More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0973 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  63.17 
 
 
509 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  63.1 
 
 
511 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  68.93 
 
 
509 aa  698    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  78.66 
 
 
510 aa  822    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  62.9 
 
 
516 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  62.9 
 
 
505 aa  651    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  79.05 
 
 
510 aa  824    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  62.9 
 
 
511 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  76.29 
 
 
512 aa  813    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  78.46 
 
 
507 aa  817    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  78.61 
 
 
513 aa  828    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  81.86 
 
 
513 aa  840    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  62.9 
 
 
511 aa  653    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  63.21 
 
 
517 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  100 
 
 
515 aa  1065    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  81.72 
 
 
513 aa  842    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  79.5 
 
 
507 aa  809    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1188  catalase  62.5 
 
 
567 aa  627  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  61.92 
 
 
504 aa  622  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  62.5 
 
 
506 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  62.5 
 
 
506 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06580  catalase  59.64 
 
 
504 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  61.18 
 
 
527 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  59.77 
 
 
511 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  60.64 
 
 
503 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  59.77 
 
 
511 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  59.77 
 
 
511 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  58.83 
 
 
511 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1107  catalase  57.23 
 
 
536 aa  590  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610456  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0466  catalase precursor  70.47 
 
 
562 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0377  catalase  58.46 
 
 
510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000005607  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0874  catalase  52.5 
 
 
488 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000610076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  52.62 
 
 
488 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  52.62 
 
 
488 aa  513  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  52.62 
 
 
488 aa  513  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  52.62 
 
 
488 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  52.62 
 
 
488 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  52.41 
 
 
488 aa  512  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4132  catalase  51.99 
 
 
488 aa  509  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000220587  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  52.41 
 
 
488 aa  510  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1209  catalase  51.99 
 
 
488 aa  509  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00159652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  54.55 
 
 
449 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2900  Catalase  48.88 
 
 
550 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478184  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2728  catalase  49 
 
 
543 aa  464  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2940  catalase  44.49 
 
 
546 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0778  Catalase  45.76 
 
 
507 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2865  catalase  44.49 
 
 
546 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3164  catalase  44.49 
 
 
546 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3182  catalase  44.56 
 
 
546 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3172  catalase  44.7 
 
 
546 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  46.14 
 
 
529 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2914  catalase  44.28 
 
 
546 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  45.49 
 
 
481 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0632  catalase  46.34 
 
 
529 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172483  normal  0.22011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3405  Catalase  46.15 
 
 
529 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3210  catalase  45.73 
 
 
530 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161662  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3534  Catalase  45.73 
 
 
530 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  45.2 
 
 
479 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  46.14 
 
 
529 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3940  catalase  45.7 
 
 
493 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109711  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  44.78 
 
 
479 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  45.88 
 
 
505 aa  411  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  43.54 
 
 
484 aa  412  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  44.37 
 
 
479 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  42.48 
 
 
498 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0563  catalase  44.12 
 
 
486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3591  catalase  44.79 
 
 
491 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1932  catalase  43.96 
 
 
488 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2941  catalase  44.38 
 
 
488 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1070  catalase  44.65 
 
 
486 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0638  catalase  43.6 
 
 
487 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21110  catalase  43.62 
 
 
487 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.218837 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1574  hypothetical protein  42.68 
 
 
501 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0310454 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3392  Catalase  43.96 
 
 
491 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0894  catalase  43.96 
 
 
491 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3029  catalase  43.96 
 
 
486 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0945  catalase  43.96 
 
 
486 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0885996  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3468  catalase  43.75 
 
 
491 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.482946  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0908  catalase domain-containing protein  43.75 
 
 
486 aa  396  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161902  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  44.14 
 
 
479 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3190  catalase  44.14 
 
 
486 aa  398  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0631825  normal  0.81248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5497  Catalase  42.4 
 
 
552 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  44.42 
 
 
504 aa  394  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1721  catalase  44.18 
 
 
487 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1057  catalase  50.26 
 
 
480 aa  394  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.852537  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3018  catalase  43.01 
 
 
485 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1576  catalase  44.06 
 
 
474 aa  391  1e-107  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.278462  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05192  catalase  42.32 
 
 
478 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0265  catalase  44.06 
 
 
474 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  40.99 
 
 
485 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1242  Catalase  43.04 
 
 
480 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122794 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3881  catalase  41.91 
 
 
480 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000327701  hitchhiker  0.000000338063 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001311  catalase  42.89 
 
 
479 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1387  catalase  44.06 
 
 
474 aa  391  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000679986  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2441  catalase  42.06 
 
 
481 aa  385  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431026  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0893  catalase  42.62 
 
 
489 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2125  Catalase  44.35 
 
 
555 aa  388  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0273  catalase  43.52 
 
 
474 aa  388  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4417  Catalase  43.69 
 
 
490 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0279064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  43.75 
 
 
554 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>