More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2949 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_1900  hydroperoxidase II  52.25 
 
 		 753 aa  715    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.321432 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08637  Catalase A (EC 1.11.1.6)(Spore-specific catalase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55305]  47.53 
 
 		 744 aa  636    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139422  normal  0.87889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0501  Catalase  56.01 
 
 		 728 aa  757    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01701  hydroperoxidase HPII(III) (catalase)  52.39 
 
 		 753 aa  715    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1910  Catalase  52.25 
 
 		 753 aa  716    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0115  hydroperoxidase II  56.36 
 
 		 711 aa  780    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1733  Catalase  53.64 
 
 		 738 aa  644    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.027105 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6071  hydroperoxidase II  57.72 
 
 		 704 aa  734    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.176367 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1813  hydroperoxidase II  52.39 
 
 		 753 aa  717    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  56.01 
 
 		 665 aa  710    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3162  catalase  56.61 
 
 		 801 aa  755    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1712  hydroperoxidase II  51.4 
 
 		 752 aa  707    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.806465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5248  catalase  54.55 
 
 		 735 aa  645    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.405546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6342  hydroperoxidase II  56.64 
 
 		 702 aa  741    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5392  hydroperoxidase II  56.6 
 
 		 710 aa  782    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0123509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5263  catalase  54.83 
 
 		 716 aa  766    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0803  catalase  56.15 
 
 		 665 aa  702    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2662  Catalase  52.96 
 
 		 702 aa  639    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0604  Catalase  54.91 
 
 		 718 aa  676    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.0291393 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  56.63 
 
 		 661 aa  708    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2517  Catalase  54.19 
 
 		 755 aa  655    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.015736  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02109  catalase  52.32 
 
 		 701 aa  641    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.75009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0747  catalase  57.31 
 
 		 661 aa  717    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5326  catalase C  51.72 
 
 		 718 aa  644    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1432  hydroperoxidase II  52.65 
 
 		 750 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2450  hydroperoxidase II  52.71 
 
 		 753 aa  714    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1662  Catalase  52.61 
 
 		 705 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.768308 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06340  Catalase A, putative  48.65 
 
 		 714 aa  659    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.778234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0280  hydroperoxidase II  54.9 
 
 		 716 aa  770    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2991  hydroperoxidase II  57.55 
 
 		 708 aa  719    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112637  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2070  hydroperoxidase II  51.48 
 
 		 751 aa  734    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.192326 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0570  putative catalase  51.02 
 
 		 695 aa  649    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0605334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3446  catalase  52.71 
 
 		 715 aa  684    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0935756  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  55.64 
 
 		 665 aa  709    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3481  Catalase  63.03 
 
 		 720 aa  863    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1340  hydroperoxidase II  57.55 
 
 		 708 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1953  hydroperoxidase II  52.25 
 
 		 753 aa  713    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1165  catalase  52.17 
 
 		 693 aa  659    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0064  hydroperoxidase II  56.11 
 
 		 713 aa  788    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4123  catalase  53.36 
 
 		 705 aa  668    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4790  catalase  52.02 
 
 		 704 aa  641    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0344  catalase-2  49.35 
 
 		 676 aa  692    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4216  Catalase  49.78 
 
 		 700 aa  657    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0875  catalase  58.13 
 
 		 707 aa  847    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0403513  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  52.15 
 
 		 695 aa  658    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0843  catalase  56.15 
 
 		 661 aa  702    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  54.35 
 
 		 684 aa  769    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0130  hydroperoxidase II  55.51 
 
 		 711 aa  762    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333336 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2010  Catalase  52.72 
 
 		 808 aa  736    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1515  catalase  54.16 
 
 		 799 aa  743    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14080  catalase  52.17 
 
 		 762 aa  650    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3310  catalase  52.96 
 
 		 702 aa  639    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2949  catalase  100 
 
 		 709 aa  1448    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962169  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0721  catalase  53.1 
 
 		 705 aa  652    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0590  catalase  52.54 
 
 		 794 aa  744    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3625  catalase  52.7 
 
 		 705 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0284483 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2377  hydroperoxidase II  54.13 
 
 		 712 aa  755    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  56.06 
 
 		 724 aa  766    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31810  catalase  53.82 
 
 		 738 aa  649    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1215  hydroperoxidase II  56.9 
 
 		 707 aa  780    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25778  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1853  hydroperoxidase II  52.65 
 
 		 750 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0617  catalase  51.99 
 
 		 710 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1180  Catalase  49.93 
 
 		 704 aa  645    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.467187  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1100  catalase  56.06 
 
 		 716 aa  738    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236267  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0560  catalase  50.7 
 
 		 695 aa  645    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1719  Catalase  54.57 
 
 		 753 aa  786    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3160  hydroperoxidase II  60.03 
 
 		 709 aa  774    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4346  Catalase  55.65 
 
 		 716 aa  809    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.202786 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1348  hydroperoxidase II  58.16 
 
 		 704 aa  738    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.811061  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2026  hydroperoxidase II  52.51 
 
 		 750 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3391  Catalase  54.57 
 
 		 763 aa  778    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135276  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0766  catalase  49.1 
 
 		 688 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3115  hydroperoxidase II  57.55 
 
 		 708 aa  719    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283199  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2836  catalase  53.7 
 
 		 711 aa  781    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0211  catalase  52.1 
 
 		 701 aa  641    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.247073 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  55.85 
 
 		 665 aa  706    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1447  hydroperoxidase II  52.51 
 
 		 750 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5612  hydroperoxidase II  56.78 
 
 		 702 aa  743    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.249149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3140  catalase  53.92 
 
 		 713 aa  786    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36810  hydroperoxidase II  60.03 
 
 		 709 aa  778    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2273  hydroperoxidase II  56.54 
 
 		 713 aa  759    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878038  hitchhiker  0.00653218 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1094  catalase  51.65 
 
 		 741 aa  672    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3732  Catalase  52.7 
 
 		 705 aa  646    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4605  catalase  49.78 
 
 		 675 aa  696    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6481  hydroperoxidase II  58.16 
 
 		 704 aa  738    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5573  Catalase  55.24 
 
 		 730 aa  778    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.504668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5113  hydroperoxidase II  55.08 
 
 		 714 aa  769    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.417353 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1415  hydroperoxidase II  52.65 
 
 		 750 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582031 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1459  hydroperoxidase II  52.31 
 
 		 753 aa  713    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.401999  normal  0.332659 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01967  Catalase  50.78 
 
 		 689 aa  647    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.650017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5492  Catalase  71.39 
 
 		 690 aa  937    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217923  normal  0.0437244 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1465  Catalase  53.12 
 
 		 704 aa  668    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12821  normal  0.432634 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11433  catalase HPII  51.32 
 
 		 713 aa  770    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3201  catalase  54.2 
 
 		 715 aa  687    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01689  hypothetical protein  52.39 
 
 		 753 aa  715    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.437438  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0132  hydroperoxidase II  56.5 
 
 		 711 aa  782    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2202  catalase  53.92 
 
 		 748 aa  639    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.366789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2389  Catalase  56.06 
 
 		 728 aa  823    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106495  normal  0.225734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1830  catalase  51.85 
 
 		 848 aa  715    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.262631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1993  catalase  52.19 
 
 		 729 aa  705    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.219349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>