More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5253 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02830  catalase  78.11 
 
 
507 aa  842    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  65.21 
 
 
511 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  71.13 
 
 
509 aa  724    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  80.37 
 
 
510 aa  824    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  100 
 
 
513 aa  1058    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  65.41 
 
 
516 aa  677    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  65.41 
 
 
511 aa  679    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  79.17 
 
 
510 aa  836    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  65.41 
 
 
511 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  81.01 
 
 
512 aa  846    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  63.08 
 
 
504 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  66.4 
 
 
509 aa  694    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  65.41 
 
 
505 aa  676    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  62.91 
 
 
517 aa  660    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  97.66 
 
 
513 aa  1010    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1188  catalase  63.49 
 
 
567 aa  646    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  79.6 
 
 
515 aa  845    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  88.69 
 
 
513 aa  952    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  80.12 
 
 
507 aa  847    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  61.29 
 
 
506 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  61.29 
 
 
506 aa  628  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  60.94 
 
 
511 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  62.01 
 
 
503 aa  627  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  60.94 
 
 
511 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  60.94 
 
 
511 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  61.49 
 
 
527 aa  623  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06580  catalase  61.66 
 
 
504 aa  622  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  59.96 
 
 
511 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1107  catalase  58.19 
 
 
536 aa  598  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610456  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0466  catalase precursor  73.06 
 
 
562 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0377  catalase  55.51 
 
 
510 aa  559  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000005607  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  52.22 
 
 
488 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  52.22 
 
 
488 aa  512  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  52.22 
 
 
488 aa  512  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  52.22 
 
 
488 aa  512  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  52.22 
 
 
488 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  52.22 
 
 
488 aa  512  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0874  catalase  51.37 
 
 
488 aa  513  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000610076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1209  catalase  51.8 
 
 
488 aa  511  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00159652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4132  catalase  51.59 
 
 
488 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000220587  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  51.59 
 
 
488 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  54.21 
 
 
449 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2728  catalase  48.28 
 
 
543 aa  456  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2900  Catalase  47.11 
 
 
550 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478184  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3534  Catalase  45.69 
 
 
530 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3210  catalase  45.69 
 
 
530 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161662  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  45.4 
 
 
479 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  45.61 
 
 
479 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  45.69 
 
 
529 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0632  catalase  45.69 
 
 
529 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172483  normal  0.22011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3405  Catalase  45.58 
 
 
529 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3172  catalase  45.25 
 
 
546 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  45.19 
 
 
479 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2940  catalase  45.25 
 
 
546 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2865  catalase  45.04 
 
 
546 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0778  Catalase  45.34 
 
 
507 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3164  catalase  45.25 
 
 
546 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  45.49 
 
 
529 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2914  catalase  45.04 
 
 
546 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  45.7 
 
 
481 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3182  catalase  44.83 
 
 
546 aa  415  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  44.44 
 
 
484 aa  411  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  44.98 
 
 
479 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3940  catalase  43.88 
 
 
493 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109711  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  44.26 
 
 
505 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0273  catalase  45.32 
 
 
474 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1932  catalase  43.3 
 
 
488 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1576  catalase  43.83 
 
 
474 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.278462  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0265  catalase  43.83 
 
 
474 aa  393  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1574  hypothetical protein  41.96 
 
 
501 aa  394  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0310454 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1387  catalase  43.83 
 
 
474 aa  393  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000679986  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0638  catalase  42.54 
 
 
487 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  43.29 
 
 
504 aa  390  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1721  catalase  43.72 
 
 
487 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3468  catalase  43 
 
 
491 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.482946  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0894  catalase  43 
 
 
491 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3591  catalase  43 
 
 
491 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3392  Catalase  42.8 
 
 
491 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21110  catalase  42.86 
 
 
487 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.218837 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0563  catalase  42.25 
 
 
486 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2941  catalase  44.77 
 
 
488 aa  388  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3018  catalase  43.4 
 
 
485 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2441  catalase  43.04 
 
 
481 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431026  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1070  catalase  42.8 
 
 
486 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  41.79 
 
 
498 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0893  catalase  42.06 
 
 
489 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3637  Catalase  42.91 
 
 
493 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155654  decreased coverage  0.00459164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3190  catalase  42.56 
 
 
486 aa  382  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0631825  normal  0.81248 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3881  catalase  41.28 
 
 
480 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000327701  hitchhiker  0.000000338063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  42.05 
 
 
485 aa  382  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001311  catalase  42.44 
 
 
479 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3029  catalase  42.39 
 
 
486 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0945  catalase  42.39 
 
 
486 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0885996  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  42.34 
 
 
554 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0864  catalase  40.5 
 
 
482 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1242  Catalase  42.08 
 
 
480 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2125  Catalase  42.39 
 
 
555 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00522  catalase  41.12 
 
 
491 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5439  Catalase  44.09 
 
 
485 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0908  catalase domain-containing protein  42.2 
 
 
486 aa  379  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161902  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>