More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0190 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  63.53 
 
 
506 aa  658    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1188  catalase  61.8 
 
 
567 aa  643    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  79.06 
 
 
509 aa  814    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  61.77 
 
 
503 aa  649    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  61.3 
 
 
510 aa  638    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  99.6 
 
 
511 aa  1031    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  100 
 
 
516 aa  1037    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  61.54 
 
 
527 aa  646    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  61.69 
 
 
510 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  61.9 
 
 
511 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  99.6 
 
 
511 aa  1032    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  100 
 
 
511 aa  1035    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  64.67 
 
 
507 aa  640    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  66.26 
 
 
512 aa  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06580  catalase  63.51 
 
 
504 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  66.26 
 
 
513 aa  668    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0466  catalase precursor  98.98 
 
 
562 aa  815    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  100 
 
 
505 aa  1035    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  78.76 
 
 
509 aa  822    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  66 
 
 
517 aa  671    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  61.9 
 
 
511 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  61.68 
 
 
504 aa  647    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  66.53 
 
 
513 aa  673    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  64.41 
 
 
513 aa  669    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  61.9 
 
 
511 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  63.33 
 
 
506 aa  657    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  62.9 
 
 
515 aa  650    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  63.29 
 
 
507 aa  650    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  61.31 
 
 
511 aa  627  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0377  catalase  59.92 
 
 
510 aa  624  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000005607  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0874  catalase  58.99 
 
 
488 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000610076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  59.41 
 
 
488 aa  578  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1107  catalase  56.56 
 
 
536 aa  580  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  59.41 
 
 
488 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  59.41 
 
 
488 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  59.41 
 
 
488 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  59.41 
 
 
488 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  59.41 
 
 
488 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1209  catalase  59.2 
 
 
488 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00159652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  59.2 
 
 
488 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4132  catalase  58.77 
 
 
488 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000220587  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  61 
 
 
449 aa  560  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2728  catalase  53.07 
 
 
543 aa  496  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2900  Catalase  51.77 
 
 
550 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478184  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0778  Catalase  49.28 
 
 
507 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0893  catalase  47.89 
 
 
489 aa  448  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  48.86 
 
 
481 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3405  Catalase  47.9 
 
 
529 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3210  catalase  48 
 
 
530 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161662  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  48.33 
 
 
479 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3534  Catalase  48 
 
 
530 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  47.4 
 
 
479 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  47.61 
 
 
479 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  48.88 
 
 
529 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0632  catalase  48.28 
 
 
529 aa  438  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172483  normal  0.22011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  46.96 
 
 
479 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  48.47 
 
 
505 aa  437  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  48.07 
 
 
529 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  47.64 
 
 
484 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  47.66 
 
 
504 aa  434  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3940  catalase  47.34 
 
 
493 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109711  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0563  catalase  48.02 
 
 
486 aa  433  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1070  catalase  48.02 
 
 
486 aa  431  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  46.61 
 
 
498 aa  430  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3392  Catalase  47.51 
 
 
491 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0894  catalase  47.61 
 
 
491 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3591  catalase  47.82 
 
 
491 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2865  catalase  46.17 
 
 
546 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0638  catalase  46.3 
 
 
487 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3468  catalase  47.4 
 
 
491 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.482946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3172  catalase  46.27 
 
 
546 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3182  catalase  46.17 
 
 
546 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0908  catalase domain-containing protein  47.61 
 
 
486 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161902  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3637  Catalase  46.64 
 
 
493 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155654  decreased coverage  0.00459164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3190  catalase  47.4 
 
 
486 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0631825  normal  0.81248 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2940  catalase  46.17 
 
 
546 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2914  catalase  45.96 
 
 
546 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3164  catalase  46.17 
 
 
546 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3029  catalase  47.19 
 
 
486 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0945  catalase  46.99 
 
 
486 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0885996  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3078  catalase  45.08 
 
 
499 aa  423  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2782  Catalase  46.04 
 
 
494 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  45.57 
 
 
485 aa  420  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2941  catalase  47.33 
 
 
488 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1574  hypothetical protein  44.31 
 
 
501 aa  410  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0310454 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001311  catalase  46.22 
 
 
479 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4342  catalase  46.41 
 
 
695 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.631099  normal  0.0151111 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4611  catalase  46.2 
 
 
710 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3018  catalase  45.82 
 
 
485 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2321  catalase  44.76 
 
 
501 aa  412  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2441  catalase  44.7 
 
 
481 aa  405  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431026  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0865  Catalase  48.38 
 
 
551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3597  Catalase  45.76 
 
 
694 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0128  Catalase  46.31 
 
 
517 aa  408  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2125  Catalase  46.61 
 
 
555 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  46.06 
 
 
554 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0590  catalase  45.7 
 
 
794 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05192  catalase  45.09 
 
 
478 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3881  catalase  44.49 
 
 
480 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000327701  hitchhiker  0.000000338063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21110  catalase  46.12 
 
 
487 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.218837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>