More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4645 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  100 
 
 		 361 aa  732    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  48.64 
 
 		 363 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  47.37 
 
 		 362 aa  324  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  42.94 
 
 		 348 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  44.79 
 
 		 364 aa  285  8e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  44.63 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  45.59 
 
 		 361 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  45.59 
 
 		 361 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  45.37 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  45.24 
 
 		 361 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  44.15 
 
 		 370 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  43.94 
 
 		 363 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  43.94 
 
 		 363 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  44.78 
 
 		 363 aa  279  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  44.16 
 
 		 361 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  41.28 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  43.53 
 
 		 361 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  43.53 
 
 		 361 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  43.84 
 
 		 350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  43.53 
 
 		 350 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  44.57 
 
 		 370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  41.69 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  43.61 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  44.44 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  42.2 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  40.34 
 
 		 368 aa  259  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  41.64 
 
 		 353 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  40.4 
 
 		 364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  45.11 
 
 		 353 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  43.99 
 
 		 353 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  39.63 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  39.63 
 
 		 351 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  40.53 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  37.94 
 
 		 335 aa  223  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  38.7 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  35.45 
 
 		 365 aa  212  7e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  35.86 
 
 		 338 aa  210  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  34.41 
 
 		 329 aa  206  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  32.01 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  32.44 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  34.74 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  33.1 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  34.74 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  31.58 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  32.56 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  33 
 
 		 329 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  28.12 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  31.95 
 
 		 329 aa  139  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  31.77 
 
 		 332 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  31.33 
 
 		 334 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  33.22 
 
 		 335 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  31.62 
 
 		 335 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  31.51 
 
 		 335 aa  136  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  32.12 
 
 		 330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  31.62 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  31.49 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  32.12 
 
 		 330 aa  133  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  32.64 
 
 		 332 aa  132  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  32.12 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  30.12 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  31.77 
 
 		 328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  29.9 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  28.62 
 
 		 507 aa  93.6  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  30.53 
 
 		 303 aa  94  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  29.02 
 
 		 517 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  27.55 
 
 		 512 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  27.69 
 
 		 510 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  26.42 
 
 		 511 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  26.93 
 
 		 515 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  26.48 
 
 		 511 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  27.08 
 
 		 510 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  26.48 
 
 		 511 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  26.48 
 
 		 511 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  27.38 
 
 		 507 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  27.7 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  28.03 
 
 		 513 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3637  Catalase  26.51 
 
 		 493 aa  79.7  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155654  decreased coverage  0.00459164 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0377  catalase  25.56 
 
 		 510 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000005607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  27.22 
 
 		 509 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  27.39 
 
 		 513 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  26.73 
 
 		 506 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  26.73 
 
 		 506 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22418  catalase  25.75 
 
 		 566 aa  77  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771.2  catalase  29.27 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  25.48 
 
 		 527 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  27.33 
 
 		 511 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  25.62 
 
 		 481 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1244  Catalase  24.92 
 
 		 487 aa  73.2  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  27.02 
 
 		 516 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  27.02 
 
 		 511 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  27.02 
 
 		 505 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  27.02 
 
 		 511 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  25.8 
 
 		 503 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  25.8 
 
 		 504 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  25 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20430  catalase  25.08 
 
 		 499 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.678559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06580  catalase  26.43 
 
 		 504 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0466  catalase precursor  26.54 
 
 		 562 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  25 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1649  catalase  24.84 
 
 		 555 aa  71.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0672008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>