49.51 
 
 
682 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2070  hydroperoxidase II  51.19 
 
 
751 aa  732    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.192326 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  53.27 
 
 
661 aa  732    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  51.77 
 
 
684 aa  736    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3160  hydroperoxidase II  54.03 
 
 
709 aa  759    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0747  catalase  54.43 
 
 
661 aa  743    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2662  Catalase  51.97 
 
 
702 aa  680    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4790  catalase  52.43 
 
 
704 aa  678    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1900  hydroperoxidase II  51.54 
 
 
753 aa  729    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.321432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0501  Catalase  60.91 
 
 
728 aa  836    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11433  catalase HPII  60.6 
 
 
713 aa  882    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0280  hydroperoxidase II  58.06 
 
 
716 aa  828    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1040  catalase  52.53 
 
 
710 aa  686    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0689912  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01689  hypothetical protein  51.26 
 
 
753 aa  728    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.437438  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0570  putative catalase  52.03 
 
 
695 aa  696    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0605334  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4123  catalase  53.62 
 
 
705 aa  699    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283917  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2450  hydroperoxidase II  51.26 
 
 
753 aa  728    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2311  catalase  52.63 
 
 
737 aa  699    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1340  hydroperoxidase II  55.4 
 
 
708 aa  765    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01967  Catalase  51.54 
 
 
689 aa  697    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.650017  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1165  catalase  51.26 
 
 
693 aa  705    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0064  hydroperoxidase II  58.9 
 
 
713 aa  831    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1447  hydroperoxidase II  52.1 
 
 
750 aa  731    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3115  hydroperoxidase II  55.11 
 
 
708 aa  758    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283199  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0590  catalase  58.27 
 
 
794 aa  805    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2380  catalase  52.67 
 
 
710 aa  688    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00903929  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0875  catalase  54.43 
 
 
707 aa  799    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0403513  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1813  hydroperoxidase II  51.26 
 
 
753 aa  728    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0843  catalase  53.85 
 
 
661 aa  734    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1733  Catalase  49.57 
 
 
738 aa  644    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.027105 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  52.87 
 
 
665 aa  733    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5326  catalase C  52.66 
 
 
718 aa  680    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1515  catalase  55.41 
 
 
799 aa  778    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1356  catalase  52.25 
 
 
704 aa  679    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0344  catalase-2  50.57 
 
 
676 aa  729    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2949  catalase  53.7 
 
 
709 aa  781    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962169  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0721  catalase  51.53 
 
 
705 aa  679    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1415  hydroperoxidase II  52.24 
 
 
750 aa  733    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3625  catalase  52.21 
 
 
705 aa  688    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0284483 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2377  hydroperoxidase II  56.06 
 
 
712 aa  768    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  58.39 
 
 
724 aa  840    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5392  hydroperoxidase II  58.53 
 
 
710 aa  825    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0123509 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1215  hydroperoxidase II  57.67 
 
 
707 aa  817    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25778  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2026  hydroperoxidase II  52.1 
 
 
750 aa  731    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0617  catalase  51.02 
 
 
710 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1712  hydroperoxidase II  51.68 
 
 
752 aa  736    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.806465  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1100  catalase  54.91 
 
 
716 aa  765    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236267  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1953  hydroperoxidase II  51.4 
 
 
753 aa  731    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3140  catalase  73.05 
 
 
713 aa  1069    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0560  catalase  52.75 
 
 
695 aa  701    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1896  catalase  52.11 
 
 
710 aa  678    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1465  Catalase  53.4 
 
 
704 aa  695    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12821  normal  0.432634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3732  Catalase  52 
 
 
705 aa  688    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1348  hydroperoxidase II  54.49 
 
 
704 aa  743    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.811061  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0604  Catalase  52.39 
 
 
718 aa  703    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.0291393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5060  catalase  48.47 
 
 
744 aa  640    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0766  catalase  53.12 
 
 
688 aa  702    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3563  catalase domain-containing protein  52.15 
 
 
724 aa  683    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000309586  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2836  catalase  100 
 
 
711 aa  1474    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339115  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  51.3 
 
 
675 aa  670    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0130  hydroperoxidase II  59.47 
 
 
711 aa  839    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.333336 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2991  hydroperoxidase II  55.11 
 
 
708 aa  758    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112637  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5612  hydroperoxidase II  54.35 
 
 
702 aa  749    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.249149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5113  hydroperoxidase II  59.52 
 
 
714 aa  845    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.417353 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36810  hydroperoxidase II  54.65 
 
 
709 aa  770    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1094  catalase  50.64 
 
 
741 aa  664    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1853  hydroperoxidase II  52.24 
 
 
750 aa  733    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1459  hydroperoxidase II  50.98 
 
 
753 aa  724    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.401999  normal  0.332659 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6481  hydroperoxidase II  54.49 
 
 
704 aa  743    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75585  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1432  hydroperoxidase II  52.24 
 
 
750 aa  733    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2003  catalase  55.87 
 
 
728 aa  733    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0211  catalase  53.38 
 
 
701 aa  703    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.247073 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3597  Catalase  53.12 
 
 
694 aa  706    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02109  catalase  54.52 
 
 
701 aa  717    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.75009  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4611  catalase  50.15 
 
 
710 aa  658    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4342  catalase  50.14 
 
 
695 aa  667    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.631099  normal  0.0151111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5148  catalase  48.47 
 
 
744 aa  640    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.821029  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3201  catalase  47.62 
 
 
715 aa  661    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3310  catalase  51.97 
 
 
702 aa  680    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253337 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6342  hydroperoxidase II  54.14 
 
 
702 aa  746    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3162  catalase  55.43 
 
 
801 aa  790    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271055  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3991  catalase  53.35 
 
 
713 aa  704    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.805138  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1830  catalase  55.68 
 
 
848 aa  791    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.262631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>