297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4923 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  100 
 
 
330 aa  676    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  69.85 
 
 
335 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  69.85 
 
 
335 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  69.55 
 
 
335 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  68.96 
 
 
335 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  66.87 
 
 
335 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  68.1 
 
 
332 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  68.1 
 
 
332 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  66.87 
 
 
332 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  63.94 
 
 
332 aa  426  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771.2  catalase  65.81 
 
 
233 aa  318  7e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  36.77 
 
 
353 aa  179  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  35.34 
 
 
335 aa  172  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  31.8 
 
 
332 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  33.68 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  29.59 
 
 
365 aa  158  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  33.78 
 
 
350 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  34.04 
 
 
350 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  34.04 
 
 
350 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  30.47 
 
 
329 aa  150  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  31.58 
 
 
361 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  31.8 
 
 
351 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  31.8 
 
 
365 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  32.22 
 
 
348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  32.62 
 
 
362 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  31.91 
 
 
363 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  29.52 
 
 
331 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  32.49 
 
 
353 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  31.8 
 
 
361 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  31.8 
 
 
361 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  31.8 
 
 
361 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  31.21 
 
 
361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  31.21 
 
 
361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  31.45 
 
 
364 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  30.8 
 
 
361 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  31.21 
 
 
363 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  30.99 
 
 
361 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  30.85 
 
 
363 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  31.56 
 
 
363 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  34.38 
 
 
363 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  30.69 
 
 
353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  29.6 
 
 
353 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  29.08 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  31.8 
 
 
370 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  31.34 
 
 
372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  31.11 
 
 
334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  31.79 
 
 
330 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  31.1 
 
 
357 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  33.91 
 
 
330 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  32.04 
 
 
366 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  31.71 
 
 
370 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  33.91 
 
 
330 aa  122  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  31.21 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  28.98 
 
 
368 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  30.62 
 
 
326 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  29.01 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  28.77 
 
 
364 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  29.74 
 
 
329 aa  112  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  30.66 
 
 
332 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  30.56 
 
 
328 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  30.12 
 
 
329 aa  105  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  32.3 
 
 
330 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  27.21 
 
 
345 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  25.36 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1029  Catalase  24.66 
 
 
682 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  23.81 
 
 
488 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  23.81 
 
 
488 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  23.81 
 
 
488 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  23.81 
 
 
488 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  23.81 
 
 
488 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  23.81 
 
 
449 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  23.39 
 
 
488 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1209  catalase  23.39 
 
 
488 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00159652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3024  catalase  25.42 
 
 
459 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  23.47 
 
 
488 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  24.16 
 
 
515 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2764  catalase  25.08 
 
 
459 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114692  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  23.49 
 
 
517 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3057  catalase  25.33 
 
 
458 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2816  catalase  25.08 
 
 
459 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0110804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2747  catalase  25.08 
 
 
458 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0967809  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3030  catalase  25.08 
 
 
459 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1712  hydroperoxidase II  25.33 
 
 
752 aa  64.3  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.806465  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  24.08 
 
 
724 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4132  catalase  23.05 
 
 
488 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000220587  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2220  catalase  25 
 
 
459 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000397232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3059  catalase  24.75 
 
 
458 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.064434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0874  catalase  22.71 
 
 
488 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000610076  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  23.41 
 
 
509 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3115  hydroperoxidase II  24.41 
 
 
708 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283199  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2991  hydroperoxidase II  24.41 
 
 
708 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112637  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  25.82 
 
 
503 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0501  Catalase  24.25 
 
 
728 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1340  hydroperoxidase II  24.41 
 
 
708 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  23.43 
 
 
511 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3026  catalase  25.08 
 
 
459 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  23.43 
 
 
511 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  23.43 
 
 
505 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  23.43 
 
 
516 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  25 
 
 
506 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>