More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2321 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0032  catalase  71.19 
 
 
485 aa  697    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0355  catalase  79.02 
 
 
499 aa  820    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.692778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1421  catalase  74.11 
 
 
488 aa  736    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.898508  normal  0.0406547 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2465  Catalase  67.97 
 
 
485 aa  686    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.864013 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2779  catalase  74.11 
 
 
488 aa  737    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0322  catalase  79.23 
 
 
499 aa  823    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2489  catalase  75.21 
 
 
484 aa  737    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.350666  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0830  catalase  79.58 
 
 
480 aa  805    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0383  catalase  75 
 
 
494 aa  762    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0481  catalase  62.32 
 
 
498 aa  640    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3054  catalase  80.67 
 
 
499 aa  820    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2321  catalase  100 
 
 
501 aa  1046    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3278  catalase  60.54 
 
 
478 aa  624  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1057  catalase  64.02 
 
 
480 aa  619  1e-176  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.852537  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0712  Catalase  61.09 
 
 
484 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3986  catalase  60.67 
 
 
484 aa  608  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2855  catalase  60.13 
 
 
479 aa  608  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2521  catalase  60.08 
 
 
484 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.723936 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1576  catalase  63.71 
 
 
474 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.278462  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1320  catalase  60.13 
 
 
479 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1387  catalase  63.71 
 
 
474 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000679986  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2776  catalase  59.92 
 
 
479 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0265  catalase  63.5 
 
 
474 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5463  Catalase  59.41 
 
 
481 aa  602  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0273  catalase  63.21 
 
 
474 aa  600  1e-170  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  59.5 
 
 
481 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0864  catalase  60.21 
 
 
482 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09150  catalase  59.79 
 
 
482 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.789625 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  60.92 
 
 
498 aa  588  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0333  Catalase  59.75 
 
 
490 aa  585  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0289  catalase  59.75 
 
 
490 aa  587  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.745578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0365  Catalase  58.93 
 
 
490 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357048  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  58.11 
 
 
479 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1242  Catalase  59 
 
 
480 aa  578  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122794 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2262  catalase-like  58.77 
 
 
477 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5439  Catalase  60.08 
 
 
485 aa  577  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2441  catalase  58.32 
 
 
481 aa  578  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  58.53 
 
 
479 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  57.89 
 
 
479 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2662  catalase  59.31 
 
 
486 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0215  catalase  58.9 
 
 
483 aa  574  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  57.72 
 
 
479 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21110  catalase  59.07 
 
 
487 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.218837 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001311  catalase  58.28 
 
 
479 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4001  catalase  57.08 
 
 
487 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1999  catalase  60.04 
 
 
514 aa  569  1e-161  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.209766  normal  0.601662 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05192  catalase  58.26 
 
 
478 aa  570  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1801  Catalase  58.07 
 
 
496 aa  565  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1494  Catalase  58.77 
 
 
485 aa  567  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0618429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0269  catalase  59.62 
 
 
504 aa  566  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146052  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  57.81 
 
 
484 aa  566  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0518  Catalase  56.07 
 
 
483 aa  566  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.309279  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1721  catalase  57.77 
 
 
487 aa  566  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1932  catalase  57.41 
 
 
488 aa  566  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1165  Catalase  59.07 
 
 
547 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1323  catalase  58.07 
 
 
478 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4268  catalase  57.88 
 
 
483 aa  564  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338278  normal  0.901094 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3018  catalase  57.95 
 
 
485 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1759  Catalase  58.86 
 
 
483 aa  561  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191846  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1958  catalase  58.65 
 
 
483 aa  560  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0656  catalase  58.77 
 
 
506 aa  561  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2941  catalase  57.73 
 
 
488 aa  559  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3029  catalase  56.49 
 
 
486 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0945  catalase  56.49 
 
 
486 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0885996  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3940  catalase  56.47 
 
 
493 aa  556  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109711  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0908  catalase domain-containing protein  56.29 
 
 
486 aa  555  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161902  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1070  catalase  55.88 
 
 
486 aa  554  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2706  Catalase  56.91 
 
 
499 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5599  catalase  57.23 
 
 
481 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.555062  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3190  catalase  55.46 
 
 
486 aa  549  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0631825  normal  0.81248 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3468  catalase  55.58 
 
 
491 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.482946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3392  Catalase  54.96 
 
 
491 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0894  catalase  55.17 
 
 
491 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3591  catalase  55.37 
 
 
491 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0563  catalase  55.11 
 
 
486 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0128  Catalase  54.44 
 
 
517 aa  544  1e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0638  catalase  55.09 
 
 
487 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4417  Catalase  55.65 
 
 
490 aa  540  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0279064  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1574  hypothetical protein  55.41 
 
 
501 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0310454 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3881  catalase  54.03 
 
 
480 aa  537  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000327701  hitchhiker  0.000000338063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5844  Catalase  54.89 
 
 
493 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453783  normal  0.956183 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1147  catalase  54.91 
 
 
479 aa  532  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11065  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  55.3 
 
 
504 aa  532  1e-150  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1622  Catalase  55.86 
 
 
500 aa  530  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468937  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0903  catalase  52.32 
 
 
504 aa  523  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0236  catalase  55 
 
 
482 aa  518  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  53.85 
 
 
505 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22460  catalase  52.69 
 
 
499 aa  511  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1422  catalase  52.92 
 
 
505 aa  514  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000148509  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1395  catalase  52.92 
 
 
505 aa  514  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000176487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0517  Catalase  52.6 
 
 
483 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2782  Catalase  54.11 
 
 
494 aa  505  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0778  Catalase  53.32 
 
 
507 aa  505  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3078  catalase  52.42 
 
 
499 aa  502  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20430  catalase  53.59 
 
 
499 aa  490  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.678559  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3238  Catalase  51.19 
 
 
510 aa  489  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.067006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1649  catalase  54.24 
 
 
555 aa  491  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0672008  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00522  catalase  51.67 
 
 
491 aa  489  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1308  catalase  53.26 
 
 
480 aa  485  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1629  Catalase  50.61 
 
 
508 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.303359  normal  0.0939595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>