More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1422 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2662  catalase  64.33 
 
 		 486 aa  637    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0903  catalase  87.9 
 
 		 504 aa  946    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1759  Catalase  63.96 
 
 		 483 aa  651    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2441  catalase  65.98 
 
 		 481 aa  681    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431026  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05192  catalase  65.08 
 
 		 478 aa  658    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1801  Catalase  63.27 
 
 		 496 aa  651    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1422  catalase  100 
 
 		 505 aa  1058    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000148509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4417  Catalase  63.87 
 
 		 490 aa  654    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0279064  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4001  catalase  67.08 
 
 		 487 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1958  catalase  63.69 
 
 		 483 aa  652    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3881  catalase  62.78 
 
 		 480 aa  643    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000327701  hitchhiker  0.000000338063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21110  catalase  67.36 
 
 		 487 aa  684    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218837 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1494  Catalase  63.69 
 
 		 485 aa  653    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0618429  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1574  hypothetical protein  63.93 
 
 		 501 aa  664    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0310454 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1165  Catalase  64.51 
 
 		 547 aa  652    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0656  catalase  66.4 
 
 		 506 aa  679    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2262  catalase-like  63.96 
 
 		 477 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1395  catalase  100 
 
 		 505 aa  1058    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000176487  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1323  catalase  67.35 
 
 		 478 aa  672    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0864  catalase  62.58 
 
 		 482 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1147  catalase  63.77 
 
 		 479 aa  637    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11065  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0269  catalase  68.04 
 
 		 504 aa  690    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146052  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5439  Catalase  66.11 
 
 		 485 aa  663    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001311  catalase  65.98 
 
 		 479 aa  663    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1999  catalase  66.32 
 
 		 514 aa  669    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.209766  normal  0.601662 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5599  catalase  64.78 
 
 		 481 aa  659    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.555062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0215  catalase  64.81 
 
 		 483 aa  663    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4268  catalase  64.86 
 
 		 483 aa  666    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338278  normal  0.901094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09150  catalase  61.96 
 
 		 482 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.789625 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2855  catalase  62.96 
 
 		 479 aa  634    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2706  Catalase  68.6 
 
 		 499 aa  706    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1721  catalase  65.31 
 
 		 487 aa  675    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1932  catalase  65.72 
 
 		 488 aa  682    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0518  Catalase  66.05 
 
 		 483 aa  673    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.309279  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3018  catalase  66.74 
 
 		 485 aa  685    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1242  Catalase  64.26 
 
 		 480 aa  667    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122794 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2776  catalase  62.96 
 
 		 479 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1320  catalase  62.76 
 
 		 479 aa  632  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0128  Catalase  60.69 
 
 		 517 aa  628  1e-179  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3278  catalase  62.94 
 
 		 478 aa  627  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0546  Catalase  60.08 
 
 		 574 aa  620  1e-176  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  59.22 
 
 		 485 aa  607  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2521  catalase  59.71 
 
 		 484 aa  599  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.723936 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  58.02 
 
 		 479 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  56.97 
 
 		 484 aa  592  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  58.02 
 
 		 479 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  57.61 
 
 		 479 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  57.61 
 
 		 479 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0712  Catalase  58.13 
 
 		 484 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  57.58 
 
 		 481 aa  586  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3986  catalase  58.33 
 
 		 484 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  57.46 
 
 		 498 aa  580  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2465  Catalase  58.3 
 
 		 485 aa  568  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.864013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5844  Catalase  55.29 
 
 		 493 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453783  normal  0.956183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2489  catalase  54.49 
 
 		 484 aa  556  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.350666  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0830  catalase  56.21 
 
 		 480 aa  557  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0365  Catalase  53.28 
 
 		 490 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357048  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0355  catalase  54.58 
 
 		 499 aa  535  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.692778  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0322  catalase  54.66 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0289  catalase  53.07 
 
 		 490 aa  535  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.745578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0333  Catalase  52.66 
 
 		 490 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3054  catalase  53.52 
 
 		 499 aa  527  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1421  catalase  51.98 
 
 		 488 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.898508  normal  0.0406547 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0273  catalase  55.17 
 
 		 474 aa  517  1.0000000000000001e-145  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3940  catalase  52.02 
 
 		 493 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109711  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2779  catalase  51.98 
 
 		 488 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0638  catalase  51.12 
 
 		 487 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2321  catalase  52.92 
 
 		 501 aa  514  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1057  catalase  53.65 
 
 		 480 aa  510  1e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.852537  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1576  catalase  53.32 
 
 		 474 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.278462  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0265  catalase  53.32 
 
 		 474 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  51.42 
 
 		 504 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1387  catalase  53.32 
 
 		 474 aa  508  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000679986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3392  Catalase  50.2 
 
 		 491 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3029  catalase  50.3 
 
 		 486 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0945  catalase  50.3 
 
 		 486 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0885996  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0908  catalase domain-containing protein  49.9 
 
 		 486 aa  503  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0894  catalase  49.5 
 
 		 491 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1070  catalase  49.9 
 
 		 486 aa  501  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3591  catalase  49.5 
 
 		 491 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3190  catalase  50 
 
 		 486 aa  498  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0631825  normal  0.81248 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0383  catalase  52.18 
 
 		 494 aa  500  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3468  catalase  49.3 
 
 		 491 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.482946  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0563  catalase  50.82 
 
 		 486 aa  498  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  51.74 
 
 		 505 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0481  catalase  49.8 
 
 		 498 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2941  catalase  49.59 
 
 		 488 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0778  Catalase  50.62 
 
 		 507 aa  488  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5463  Catalase  48.12 
 
 		 481 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00522  catalase  49.38 
 
 		 491 aa  478  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20430  catalase  50.84 
 
 		 499 aa  468  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.678559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1649  catalase  48.95 
 
 		 555 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0672008  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1236  Catalase  50 
 
 		 483 aa  462  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0619868  normal  0.69126 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0803  catalase  48.07 
 
 		 487 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0517  Catalase  47.52 
 
 		 483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0342  Catalase  53.32 
 
 		 556 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2094  catalase  48.64 
 
 		 482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.615987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3637  Catalase  47.37 
 
 		 493 aa  450  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155654  decreased coverage  0.00459164 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1308  catalase  50 
 
 		 480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3730  catalase  48.74 
 
 		 506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>