More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2125 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5497  Catalase  78.91 
 
 		 552 aa  908    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2940  catalase  57.95 
 
 		 546 aa  637    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2914  catalase  57.58 
 
 		 546 aa  635    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2865  catalase  57.95 
 
 		 546 aa  640    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2125  Catalase  100 
 
 		 555 aa  1154    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3164  catalase  57.95 
 
 		 546 aa  637    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3172  catalase  57.95 
 
 		 546 aa  637    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0020  Catalase  77.17 
 
 		 552 aa  898    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0935072 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2728  catalase  65.72 
 
 		 543 aa  664    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101027  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0865  Catalase  77.44 
 
 		 551 aa  865    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3182  catalase  57.95 
 
 		 546 aa  640    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2900  Catalase  66.67 
 
 		 550 aa  665    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  77.27 
 
 		 554 aa  902    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3405  Catalase  59.77 
 
 		 529 aa  625  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  60.2 
 
 		 529 aa  624  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3210  catalase  60.67 
 
 		 530 aa  624  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0632  catalase  60.47 
 
 		 529 aa  622  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172483  normal  0.22011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3534  Catalase  60.67 
 
 		 530 aa  624  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  60.78 
 
 		 529 aa  620  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  49.2 
 
 		 488 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  49.2 
 
 		 488 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  49.2 
 
 		 488 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  49.2 
 
 		 488 aa  483  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  49.2 
 
 		 488 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  49.2 
 
 		 488 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0874  catalase  49.59 
 
 		 488 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000610076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4132  catalase  49.2 
 
 		 488 aa  479  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000220587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1209  catalase  49 
 
 		 488 aa  478  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00159652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  49.8 
 
 		 488 aa  478  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  51.54 
 
 		 449 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0893  catalase  45.7 
 
 		 489 aa  425  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  45.88 
 
 		 509 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  45.69 
 
 		 517 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  45.15 
 
 		 504 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  44.95 
 
 		 479 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  47.08 
 
 		 509 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  44.95 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  46.41 
 
 		 516 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  44.47 
 
 		 505 aa  411  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  46.41 
 
 		 511 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  46.22 
 
 		 511 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  46.41 
 
 		 511 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  46.41 
 
 		 505 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  44.6 
 
 		 484 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  44.74 
 
 		 479 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06580  catalase  43.23 
 
 		 504 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  44.33 
 
 		 479 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  44.76 
 
 		 511 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  44.76 
 
 		 511 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  43.18 
 
 		 506 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  44.76 
 
 		 511 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  43.63 
 
 		 507 aa  403  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  44.67 
 
 		 510 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  42.97 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  42.54 
 
 		 527 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  43.85 
 
 		 510 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  43.51 
 
 		 481 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0289  catalase  43.84 
 
 		 490 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.745578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  44.04 
 
 		 511 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  44.35 
 
 		 515 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1188  catalase  41.33 
 
 		 567 aa  393  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0778  Catalase  42.37 
 
 		 507 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  44.17 
 
 		 498 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  43.8 
 
 		 507 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0365  Catalase  43.24 
 
 		 490 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  42.6 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0333  Catalase  43.23 
 
 		 490 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  43.19 
 
 		 512 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  42.36 
 
 		 503 aa  389  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  42.02 
 
 		 504 aa  388  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0466  catalase precursor  50.6 
 
 		 562 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0864  catalase  42.13 
 
 		 482 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1662  Catalase  42.1 
 
 		 705 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.768308 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4123  catalase  41.54 
 
 		 705 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5248  catalase  42.44 
 
 		 735 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.405546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5599  catalase  43.27 
 
 		 481 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.555062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21110  catalase  43.95 
 
 		 487 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09150  catalase  42.13 
 
 		 482 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.789625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1721  catalase  42.91 
 
 		 487 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2441  catalase  41.92 
 
 		 481 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431026  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  42.39 
 
 		 513 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2465  Catalase  42.89 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.864013 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0721  catalase  41.73 
 
 		 705 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3986  catalase  41.89 
 
 		 484 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0617  catalase  41.62 
 
 		 710 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1107  catalase  42.36 
 
 		 536 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  42.39 
 
 		 513 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001311  catalase  42.98 
 
 		 479 aa  379  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  42.97 
 
 		 695 aa  375  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3190  catalase  40.4 
 
 		 486 aa  376  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0631825  normal  0.81248 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02109  catalase  43.86 
 
 		 701 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.75009  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0377  catalase  41.57 
 
 		 510 aa  378  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000005607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2380  catalase  42.34 
 
 		 710 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00903929  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  39.85 
 
 		 675 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3881  catalase  41.6 
 
 		 480 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000327701  hitchhiker  0.000000338063 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1465  Catalase  41.5 
 
 		 704 aa  379  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12821  normal  0.432634 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1057  catalase  43.62 
 
 		 480 aa  378  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.852537  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1932  catalase  41.7 
 
 		 488 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1242  Catalase  43.42 
 
 		 480 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122794 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3018  catalase  42.48 
 
 		 485 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>