More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00480 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_02220  catalase  55.43 
 
 
739 aa  714    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1733  Catalase  59.26 
 
 
738 aa  759    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.027105 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14080  catalase  54.68 
 
 
762 aa  714    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651811  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3446  catalase  57.5 
 
 
715 aa  728    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0935756  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2517  Catalase  57.04 
 
 
755 aa  749    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.015736  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00480  catalase  100 
 
 
689 aa  1410    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.954008  normal  0.80551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2924  Catalase  64.06 
 
 
733 aa  744    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0605396  normal  0.825908 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31810  catalase  56.96 
 
 
738 aa  738    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5439  catalase  58.81 
 
 
744 aa  746    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.441674  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5060  catalase  58.66 
 
 
744 aa  746    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1094  catalase  60.23 
 
 
741 aa  798    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2202  catalase  56.54 
 
 
748 aa  729    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.366789 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5148  catalase  58.66 
 
 
744 aa  746    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.821029  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3201  catalase  57.73 
 
 
715 aa  727    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0132  hydroperoxidase II  51.08 
 
 
711 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0115  hydroperoxidase II  51.32 
 
 
711 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368429  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0130  hydroperoxidase II  50.8 
 
 
711 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.333336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5113  hydroperoxidase II  49.28 
 
 
714 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.417353 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1340  hydroperoxidase II  51.52 
 
 
708 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5263  catalase  48.91 
 
 
716 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6342  hydroperoxidase II  50.36 
 
 
702 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2377  hydroperoxidase II  49.56 
 
 
712 aa  622  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6071  hydroperoxidase II  49.93 
 
 
704 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0064  hydroperoxidase II  48.85 
 
 
713 aa  617  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  48.7 
 
 
695 aa  618  1e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5612  hydroperoxidase II  50.65 
 
 
702 aa  618  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.249149 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3115  hydroperoxidase II  51.66 
 
 
708 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283199  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2991  hydroperoxidase II  51.52 
 
 
708 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112637  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1215  hydroperoxidase II  49.49 
 
 
707 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25778  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1348  hydroperoxidase II  49.93 
 
 
704 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.811061  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6481  hydroperoxidase II  49.93 
 
 
704 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75585  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2273  hydroperoxidase II  48.98 
 
 
713 aa  610  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878038  hitchhiker  0.00653218 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0560  catalase  49.12 
 
 
695 aa  610  1e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5392  hydroperoxidase II  48.98 
 
 
710 aa  608  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0123509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0280  hydroperoxidase II  48.13 
 
 
716 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0570  putative catalase  48.39 
 
 
695 aa  607  9.999999999999999e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0605334  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3597  Catalase  49.26 
 
 
694 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0501  Catalase  49.25 
 
 
728 aa  599  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2949  catalase  47.5 
 
 
709 aa  600  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962169  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2836  catalase  46.99 
 
 
711 aa  599  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339115  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11433  catalase HPII  44.8 
 
 
713 aa  598  1e-169  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4585  Catalase  48.77 
 
 
702 aa  595  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  48.79 
 
 
724 aa  597  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3140  catalase  45.92 
 
 
713 aa  596  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3162  catalase  48.78 
 
 
801 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271055  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2003  catalase  50.45 
 
 
728 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2389  Catalase  46.98 
 
 
728 aa  592  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106495  normal  0.225734 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0939  catalase  46.02 
 
 
665 aa  589  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000318965 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0211  catalase  49.13 
 
 
701 aa  590  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.247073 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5573  Catalase  46.3 
 
 
730 aa  591  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.504668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3481  Catalase  47.14 
 
 
720 aa  591  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3261  Catalase  46.95 
 
 
718 aa  591  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal  0.0386597 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0752  catalase  45.72 
 
 
661 aa  587  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0747  catalase  45.94 
 
 
661 aa  588  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0590  catalase  46.29 
 
 
794 aa  587  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5492  Catalase  50.62 
 
 
690 aa  587  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217923  normal  0.0437244 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02109  catalase  48.33 
 
 
701 aa  586  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.75009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  46.21 
 
 
665 aa  588  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.108601 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1180  Catalase  47.76 
 
 
704 aa  588  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.467187  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  46.06 
 
 
665 aa  585  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0875  catalase  46.18 
 
 
707 aa  587  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0403513  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2010  Catalase  47.24 
 
 
808 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4346  Catalase  44.88 
 
 
716 aa  582  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.202786 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0803  catalase  45.91 
 
 
665 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2070  hydroperoxidase II  45.94 
 
 
751 aa  585  1.0000000000000001e-165  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.192326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3160  hydroperoxidase II  48.17 
 
 
709 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0843  catalase  45.91 
 
 
661 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36810  hydroperoxidase II  47.47 
 
 
709 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01701  hydroperoxidase HPII(III) (catalase)  47.66 
 
 
753 aa  578  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01689  hypothetical protein  47.66 
 
 
753 aa  578  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.437438  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1813  hydroperoxidase II  47.66 
 
 
753 aa  578  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2450  hydroperoxidase II  47.66 
 
 
753 aa  578  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1910  Catalase  47.66 
 
 
753 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1953  hydroperoxidase II  47.66 
 
 
753 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  48.75 
 
 
684 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1459  hydroperoxidase II  47.37 
 
 
753 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.401999  normal  0.332659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0721  catalase  47.27 
 
 
705 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1900  hydroperoxidase II  47.66 
 
 
753 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.321432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3991  catalase  48.89 
 
 
713 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.805138  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1356  catalase  47.36 
 
 
704 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5248  catalase  47.31 
 
 
735 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.405546  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2026  hydroperoxidase II  47.08 
 
 
750 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1415  hydroperoxidase II  47.08 
 
 
750 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582031 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1447  hydroperoxidase II  47.08 
 
 
750 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1515  catalase  45.7 
 
 
799 aa  571  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1993  catalase  46.37 
 
 
729 aa  569  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.219349 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1432  hydroperoxidase II  47.08 
 
 
750 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1853  hydroperoxidase II  47.08 
 
 
750 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1830  catalase  49.76 
 
 
848 aa  569  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.262631 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2662  Catalase  49.55 
 
 
702 aa  566  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3625  catalase  46.99 
 
 
705 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0284483 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3310  catalase  49.55 
 
 
702 aa  567  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1100  catalase  46.22 
 
 
716 aa  565  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236267  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4611  catalase  47.82 
 
 
710 aa  566  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0617  catalase  46.56 
 
 
710 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4605  catalase  44.1 
 
 
675 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0344  catalase-2  43.85 
 
 
676 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1896  catalase  49.92 
 
 
710 aa  561  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  45.36 
 
 
675 aa  560  1e-158  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1040  catalase  49.34 
 
 
710 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0689912  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>