More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2900 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3405  Catalase  67.43 
 
 
529 aa  677    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2125  Catalase  66.67 
 
 
555 aa  657    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0632  catalase  67.43 
 
 
529 aa  676    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172483  normal  0.22011 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2940  catalase  64.46 
 
 
546 aa  721    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2914  catalase  64.46 
 
 
546 aa  721    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  65.92 
 
 
554 aa  667    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2865  catalase  64.84 
 
 
546 aa  726    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0865  Catalase  62.91 
 
 
551 aa  646    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5497  Catalase  65.78 
 
 
552 aa  660    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3164  catalase  64.46 
 
 
546 aa  721    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3534  Catalase  67.22 
 
 
530 aa  677    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3182  catalase  64.65 
 
 
546 aa  723    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2900  Catalase  100 
 
 
550 aa  1146    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478184  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3172  catalase  64.26 
 
 
546 aa  723    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3210  catalase  67.22 
 
 
530 aa  677    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161662  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0020  Catalase  63.71 
 
 
552 aa  637    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0935072 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2728  catalase  77.99 
 
 
543 aa  870    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  66.39 
 
 
529 aa  668    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  66.6 
 
 
529 aa  668    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  56.22 
 
 
488 aa  558  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  55.74 
 
 
488 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  55.74 
 
 
488 aa  557  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  55.74 
 
 
488 aa  557  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  55.74 
 
 
488 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  55.53 
 
 
488 aa  555  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4132  catalase  55.53 
 
 
488 aa  552  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000220587  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  55.74 
 
 
488 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0874  catalase  55.95 
 
 
488 aa  554  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000610076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1209  catalase  55.74 
 
 
488 aa  551  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00159652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  57.46 
 
 
449 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  51.45 
 
 
509 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  51.45 
 
 
509 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  51.77 
 
 
511 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  51.77 
 
 
516 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  51.77 
 
 
511 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  51.56 
 
 
511 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  51.77 
 
 
505 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  48.88 
 
 
515 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0893  catalase  47.5 
 
 
489 aa  462  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  47.3 
 
 
504 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  48.35 
 
 
507 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  47.68 
 
 
512 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  48.34 
 
 
510 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  47.29 
 
 
506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  47.27 
 
 
506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  46.93 
 
 
527 aa  451  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  47.63 
 
 
510 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  45.89 
 
 
503 aa  450  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1188  catalase  47.14 
 
 
567 aa  449  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1107  catalase  44.53 
 
 
536 aa  451  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  47.31 
 
 
513 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  48.15 
 
 
507 aa  451  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  47.12 
 
 
513 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  48.41 
 
 
505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  49.07 
 
 
504 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06580  catalase  47.4 
 
 
504 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  47.11 
 
 
513 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0466  catalase precursor  55.04 
 
 
562 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  47.44 
 
 
517 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  45.06 
 
 
479 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  45.06 
 
 
479 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  43.76 
 
 
479 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  44.56 
 
 
481 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  44.86 
 
 
484 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  44.65 
 
 
479 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  44.56 
 
 
511 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  44.56 
 
 
511 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  44.56 
 
 
511 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0778  Catalase  44.05 
 
 
507 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2441  catalase  43.98 
 
 
481 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0377  catalase  45.73 
 
 
510 aa  415  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000005607  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05192  catalase  45.34 
 
 
478 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001311  catalase  45.36 
 
 
479 aa  413  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  43.66 
 
 
511 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  45.02 
 
 
485 aa  408  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22418  catalase  44.29 
 
 
566 aa  406  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5310  Catalase  42 
 
 
702 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0590  catalase  51.74 
 
 
794 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21110  catalase  44.17 
 
 
487 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.218837 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2321  catalase  42.63 
 
 
501 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0830  catalase  44.07 
 
 
480 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11433  catalase HPII  42.39 
 
 
713 aa  401  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0064  hydroperoxidase II  43.22 
 
 
713 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3881  catalase  42.6 
 
 
480 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000327701  hitchhiker  0.000000338063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3140  catalase  43.43 
 
 
713 aa  399  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  44.7 
 
 
498 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3481  Catalase  42.28 
 
 
720 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0344  catalase-2  43.12 
 
 
676 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3597  Catalase  43.75 
 
 
694 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1515  catalase  43.66 
 
 
799 aa  399  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0638  catalase  42.83 
 
 
487 aa  398  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3310  catalase  44.22 
 
 
702 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253337 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2836  catalase  42.22 
 
 
711 aa  398  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339115  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0563  catalase  43.33 
 
 
486 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0864  catalase  42.95 
 
 
482 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02109  catalase  43.97 
 
 
701 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.75009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4605  catalase  43.44 
 
 
675 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3940  catalase  44.31 
 
 
493 aa  398  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109711  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4611  catalase  43.93 
 
 
710 aa  398  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01967  Catalase  44.31 
 
 
689 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.650017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>