More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6547 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  100 
 
 
329 aa  660    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  80 
 
 
330 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  70.19 
 
 
330 aa  454  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  69.71 
 
 
330 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  69.61 
 
 
330 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  69.66 
 
 
328 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  57.62 
 
 
326 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  54.24 
 
 
329 aa  358  8e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  57.28 
 
 
332 aa  346  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  46.95 
 
 
334 aa  265  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  45.07 
 
 
331 aa  264  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  45.25 
 
 
332 aa  245  8e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  41.06 
 
 
345 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  38.1 
 
 
357 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  38.99 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  39.36 
 
 
366 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  39.58 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  37.29 
 
 
353 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  38.51 
 
 
361 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  37.2 
 
 
363 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  36.9 
 
 
363 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  37.86 
 
 
361 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  37.86 
 
 
361 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  36.93 
 
 
372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  36.47 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  36.97 
 
 
363 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  38.89 
 
 
364 aa  172  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  37.79 
 
 
364 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  37.58 
 
 
363 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  38.71 
 
 
353 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  35.76 
 
 
361 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  32.63 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  35.29 
 
 
353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  35.92 
 
 
335 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  36.25 
 
 
353 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  37.21 
 
 
368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  36.48 
 
 
361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  35.01 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  36.48 
 
 
361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  36.81 
 
 
361 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  35.22 
 
 
332 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  35.5 
 
 
350 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  35.5 
 
 
350 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  33.64 
 
 
367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  35.05 
 
 
351 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  35.05 
 
 
365 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  34.64 
 
 
350 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  32.63 
 
 
363 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  34.27 
 
 
338 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  32.19 
 
 
329 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  33 
 
 
361 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  35.64 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  30.75 
 
 
331 aa  139  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  28.86 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  28.49 
 
 
332 aa  106  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  27.83 
 
 
332 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  30.12 
 
 
330 aa  105  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  29.61 
 
 
335 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  29.31 
 
 
335 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  28.49 
 
 
335 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  28.83 
 
 
335 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  29.69 
 
 
332 aa  98.2  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2747  catalase  29.1 
 
 
458 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0967809  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  28.45 
 
 
335 aa  91.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  30.3 
 
 
510 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2820  catalase  29.43 
 
 
459 aa  89.7  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2220  catalase  27.18 
 
 
459 aa  89  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000397232 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  30.24 
 
 
516 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  30.24 
 
 
511 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  30.24 
 
 
511 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  30.24 
 
 
511 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  29.97 
 
 
510 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  30.24 
 
 
505 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  29.45 
 
 
509 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0466  catalase precursor  30.48 
 
 
562 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3059  catalase  28.09 
 
 
458 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.064434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3026  catalase  27.52 
 
 
459 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1215  hydroperoxidase II  29.9 
 
 
707 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25778  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3057  catalase  28.63 
 
 
458 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  30.61 
 
 
509 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2764  catalase  28.43 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3024  catalase  28.43 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5392  hydroperoxidase II  29.9 
 
 
710 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0123509 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08637  Catalase A (EC 1.11.1.6)(Spore-specific catalase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55305]  28.19 
 
 
744 aa  84  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139422  normal  0.87889 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2816  catalase  28.09 
 
 
459 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0110804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3030  catalase  28.09 
 
 
459 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  28.77 
 
 
488 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  28.96 
 
 
507 aa  83.2  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  28.77 
 
 
488 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  29.35 
 
 
449 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  28.77 
 
 
488 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  28.77 
 
 
488 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  28.77 
 
 
488 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  28.77 
 
 
488 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  30.27 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3563  catalase domain-containing protein  28.72 
 
 
724 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000309586  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  29.58 
 
 
529 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  28.38 
 
 
665 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  28.24 
 
 
724 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4438  catalase  28.38 
 
 
665 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.108601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>