More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0617 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  48.71 
 
 		 665 aa  635    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2010  Catalase  55.85 
 
 		 808 aa  700    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0501  Catalase  52.2 
 
 		 728 aa  684    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01701  hydroperoxidase HPII(III) (catalase)  51.34 
 
 		 753 aa  656    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1910  Catalase  51.41 
 
 		 753 aa  658    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0115  hydroperoxidase II  50 
 
 		 711 aa  679    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01967  Catalase  68.48 
 
 		 689 aa  968    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.650017  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3310  catalase  56.84 
 
 		 702 aa  789    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253337 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1813  hydroperoxidase II  51.34 
 
 		 753 aa  657    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  48.86 
 
 		 665 aa  637    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2070  hydroperoxidase II  50.96 
 
 		 751 aa  688    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.192326 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3140  catalase  50.5 
 
 		 713 aa  676    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1040  catalase  63.93 
 
 		 710 aa  884    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0689912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4790  catalase  68.35 
 
 		 704 aa  984    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5573  Catalase  50.72 
 
 		 730 aa  677    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.504668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5263  catalase  51.47 
 
 		 716 aa  683    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  48.58 
 
 		 665 aa  639    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1853  hydroperoxidase II  50.59 
 
 		 750 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  48.14 
 
 		 661 aa  635    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2389  Catalase  51.37 
 
 		 728 aa  691    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106495  normal  0.225734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1447  hydroperoxidase II  50.44 
 
 		 750 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0747  catalase  48.14 
 
 		 661 aa  639    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1662  Catalase  67.91 
 
 		 705 aa  983    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.768308 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1415  hydroperoxidase II  50.59 
 
 		 750 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582031 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4342  catalase  56.74 
 
 		 695 aa  782    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.631099  normal  0.0151111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5310  Catalase  53.97 
 
 		 702 aa  669    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1180  Catalase  57.61 
 
 		 704 aa  812    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.467187  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0280  hydroperoxidase II  50.77 
 
 		 716 aa  699    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0590  catalase  51.79 
 
 		 794 aa  705    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5326  catalase C  68.69 
 
 		 718 aa  992    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0570  putative catalase  55.83 
 
 		 695 aa  778    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0605334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2450  hydroperoxidase II  51.34 
 
 		 753 aa  658    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1432  hydroperoxidase II  50.59 
 
 		 750 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2311  catalase  58.1 
 
 		 737 aa  830    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1340  hydroperoxidase II  51.04 
 
 		 708 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5492  Catalase  54.39 
 
 		 690 aa  673    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217923  normal  0.0437244 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1165  catalase  70.29 
 
 		 693 aa  1012    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0064  hydroperoxidase II  52.12 
 
 		 713 aa  693    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5392  hydroperoxidase II  51.41 
 
 		 710 aa  673    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0123509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3160  hydroperoxidase II  50.74 
 
 		 709 aa  668    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2662  Catalase  56.84 
 
 		 702 aa  789    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2380  catalase  64.08 
 
 		 710 aa  884    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00903929  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2273  hydroperoxidase II  48.88 
 
 		 713 aa  667    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878038  hitchhiker  0.00653218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3732  Catalase  68.56 
 
 		 705 aa  982    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4585  Catalase  50.74 
 
 		 702 aa  661    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2026  hydroperoxidase II  50.44 
 
 		 750 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0132  hydroperoxidase II  50.14 
 
 		 711 aa  682    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1515  catalase  49.93 
 
 		 799 aa  692    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1356  catalase  78.13 
 
 		 704 aa  1128    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2949  catalase  51.99 
 
 		 709 aa  653    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962169  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0721  catalase  91.04 
 
 		 705 aa  1305    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11433  catalase HPII  47.49 
 
 		 713 aa  637    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3625  catalase  69.24 
 
 		 705 aa  981    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0284483 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2377  hydroperoxidase II  50.07 
 
 		 712 aa  675    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  53.97 
 
 		 724 aa  678    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3115  hydroperoxidase II  50.74 
 
 		 708 aa  660    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283199  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1215  hydroperoxidase II  51.04 
 
 		 707 aa  672    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25778  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0604  Catalase  74.37 
 
 		 718 aa  1078    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.0291393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0617  catalase  100 
 
 		 710 aa  1456    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3563  catalase domain-containing protein  58.3 
 
 		 724 aa  774    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000309586  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1100  catalase  51.19 
 
 		 716 aa  672    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236267  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2991  hydroperoxidase II  50.74 
 
 		 708 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0130  hydroperoxidase II  49.72 
 
 		 711 aa  685    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333336 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0560  catalase  56.12 
 
 		 695 aa  785    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  58.97 
 
 		 695 aa  809    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1465  Catalase  68.48 
 
 		 704 aa  993    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12821  normal  0.432634 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5113  hydroperoxidase II  49.93 
 
 		 714 aa  691    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.417353 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1348  hydroperoxidase II  51.12 
 
 		 704 aa  651    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.811061  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1896  catalase  63.93 
 
 		 710 aa  881    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01689  hypothetical protein  51.34 
 
 		 753 aa  656    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.437438  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0766  catalase  67.6 
 
 		 688 aa  954    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0211  catalase  62.8 
 
 		 701 aa  865    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.247073 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2836  catalase  51.02 
 
 		 711 aa  682    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4123  catalase  69.99 
 
 		 705 aa  996    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02109  catalase  59.03 
 
 		 701 aa  822    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.75009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1953  hydroperoxidase II  51.34 
 
 		 753 aa  657    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5612  hydroperoxidase II  50.6 
 
 		 702 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.249149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36810  hydroperoxidase II  49.37 
 
 		 709 aa  672    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1459  hydroperoxidase II  51.34 
 
 		 753 aa  657    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.401999  normal  0.332659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3481  Catalase  54.18 
 
 		 720 aa  662    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4216  Catalase  71.84 
 
 		 700 aa  1048    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1712  hydroperoxidase II  49.24 
 
 		 752 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.806465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6481  hydroperoxidase II  51.12 
 
 		 704 aa  651    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6342  hydroperoxidase II  48.87 
 
 		 702 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3162  catalase  53.65 
 
 		 801 aa  718    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  67.88 
 
 		 675 aa  944    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2003  catalase  60.74 
 
 		 728 aa  804    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1900  hydroperoxidase II  51.41 
 
 		 753 aa  658    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.321432 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4611  catalase  59.08 
 
 		 710 aa  822    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3597  Catalase  64.23 
 
 		 694 aa  865    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3261  Catalase  51.67 
 
 		 718 aa  685    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal  0.0386597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4346  Catalase  51.67 
 
 		 716 aa  699    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.202786 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6071  hydroperoxidase II  51.26 
 
 		 704 aa  650    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.176367 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5248  catalase  70 
 
 		 735 aa  1003    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.405546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3991  catalase  58.73 
 
 		 713 aa  811    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.805138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1830  catalase  53.74 
 
 		 848 aa  701    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.262631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1993  catalase  47.38 
 
 		 729 aa  636    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.219349 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0843  catalase  48.13 
 
 		 661 aa  632  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0803  catalase  48.71 
 
 		 665 aa  631  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0875  catalase  48.6 
 
 		 707 aa  626  1e-178  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0403513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>