More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3210 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5497  Catalase  63.47 
 
 		 552 aa  642    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2900  Catalase  67.22 
 
 		 550 aa  677    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0632  catalase  96.42 
 
 		 529 aa  1064    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172483  normal  0.22011 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2940  catalase  62.62 
 
 		 546 aa  665    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2914  catalase  62.24 
 
 		 546 aa  660    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2865  catalase  62.05 
 
 		 546 aa  658    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3164  catalase  62.62 
 
 		 546 aa  665    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3210  catalase  100 
 
 		 530 aa  1106    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  92.08 
 
 		 529 aa  1019    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2728  catalase  68.58 
 
 		 543 aa  686    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101027  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3405  Catalase  94.72 
 
 		 529 aa  1044    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3534  Catalase  100 
 
 		 530 aa  1106    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  91.51 
 
 		 529 aa  1009    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  62.95 
 
 		 554 aa  646    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3182  catalase  62.05 
 
 		 546 aa  659    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3172  catalase  62.05 
 
 		 546 aa  657    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0865  Catalase  62.38 
 
 		 551 aa  627  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0020  Catalase  61.28 
 
 		 552 aa  618  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0935072 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2125  Catalase  60.67 
 
 		 555 aa  611  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0874  catalase  53.5 
 
 		 488 aa  513  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000610076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  53.09 
 
 		 488 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  53.09 
 
 		 488 aa  514  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  53.09 
 
 		 488 aa  514  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  53.09 
 
 		 488 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  53.09 
 
 		 488 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  53.09 
 
 		 488 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  52.46 
 
 		 488 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1209  catalase  52.67 
 
 		 488 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00159652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4132  catalase  52.67 
 
 		 488 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000220587  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  54.19 
 
 		 449 aa  487  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  47.6 
 
 		 511 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  47.6 
 
 		 516 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  47.6 
 
 		 511 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  47.6 
 
 		 511 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  47.6 
 
 		 505 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  47.67 
 
 		 509 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  44.94 
 
 		 485 aa  434  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  45.84 
 
 		 509 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  46.59 
 
 		 505 aa  431  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  46.49 
 
 		 512 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0893  catalase  47.07 
 
 		 489 aa  430  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  46.41 
 
 		 504 aa  431  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  47.38 
 
 		 510 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  45.36 
 
 		 504 aa  428  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  44.35 
 
 		 479 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4342  catalase  44.12 
 
 		 695 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.631099  normal  0.0151111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  46.54 
 
 		 510 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3940  catalase  45.29 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109711  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0289  catalase  45.53 
 
 		 490 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.745578 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1188  catalase  45.97 
 
 		 567 aa  424  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  44.15 
 
 		 479 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  44.53 
 
 		 506 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  44.18 
 
 		 484 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  46.65 
 
 		 507 aa  419  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  46.14 
 
 		 513 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0365  Catalase  44.93 
 
 		 490 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  46.14 
 
 		 513 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  44.53 
 
 		 506 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  44.44 
 
 		 527 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  45.89 
 
 		 513 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3591  catalase  44.72 
 
 		 491 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2662  Catalase  47.46 
 
 		 702 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02109  catalase  46.46 
 
 		 701 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.75009  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0721  catalase  46.09 
 
 		 705 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  43.88 
 
 		 479 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  47.08 
 
 		 517 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3310  catalase  47.46 
 
 		 702 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0333  Catalase  45.13 
 
 		 490 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  45.73 
 
 		 515 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05192  catalase  45.9 
 
 		 478 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  44.17 
 
 		 481 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1662  Catalase  44.9 
 
 		 705 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.768308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  43.53 
 
 		 479 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  44.22 
 
 		 503 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3392  Catalase  44.72 
 
 		 491 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3468  catalase  44.81 
 
 		 491 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.482946  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1465  Catalase  44.51 
 
 		 704 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12821  normal  0.432634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0894  catalase  44.81 
 
 		 491 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1070  catalase  44.4 
 
 		 486 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  44.75 
 
 		 695 aa  411  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3625  catalase  45.06 
 
 		 705 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0284483 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0617  catalase  45.09 
 
 		 710 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3190  catalase  44.17 
 
 		 486 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0631825  normal  0.81248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2010  Catalase  44.76 
 
 		 808 aa  412  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4123  catalase  45.56 
 
 		 705 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1107  catalase  43.64 
 
 		 536 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610456  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3029  catalase  44.4 
 
 		 486 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001311  catalase  45.7 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06580  catalase  45.21 
 
 		 504 aa  412  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1721  catalase  45.88 
 
 		 487 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1830  catalase  44.36 
 
 		 848 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.262631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0712  Catalase  44.08 
 
 		 484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3597  Catalase  44.71 
 
 		 694 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5492  Catalase  45.13 
 
 		 690 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217923  normal  0.0437244 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  44.16 
 
 		 675 aa  408  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0590  catalase  42.96 
 
 		 794 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0945  catalase  44.2 
 
 		 486 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0885996  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1180  Catalase  45.97 
 
 		 704 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.467187  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0908  catalase domain-containing protein  43.9 
 
 		 486 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2941  catalase  45.42 
 
 		 488 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0358189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>