More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5612 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3310  catalase  53.85 
 
 		 702 aa  660    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253337 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01689  hypothetical protein  57.24 
 
 		 753 aa  793    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.437438  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2010  Catalase  53.89 
 
 		 808 aa  719    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01701  hydroperoxidase HPII(III) (catalase)  57.24 
 
 		 753 aa  793    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1910  Catalase  57.24 
 
 		 753 aa  795    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0115  hydroperoxidase II  60.85 
 
 		 711 aa  865    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2003  catalase  55.09 
 
 		 728 aa  681    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5392  hydroperoxidase II  72.84 
 
 		 710 aa  1073    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0123509 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  54.63 
 
 		 665 aa  719    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1900  hydroperoxidase II  57.24 
 
 		 753 aa  793    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.321432 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2070  hydroperoxidase II  55.22 
 
 		 751 aa  787    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.192326 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01967  Catalase  49.25 
 
 		 689 aa  639    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.650017  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1180  Catalase  52.37 
 
 		 704 aa  674    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.467187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5573  Catalase  54.43 
 
 		 730 aa  775    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.504668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5263  catalase  61.27 
 
 		 716 aa  871    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0803  catalase  54.17 
 
 		 665 aa  714    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2662  Catalase  53.85 
 
 		 702 aa  660    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1813  hydroperoxidase II  57.24 
 
 		 753 aa  794    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  54.32 
 
 		 661 aa  718    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  54.76 
 
 		 684 aa  738    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1712  hydroperoxidase II  57.08 
 
 		 752 aa  796    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.806465  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0747  catalase  55.24 
 
 		 661 aa  727    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4346  Catalase  55.51 
 
 		 716 aa  784    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.202786 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0590  catalase  53.15 
 
 		 794 aa  721    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5113  hydroperoxidase II  61.84 
 
 		 714 aa  881    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.417353 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0501  Catalase  57.45 
 
 		 728 aa  772    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3261  Catalase  54.53 
 
 		 718 aa  759    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal  0.0386597 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0280  hydroperoxidase II  62.17 
 
 		 716 aa  864    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2273  hydroperoxidase II  61.71 
 
 		 713 aa  863    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878038  hitchhiker  0.00653218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1432  hydroperoxidase II  56.96 
 
 		 750 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0570  putative catalase  51.33 
 
 		 695 aa  679    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0605334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3732  Catalase  52.09 
 
 		 705 aa  664    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3597  Catalase  52.27 
 
 		 694 aa  669    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2311  catalase  52.32 
 
 		 737 aa  658    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1340  hydroperoxidase II  78.62 
 
 		 708 aa  1122    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6071  hydroperoxidase II  91.19 
 
 		 704 aa  1291    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.176367 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1165  catalase  51.79 
 
 		 693 aa  661    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0064  hydroperoxidase II  61.65 
 
 		 713 aa  890    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4342  catalase  52.3 
 
 		 695 aa  642    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.631099  normal  0.0151111 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4123  catalase  50.74 
 
 		 705 aa  648    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  54.48 
 
 		 665 aa  721    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1719  Catalase  51.83 
 
 		 753 aa  712    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0875  catalase  56.25 
 
 		 707 aa  786    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0403513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02109  catalase  52.25 
 
 		 701 aa  667    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.75009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0843  catalase  54.17 
 
 		 661 aa  714    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5326  catalase C  52.06 
 
 		 718 aa  660    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5248  catalase  50.85 
 
 		 735 aa  664    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.405546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1459  hydroperoxidase II  57.39 
 
 		 753 aa  795    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.401999  normal  0.332659 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1515  catalase  54.68 
 
 		 799 aa  732    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1356  catalase  50.59 
 
 		 704 aa  645    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3160  hydroperoxidase II  63.28 
 
 		 709 aa  884    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2949  catalase  56.78 
 
 		 709 aa  743    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962169  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0721  catalase  51.05 
 
 		 705 aa  658    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0132  hydroperoxidase II  61.13 
 
 		 711 aa  868    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3625  catalase  51.49 
 
 		 705 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0284483 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2377  hydroperoxidase II  60.32 
 
 		 712 aa  865    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  56.19 
 
 		 724 aa  775    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1447  hydroperoxidase II  56.82 
 
 		 750 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1215  hydroperoxidase II  73.5 
 
 		 707 aa  1078    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25778  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2389  Catalase  55.99 
 
 		 728 aa  790    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106495  normal  0.225734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0617  catalase  50.6 
 
 		 710 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2991  hydroperoxidase II  78.48 
 
 		 708 aa  1116    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112637  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1100  catalase  59.63 
 
 		 716 aa  870    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236267  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  52.35 
 
 		 695 aa  685    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2026  hydroperoxidase II  56.82 
 
 		 750 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0560  catalase  51.04 
 
 		 695 aa  676    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4605  catalase  48.53 
 
 		 675 aa  656    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1953  hydroperoxidase II  57.1 
 
 		 753 aa  791    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2450  hydroperoxidase II  57.24 
 
 		 753 aa  796    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1348  hydroperoxidase II  91.76 
 
 		 704 aa  1296    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.811061  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0604  Catalase  52.29 
 
 		 718 aa  635    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.0291393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5492  Catalase  57.83 
 
 		 690 aa  753    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217923  normal  0.0437244 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0766  catalase  49.76 
 
 		 688 aa  637    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3481  Catalase  53.67 
 
 		 720 aa  724    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2836  catalase  54.35 
 
 		 711 aa  749    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0211  catalase  52.06 
 
 		 701 aa  669    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.247073 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3115  hydroperoxidase II  78.48 
 
 		 708 aa  1117    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283199  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3446  catalase  52.42 
 
 		 715 aa  668    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0935756  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5612  hydroperoxidase II  100 
 
 		 702 aa  1439    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.249149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1662  Catalase  51.57 
 
 		 705 aa  659    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.768308 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36810  hydroperoxidase II  62.84 
 
 		 709 aa  880    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11433  catalase HPII  51.54 
 
 		 713 aa  740    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1094  catalase  50.41 
 
 		 741 aa  650    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0344  catalase-2  47.72 
 
 		 676 aa  656    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1465  Catalase  51.47 
 
 		 704 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12821  normal  0.432634 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6481  hydroperoxidase II  91.76 
 
 		 704 aa  1296    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6342  hydroperoxidase II  99.15 
 
 		 702 aa  1425    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0130  hydroperoxidase II  61.42 
 
 		 711 aa  870    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5310  Catalase  54.17 
 
 		 702 aa  724    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3563  catalase domain-containing protein  52.79 
 
 		 724 aa  650    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000309586  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1415  hydroperoxidase II  56.96 
 
 		 750 aa  792    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582031 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4611  catalase  51.44 
 
 		 710 aa  678    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3140  catalase  53.76 
 
 		 713 aa  746    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3391  Catalase  51.27 
 
 		 763 aa  711    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135276  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3201  catalase  51.34 
 
 		 715 aa  662    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  55.08 
 
 		 665 aa  725    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1853  hydroperoxidase II  56.96 
 
 		 750 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3162  catalase  57.66 
 
 		 801 aa  752    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3991  catalase  53.28 
 
 		 713 aa  660    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.805138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1830  catalase  54.2 
 
 		 848 aa  731    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.262631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>