More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3394 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  65.57 
 
 		 509 aa  659    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1188  catalase  74.65 
 
 		 567 aa  783    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  61.77 
 
 		 516 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  82.44 
 
 		 506 aa  872    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  63.29 
 
 		 509 aa  657    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  61.77 
 
 		 511 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  82.24 
 
 		 506 aa  871    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  100 
 
 		 503 aa  1044    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06580  catalase  73.29 
 
 		 504 aa  766    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  61.97 
 
 		 511 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  89.26 
 
 		 527 aa  942    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  61.57 
 
 		 511 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  89.44 
 
 		 504 aa  934    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  61.77 
 
 		 505 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  61.4 
 
 		 512 aa  629  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  59.72 
 
 		 511 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  59.72 
 
 		 511 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  59.72 
 
 		 511 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  62.32 
 
 		 513 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  62.03 
 
 		 513 aa  620  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  60.76 
 
 		 507 aa  618  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  59.12 
 
 		 511 aa  619  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  60.04 
 
 		 513 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  60.24 
 
 		 510 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0377  catalase  60.28 
 
 		 510 aa  614  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000005607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  60.64 
 
 		 515 aa  614  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  60.61 
 
 		 517 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  60.08 
 
 		 510 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  60.08 
 
 		 507 aa  600  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1107  catalase  55.84 
 
 		 536 aa  570  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610456  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0466  catalase precursor  66.84 
 
 		 562 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  54.18 
 
 		 488 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  54.18 
 
 		 488 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  54.18 
 
 		 488 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  54.18 
 
 		 488 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  54.18 
 
 		 488 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4132  catalase  53.77 
 
 		 488 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000220587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0874  catalase  53.8 
 
 		 488 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000610076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  54.18 
 
 		 488 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1209  catalase  53.77 
 
 		 488 aa  537  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00159652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  53.99 
 
 		 488 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  55.78 
 
 		 449 aa  520  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2900  Catalase  45.89 
 
 		 550 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2728  catalase  47.31 
 
 		 543 aa  448  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0778  Catalase  45.51 
 
 		 507 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3940  catalase  45.04 
 
 		 493 aa  433  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109711  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0893  catalase  45.17 
 
 		 489 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0638  catalase  43.65 
 
 		 487 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2941  catalase  45.57 
 
 		 488 aa  425  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3190  catalase  44.38 
 
 		 486 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0631825  normal  0.81248 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0894  catalase  44.1 
 
 		 491 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1070  catalase  43.57 
 
 		 486 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3405  Catalase  43.67 
 
 		 529 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  42.19 
 
 		 479 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  42.26 
 
 		 479 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3029  catalase  43.98 
 
 		 486 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0945  catalase  43.98 
 
 		 486 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0885996  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0563  catalase  43.69 
 
 		 486 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0908  catalase domain-containing protein  44.19 
 
 		 486 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3591  catalase  44.31 
 
 		 491 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  42.05 
 
 		 479 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3392  Catalase  43.89 
 
 		 491 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  42.86 
 
 		 505 aa  413  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3468  catalase  44.1 
 
 		 491 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.482946  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3210  catalase  44.22 
 
 		 530 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3534  Catalase  44.22 
 
 		 530 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2940  catalase  41.37 
 
 		 546 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2914  catalase  41.37 
 
 		 546 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2865  catalase  41.16 
 
 		 546 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  42.89 
 
 		 481 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3164  catalase  41.37 
 
 		 546 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  43.4 
 
 		 529 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0632  catalase  43 
 
 		 529 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172483  normal  0.22011 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3172  catalase  41.16 
 
 		 546 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3182  catalase  40.96 
 
 		 546 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  43.25 
 
 		 529 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  42.59 
 
 		 498 aa  405  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  40.79 
 
 		 484 aa  405  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3637  Catalase  40.98 
 
 		 493 aa  402  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155654  decreased coverage  0.00459164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  41.42 
 
 		 479 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  40.98 
 
 		 504 aa  396  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  40.17 
 
 		 485 aa  392  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  41.38 
 
 		 554 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0875  catalase  41.24 
 
 		 707 aa  387  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0403513  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3078  catalase  41.7 
 
 		 499 aa  388  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2782  Catalase  42.13 
 
 		 494 aa  389  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0265  catalase  42.04 
 
 		 474 aa  382  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1387  catalase  42.46 
 
 		 474 aa  385  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000679986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5497  Catalase  42.03 
 
 		 552 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1576  catalase  42.25 
 
 		 474 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.278462  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  40.62 
 
 		 695 aa  385  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0560  catalase  39.76 
 
 		 695 aa  384  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3881  catalase  41.01 
 
 		 480 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000327701  hitchhiker  0.000000338063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01967  Catalase  42.12 
 
 		 689 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.650017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0590  catalase  40.8 
 
 		 794 aa  385  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1932  catalase  40.66 
 
 		 488 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1622  Catalase  40.43 
 
 		 500 aa  382  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468937  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11433  catalase HPII  40.98 
 
 		 713 aa  379  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  41.72 
 
 		 665 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1494  Catalase  41.41 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0618429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>