More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0020 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3182  catalase  64.05 
 
 		 546 aa  647    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  83.27 
 
 		 554 aa  957    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2940  catalase  64.26 
 
 		 546 aa  647    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2914  catalase  64.05 
 
 		 546 aa  644    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2865  catalase  64.05 
 
 		 546 aa  647    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5497  Catalase  83.36 
 
 		 552 aa  963    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3164  catalase  64.26 
 
 		 546 aa  647    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0865  Catalase  78 
 
 		 551 aa  868    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2125  Catalase  77.17 
 
 		 555 aa  882    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2728  catalase  65.45 
 
 		 543 aa  655    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2900  Catalase  63.71 
 
 		 550 aa  637    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3172  catalase  64.05 
 
 		 546 aa  644    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0020  Catalase  100 
 
 		 552 aa  1147    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0935072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  61.75 
 
 		 529 aa  623  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3534  Catalase  61.28 
 
 		 530 aa  618  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3210  catalase  61.28 
 
 		 530 aa  618  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3405  Catalase  59.09 
 
 		 529 aa  616  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0632  catalase  61.28 
 
 		 529 aa  615  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172483  normal  0.22011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  59.42 
 
 		 529 aa  609  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  47.74 
 
 		 488 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  47.74 
 
 		 488 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  47.74 
 
 		 488 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  47.74 
 
 		 488 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  47.74 
 
 		 488 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  47.74 
 
 		 488 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0874  catalase  47.74 
 
 		 488 aa  462  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000610076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  47.74 
 
 		 488 aa  462  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4132  catalase  47.33 
 
 		 488 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000220587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1209  catalase  47.12 
 
 		 488 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00159652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  49.56 
 
 		 449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  47.02 
 
 		 504 aa  430  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0893  catalase  46.23 
 
 		 489 aa  423  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  44.55 
 
 		 505 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  44.54 
 
 		 479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4216  Catalase  43.46 
 
 		 700 aa  402  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1165  catalase  43.91 
 
 		 693 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0721  catalase  44.01 
 
 		 705 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4123  catalase  45.1 
 
 		 705 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1662  Catalase  44.3 
 
 		 705 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.768308 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  43.92 
 
 		 479 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0617  catalase  44.24 
 
 		 710 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  43.71 
 
 		 479 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  42.68 
 
 		 509 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  43 
 
 		 510 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1465  Catalase  44.14 
 
 		 704 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12821  normal  0.432634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  43.71 
 
 		 479 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  43.6 
 
 		 517 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  42.32 
 
 		 675 aa  393  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5326  catalase C  42.62 
 
 		 718 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5248  catalase  43.31 
 
 		 735 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.405546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1515  catalase  45.23 
 
 		 799 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06580  catalase  43.27 
 
 		 504 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3625  catalase  44.86 
 
 		 705 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0284483 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  43.89 
 
 		 509 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01967  Catalase  44.86 
 
 		 689 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.650017  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  42.65 
 
 		 481 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  43.42 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0766  catalase  44.18 
 
 		 688 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  42.52 
 
 		 507 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1188  catalase  41.53 
 
 		 567 aa  388  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  43.31 
 
 		 511 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3481  Catalase  45.29 
 
 		 720 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  42.41 
 
 		 510 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  43.47 
 
 		 498 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  43.11 
 
 		 516 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  43.11 
 
 		 511 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1356  catalase  43.07 
 
 		 704 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  40.89 
 
 		 527 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3160  hydroperoxidase II  44.31 
 
 		 709 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  43.11 
 
 		 511 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36810  hydroperoxidase II  44.31 
 
 		 709 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  43.11 
 
 		 505 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3732  Catalase  43.66 
 
 		 705 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  42.05 
 
 		 485 aa  382  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0875  catalase  41.67 
 
 		 707 aa  380  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0403513  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0604  Catalase  42.07 
 
 		 718 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.0291393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  40.68 
 
 		 512 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0289  catalase  43.55 
 
 		 490 aa  381  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.745578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2949  catalase  40.39 
 
 		 709 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962169  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0333  Catalase  43.15 
 
 		 490 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5492  Catalase  43.86 
 
 		 690 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217923  normal  0.0437244 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11433  catalase HPII  41.19 
 
 		 713 aa  380  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  41.09 
 
 		 506 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  41.63 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  40.77 
 
 		 506 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2010  Catalase  43.31 
 
 		 808 aa  378  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0365  Catalase  42.57 
 
 		 490 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0778  Catalase  42.74 
 
 		 507 aa  378  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  42.03 
 
 		 507 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0590  catalase  42.21 
 
 		 794 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2380  catalase  41.07 
 
 		 710 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00903929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  40.58 
 
 		 503 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4585  Catalase  42.23 
 
 		 702 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1040  catalase  41.07 
 
 		 710 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0689912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4342  catalase  43.17 
 
 		 695 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.631099  normal  0.0151111 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0638  catalase  41.1 
 
 		 487 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  42.51 
 
 		 695 aa  372  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  40.52 
 
 		 504 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3162  catalase  42.34 
 
 		 801 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4611  catalase  42.89 
 
 		 710 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>