More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2273 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3446  catalase  53.14 
 
 		 715 aa  684    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0935756  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11433  catalase HPII  50.21 
 
 		 713 aa  730    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0501  Catalase  57.91 
 
 		 728 aa  785    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01701  hydroperoxidase HPII(III) (catalase)  60.63 
 
 		 753 aa  848    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1910  Catalase  60.63 
 
 		 753 aa  850    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0115  hydroperoxidase II  63.69 
 
 		 711 aa  918    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01967  Catalase  50.15 
 
 		 689 aa  659    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.650017  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1040  catalase  53.27 
 
 		 710 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0689912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4790  catalase  50.07 
 
 		 704 aa  649    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  62.27 
 
 		 665 aa  694    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2026  hydroperoxidase II  61.26 
 
 		 750 aa  859    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  62.27 
 
 		 665 aa  695    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2003  catalase  54.55 
 
 		 728 aa  720    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3115  hydroperoxidase II  61.35 
 
 		 708 aa  861    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283199  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3563  catalase domain-containing protein  53.11 
 
 		 724 aa  652    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000309586  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5263  catalase  67.28 
 
 		 716 aa  977    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0803  catalase  61.36 
 
 		 665 aa  686    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1029  Catalase  49.19 
 
 		 682 aa  647    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  50.52 
 
 		 675 aa  655    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  62.25 
 
 		 661 aa  689    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  53.86 
 
 		 684 aa  701    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5392  hydroperoxidase II  63.57 
 
 		 710 aa  889    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0123509 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0747  catalase  53.43 
 
 		 661 aa  697    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2662  Catalase  53.81 
 
 		 702 aa  690    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3162  catalase  55.94 
 
 		 801 aa  761    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4605  catalase  50 
 
 		 675 aa  699    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2010  Catalase  54.12 
 
 		 808 aa  743    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5573  Catalase  54.18 
 
 		 730 aa  783    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.504668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0280  hydroperoxidase II  66.86 
 
 		 716 aa  977    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1853  hydroperoxidase II  61.55 
 
 		 750 aa  861    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6342  hydroperoxidase II  61.56 
 
 		 702 aa  863    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0570  putative catalase  50.5 
 
 		 695 aa  693    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0605334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0132  hydroperoxidase II  63.83 
 
 		 711 aa  920    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  62.27 
 
 		 665 aa  693    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2311  catalase  50.93 
 
 		 737 aa  681    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1340  hydroperoxidase II  61.49 
 
 		 708 aa  867    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1813  hydroperoxidase II  60.63 
 
 		 753 aa  850    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1165  catalase  52 
 
 		 693 aa  682    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0064  hydroperoxidase II  67.98 
 
 		 713 aa  1003    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0130  hydroperoxidase II  63.97 
 
 		 711 aa  924    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2273  hydroperoxidase II  100 
 
 		 713 aa  1477    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878038  hitchhiker  0.00653218 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1459  hydroperoxidase II  60.34 
 
 		 753 aa  847    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.401999  normal  0.332659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2380  catalase  53.27 
 
 		 710 aa  645    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00903929  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1432  hydroperoxidase II  61.55 
 
 		 750 aa  861    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4123  catalase  49.28 
 
 		 705 aa  646    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0843  catalase  62.69 
 
 		 661 aa  682    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01689  hypothetical protein  60.63 
 
 		 753 aa  848    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.437438  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5113  hydroperoxidase II  65.36 
 
 		 714 aa  946    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.417353 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1415  hydroperoxidase II  61.41 
 
 		 750 aa  859    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582031 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1515  catalase  54.57 
 
 		 799 aa  756    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1356  catalase  50 
 
 		 704 aa  664    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0875  catalase  54.55 
 
 		 707 aa  769    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0403513  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2949  catalase  56.54 
 
 		 709 aa  759    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962169  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0721  catalase  52.39 
 
 		 705 aa  674    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  53.31 
 
 		 695 aa  722    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3625  catalase  48.81 
 
 		 705 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0284483 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2377  hydroperoxidase II  64.14 
 
 		 712 aa  936    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  55.57 
 
 		 724 aa  774    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1712  hydroperoxidase II  60.78 
 
 		 752 aa  854    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.806465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1215  hydroperoxidase II  62.41 
 
 		 707 aa  893    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25778  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3597  Catalase  50.89 
 
 		 694 aa  684    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0617  catalase  48.88 
 
 		 710 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0344  catalase-2  49.71 
 
 		 676 aa  700    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1100  catalase  61.91 
 
 		 716 aa  902    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236267  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3310  catalase  53.81 
 
 		 702 aa  689    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0590  catalase  55.86 
 
 		 794 aa  751    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0560  catalase  50.79 
 
 		 695 aa  696    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3140  catalase  53.3 
 
 		 713 aa  739    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1900  hydroperoxidase II  60.49 
 
 		 753 aa  848    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.321432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3732  Catalase  49.51 
 
 		 705 aa  660    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1348  hydroperoxidase II  62.37 
 
 		 704 aa  868    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.811061  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5492  Catalase  57.96 
 
 		 690 aa  754    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217923  normal  0.0437244 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1180  Catalase  52.92 
 
 		 704 aa  707    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.467187  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0766  catalase  49.85 
 
 		 688 aa  657    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02109  catalase  53.72 
 
 		 701 aa  707    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.75009  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2836  catalase  53.34 
 
 		 711 aa  743    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2389  Catalase  54.66 
 
 		 728 aa  792    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106495  normal  0.225734 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5248  catalase  51.79 
 
 		 735 aa  659    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.405546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3481  Catalase  56.82 
 
 		 720 aa  781    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5612  hydroperoxidase II  61.71 
 
 		 702 aa  863    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.249149 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1953  hydroperoxidase II  60.63 
 
 		 753 aa  850    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36810  hydroperoxidase II  74.33 
 
 		 709 aa  1086    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5326  catalase C  50.07 
 
 		 718 aa  645    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3261  Catalase  55.65 
 
 		 718 aa  756    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal  0.0386597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3160  hydroperoxidase II  74.07 
 
 		 709 aa  1078    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2450  hydroperoxidase II  60.63 
 
 		 753 aa  850    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6481  hydroperoxidase II  62.37 
 
 		 704 aa  868    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0604  Catalase  49.86 
 
 		 718 aa  644    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.0291393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1447  hydroperoxidase II  61.26 
 
 		 750 aa  858    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0211  catalase  51.98 
 
 		 701 aa  692    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.247073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4342  catalase  49.86 
 
 		 695 aa  664    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.631099  normal  0.0151111 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6071  hydroperoxidase II  62.41 
 
 		 704 aa  868    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.176367 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4611  catalase  53.27 
 
 		 710 aa  690    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2991  hydroperoxidase II  61.35 
 
 		 708 aa  860    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4216  Catalase  51.72 
 
 		 700 aa  670    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3201  catalase  54.61 
 
 		 715 aa  695    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1465  Catalase  47.77 
 
 		 704 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12821  normal  0.432634 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2070  hydroperoxidase II  55.88 
 
 		 751 aa  797    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.192326 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3991  catalase  53.64 
 
 		 713 aa  695    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.805138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1830  catalase  54.2 
 
 		 848 aa  738    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.262631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>