More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5249 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  100 
 
 		 529 aa  1102    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2940  catalase  61.29 
 
 		 546 aa  650    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2914  catalase  60.91 
 
 		 546 aa  646    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2865  catalase  60.72 
 
 		 546 aa  643    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3405  Catalase  91.32 
 
 		 529 aa  1002    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3172  catalase  60.72 
 
 		 546 aa  642    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3210  catalase  91.51 
 
 		 530 aa  1009    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0632  catalase  92.63 
 
 		 529 aa  1022    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172483  normal  0.22011 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3164  catalase  61.29 
 
 		 546 aa  650    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5497  Catalase  64.27 
 
 		 552 aa  645    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3182  catalase  60.72 
 
 		 546 aa  645    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2728  catalase  67.97 
 
 		 543 aa  678    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2900  Catalase  66.6 
 
 		 550 aa  668    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  64.14 
 
 		 554 aa  655    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  92.06 
 
 		 529 aa  1025    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3534  Catalase  91.51 
 
 		 530 aa  1009    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0865  Catalase  63.75 
 
 		 551 aa  624  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2125  Catalase  60.78 
 
 		 555 aa  609  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0020  Catalase  59.42 
 
 		 552 aa  609  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0935072 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0874  catalase  54.12 
 
 		 488 aa  522  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000610076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  53.7 
 
 		 488 aa  521  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  53.7 
 
 		 488 aa  521  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  53.7 
 
 		 488 aa  521  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  53.7 
 
 		 488 aa  521  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  53.7 
 
 		 488 aa  519  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  53.7 
 
 		 488 aa  521  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  53.07 
 
 		 488 aa  514  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1209  catalase  53.09 
 
 		 488 aa  511  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00159652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4132  catalase  53.09 
 
 		 488 aa  509  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000220587  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  54.97 
 
 		 449 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0893  catalase  47.07 
 
 		 489 aa  433  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0721  catalase  46.91 
 
 		 705 aa  432  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  47.67 
 
 		 511 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  45.95 
 
 		 509 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  46.99 
 
 		 509 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  47.67 
 
 		 516 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  47.67 
 
 		 511 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  46.53 
 
 		 504 aa  427  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0617  catalase  46.31 
 
 		 710 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  47.67 
 
 		 511 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  47.67 
 
 		 505 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1188  catalase  45.53 
 
 		 567 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  43.69 
 
 		 485 aa  422  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  46.59 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4342  catalase  44.63 
 
 		 695 aa  423  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.631099  normal  0.0151111 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5248  catalase  45.61 
 
 		 735 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.405546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  46.34 
 
 		 510 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  46.14 
 
 		 512 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11433  catalase HPII  44.35 
 
 		 713 aa  420  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3625  catalase  45.85 
 
 		 705 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0284483 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  44.6 
 
 		 504 aa  422  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  45.97 
 
 		 513 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3310  catalase  47.08 
 
 		 702 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  45.73 
 
 		 510 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  44.95 
 
 		 675 aa  417  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  44.76 
 
 		 506 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  45.77 
 
 		 513 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2311  catalase  45.24 
 
 		 737 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  45.15 
 
 		 695 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0766  catalase  45.31 
 
 		 688 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4216  Catalase  46.29 
 
 		 700 aa  416  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2662  Catalase  47.08 
 
 		 702 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  46.14 
 
 		 515 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1465  Catalase  45.31 
 
 		 704 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12821  normal  0.432634 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4123  catalase  45.95 
 
 		 705 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  44.76 
 
 		 506 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2003  catalase  46.28 
 
 		 728 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  45.69 
 
 		 513 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  43.57 
 
 		 527 aa  415  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02109  catalase  46.28 
 
 		 701 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.75009  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  45.84 
 
 		 507 aa  415  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0365  Catalase  44.93 
 
 		 490 aa  415  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5492  Catalase  45.28 
 
 		 690 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217923  normal  0.0437244 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0289  catalase  45.13 
 
 		 490 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.745578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1662  Catalase  44.9 
 
 		 705 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.768308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5310  Catalase  44 
 
 		 702 aa  411  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  43.23 
 
 		 484 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0333  Catalase  44.73 
 
 		 490 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  46.28 
 
 		 517 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3940  catalase  44.15 
 
 		 493 aa  412  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109711  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3597  Catalase  45.36 
 
 		 694 aa  412  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3481  Catalase  44.19 
 
 		 720 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01967  Catalase  45.4 
 
 		 689 aa  411  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.650017  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3991  catalase  45.62 
 
 		 713 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.805138  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  43.33 
 
 		 479 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5573  Catalase  43.65 
 
 		 730 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.504668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  43.83 
 
 		 481 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1515  catalase  45.44 
 
 		 799 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1356  catalase  45.38 
 
 		 704 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5326  catalase C  45.51 
 
 		 718 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1180  Catalase  45.97 
 
 		 704 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.467187  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  43.33 
 
 		 479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1107  catalase  44.65 
 
 		 536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610456  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2836  catalase  43.43 
 
 		 711 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  43.77 
 
 		 684 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36810  hydroperoxidase II  45.29 
 
 		 709 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  43.25 
 
 		 503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  45.23 
 
 		 507 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0894  catalase  43.76 
 
 		 491 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0570  putative catalase  44.31 
 
 		 695 aa  405  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0605334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>