More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1581 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  77.18 
 
 		 511 aa  813    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  100 
 
 		 509 aa  1053    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  65.23 
 
 		 510 aa  690    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  77.58 
 
 		 516 aa  816    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  67.7 
 
 		 510 aa  686    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  77.58 
 
 		 511 aa  817    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06580  catalase  64.44 
 
 		 504 aa  650    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  66.47 
 
 		 512 aa  710    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  65.59 
 
 		 504 aa  669    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  64.81 
 
 		 517 aa  673    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  60.71 
 
 		 511 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  76.74 
 
 		 509 aa  822    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  63.49 
 
 		 511 aa  660    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  65.6 
 
 		 506 aa  672    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  71.13 
 
 		 513 aa  724    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  77.38 
 
 		 511 aa  816    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  67 
 
 		 513 aa  707    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1188  catalase  65.05 
 
 		 567 aa  660    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  67.67 
 
 		 515 aa  701    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  63.49 
 
 		 511 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  77.58 
 
 		 505 aa  816    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  64.13 
 
 		 527 aa  669    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  66.01 
 
 		 507 aa  692    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  70.93 
 
 		 513 aa  724    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0466  catalase precursor  82.19 
 
 		 562 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  63.49 
 
 		 511 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  65.05 
 
 		 503 aa  665    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  65.6 
 
 		 506 aa  672    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  69.15 
 
 		 507 aa  699    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0377  catalase  62.33 
 
 		 510 aa  632  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000005607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1107  catalase  56.97 
 
 		 536 aa  592  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  57.81 
 
 		 488 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  57.81 
 
 		 488 aa  569  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  57.81 
 
 		 488 aa  569  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  57.81 
 
 		 488 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  57.81 
 
 		 488 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1209  catalase  56.96 
 
 		 488 aa  565  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00159652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0874  catalase  56.24 
 
 		 488 aa  567  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000610076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  57.59 
 
 		 488 aa  568  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  57.59 
 
 		 488 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4132  catalase  56.75 
 
 		 488 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000220587  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  59.23 
 
 		 449 aa  555  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2728  catalase  50.49 
 
 		 543 aa  492  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2900  Catalase  51.45 
 
 		 550 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0778  Catalase  48.98 
 
 		 507 aa  471  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  46.41 
 
 		 481 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  46.61 
 
 		 479 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  45.97 
 
 		 479 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0893  catalase  47.35 
 
 		 489 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  45.76 
 
 		 479 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3405  Catalase  45.93 
 
 		 529 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  47.42 
 
 		 505 aa  433  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  45.55 
 
 		 484 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  44.96 
 
 		 479 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3534  Catalase  45.84 
 
 		 530 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2940  catalase  45.55 
 
 		 546 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  46.67 
 
 		 529 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2865  catalase  45.34 
 
 		 546 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3164  catalase  45.55 
 
 		 546 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3182  catalase  45.34 
 
 		 546 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3210  catalase  45.84 
 
 		 530 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3172  catalase  45.55 
 
 		 546 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0632  catalase  45.64 
 
 		 529 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172483  normal  0.22011 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2914  catalase  45.34 
 
 		 546 aa  426  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  45.95 
 
 		 529 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0638  catalase  44.19 
 
 		 487 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3940  catalase  45 
 
 		 493 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109711  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  45.45 
 
 		 498 aa  425  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  46.12 
 
 		 504 aa  422  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0563  catalase  45.3 
 
 		 486 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3637  Catalase  44.76 
 
 		 493 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155654  decreased coverage  0.00459164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  43.54 
 
 		 485 aa  415  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3078  catalase  45.05 
 
 		 499 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3018  catalase  44.38 
 
 		 485 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0894  catalase  43.12 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3392  Catalase  43.33 
 
 		 491 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1070  catalase  44.38 
 
 		 486 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3591  catalase  43.53 
 
 		 491 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2782  Catalase  45.8 
 
 		 494 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2941  catalase  44.74 
 
 		 488 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  44.4 
 
 		 554 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3190  catalase  43.54 
 
 		 486 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0631825  normal  0.81248 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3468  catalase  42.92 
 
 		 491 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.482946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1932  catalase  44.07 
 
 		 488 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1574  hypothetical protein  42.8 
 
 		 501 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0310454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2125  Catalase  45.88 
 
 		 555 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21110  catalase  44.09 
 
 		 487 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218837 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0830  catalase  44.73 
 
 		 480 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0908  catalase domain-containing protein  43.12 
 
 		 486 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3881  catalase  42.98 
 
 		 480 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000327701  hitchhiker  0.000000338063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5497  Catalase  44.11 
 
 		 552 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3029  catalase  42.92 
 
 		 486 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0945  catalase  42.92 
 
 		 486 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0885996  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22418  catalase  45.02 
 
 		 566 aa  402  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1721  catalase  44.3 
 
 		 487 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1057  catalase  44.65 
 
 		 480 aa  405  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.852537  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2521  catalase  44.51 
 
 		 484 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.723936 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2441  catalase  42.68 
 
 		 481 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431026  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1494  Catalase  43.42 
 
 		 485 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0618429  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3986  catalase  44.37 
 
 		 484 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>