More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2728 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2900  Catalase  77.99 
 
 		 550 aa  870    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2125  Catalase  65.72 
 
 		 555 aa  651    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2940  catalase  66.54 
 
 		 546 aa  743    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2914  catalase  66.54 
 
 		 546 aa  744    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2865  catalase  66.35 
 
 		 546 aa  742    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0632  catalase  68.17 
 
 		 529 aa  682    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172483  normal  0.22011 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3182  catalase  66.16 
 
 		 546 aa  739    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  67.01 
 
 		 554 aa  678    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3164  catalase  66.54 
 
 		 546 aa  743    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  68.79 
 
 		 529 aa  688    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5497  Catalase  63.81 
 
 		 552 aa  671    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3405  Catalase  68.99 
 
 		 529 aa  688    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2728  catalase  100 
 
 		 543 aa  1131    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3172  catalase  66.86 
 
 		 546 aa  742    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0020  Catalase  65.45 
 
 		 552 aa  655    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0935072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  67.97 
 
 		 529 aa  678    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3210  catalase  68.58 
 
 		 530 aa  686    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0865  Catalase  66.33 
 
 		 551 aa  664    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3534  Catalase  68.58 
 
 		 530 aa  686    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  55.9 
 
 		 488 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  55.9 
 
 		 488 aa  555  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  55.9 
 
 		 488 aa  555  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  55.9 
 
 		 488 aa  555  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  55.9 
 
 		 488 aa  555  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  55.69 
 
 		 488 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4132  catalase  55.21 
 
 		 488 aa  546  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000220587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  56.49 
 
 		 488 aa  548  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1209  catalase  55.31 
 
 		 488 aa  547  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00159652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0874  catalase  56.31 
 
 		 488 aa  546  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000610076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  57.93 
 
 		 449 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  52.87 
 
 		 511 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  51.22 
 
 		 509 aa  491  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  53.07 
 
 		 516 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  53.07 
 
 		 505 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  51.43 
 
 		 509 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  53.07 
 
 		 511 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  53.07 
 
 		 511 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0893  catalase  49.39 
 
 		 489 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  48.21 
 
 		 510 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  49.19 
 
 		 504 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  49.18 
 
 		 479 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  50.51 
 
 		 505 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  48.45 
 
 		 504 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  48.98 
 
 		 479 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  49 
 
 		 515 aa  464  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  48.66 
 
 		 510 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  48.33 
 
 		 507 aa  464  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  47.23 
 
 		 512 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  48.24 
 
 		 517 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  48.16 
 
 		 479 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  48.28 
 
 		 513 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  48.07 
 
 		 513 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  48.57 
 
 		 479 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  47.73 
 
 		 513 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1188  catalase  47.7 
 
 		 567 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  47.62 
 
 		 484 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06580  catalase  49.58 
 
 		 504 aa  455  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  47.47 
 
 		 507 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  47.95 
 
 		 481 aa  452  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0778  Catalase  48.06 
 
 		 507 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  47.31 
 
 		 503 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  47.31 
 
 		 527 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0466  catalase precursor  56.34 
 
 		 562 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  47.19 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  47.22 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1107  catalase  48.04 
 
 		 536 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610456  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  48.02 
 
 		 511 aa  438  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  47.8 
 
 		 511 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  47.8 
 
 		 511 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  47.8 
 
 		 511 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5599  catalase  47 
 
 		 481 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.555062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001311  catalase  46.86 
 
 		 479 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21110  catalase  46.94 
 
 		 487 aa  428  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  44.86 
 
 		 485 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05192  catalase  46.76 
 
 		 478 aa  428  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2465  Catalase  44.54 
 
 		 485 aa  420  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.864013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0289  catalase  44.92 
 
 		 490 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.745578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0638  catalase  44.79 
 
 		 487 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0830  catalase  44.89 
 
 		 480 aa  420  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3940  catalase  45.21 
 
 		 493 aa  421  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109711  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1721  catalase  46 
 
 		 487 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2441  catalase  45.02 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431026  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2321  catalase  44.53 
 
 		 501 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1057  catalase  44.31 
 
 		 480 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.852537  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3018  catalase  46.75 
 
 		 485 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0333  Catalase  44.33 
 
 		 490 aa  415  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3881  catalase  46.07 
 
 		 480 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000327701  hitchhiker  0.000000338063 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0365  Catalase  44.22 
 
 		 490 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0864  catalase  44.67 
 
 		 482 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  45.71 
 
 		 498 aa  414  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0377  catalase  45.19 
 
 		 510 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000005607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1759  Catalase  46.39 
 
 		 483 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191846  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0563  catalase  43.79 
 
 		 486 aa  415  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2941  catalase  44.38 
 
 		 488 aa  413  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2706  Catalase  45.79 
 
 		 499 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1958  catalase  46.39 
 
 		 483 aa  414  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1323  catalase  44.74 
 
 		 478 aa  411  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2521  catalase  43.95 
 
 		 484 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.723936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  42.36 
 
 		 684 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1932  catalase  45.44 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000172656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>